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2026-2027 / MICR1718-1

Microbiologie clinique

Durée

20h Th, 6h Pr

Nombre de crédits

 Bachelier en sciences pharmaceutiques3 crédits 

Enseignant

Marie-Pierre Hayette

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue française

Organisation et évaluation

Enseignement au deuxième quadrimestre

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Ce cours a pour objectif d'apporter les connaissances fondamentales en microbiologie médicale. Il est centré sur les principales maladies infectieuses rencontrées en milieu communautaire, sélectionnées en fonction de leur fréquence et de leur intérêt pour la pratique pharmaceutique.

Les différentes infections seront abordées sous les angles suivants :

  • l'épidémiologie ;
  • les manifestations cliniques ;
  • le diagnostic microbiologique ;
  • le traitement ;
  • les mesures de prévention.
Remarque : Les infections virales ne sont pas abordées dans ce cours (voir le cours de virologie générale et médicale du Pr N. Jacobs).

Table des matières

  • Présentation du laboratoire de microbiologie
  • Flores commensales
  • Infections du tractus gastro-intestinal
  • Infections respiratoires hautes
  • Infections respiratoires basses aigues
  • Tuberculose
  • Infections du tractus urinaire
  • Infections sexuellement transmissibles
  • Infections fongiques
  • Paludisme
  • Infection mère-enfant : toxoplasmose
  • Maladie de Lyme et échinococcoses

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

Au terme du cours et des travaux pratiques, l'étudiant sera capable de :

  • décrire l'épidémiologie des principales maladies infectieuses rencontrées en communauté ;
  • expliquer les principaux moyens de prévention des maladies infectieuses ;
  • comprendre les stratégies thérapeutiques mises en œuvre dans leur prise en charge ;
  • connaître les principales techniques utilisées dans un laboratoire de microbiologie pour le diagnostic des maladies infectieuses.
Ce cours permettra :

  • au futur pharmacien d'officine d'assurer un rôle de conseil dans la prévention des infections et le suivi des traitements prescrits ;
  • au futur biologiste clinique d'acquérir les bases indispensables à sa formation spécialisée ;
  • au futur professionnel de l'industrie pharmaceutique ou de la recherche de disposer de solides connaissances en microbiologie médicale, facilitant son intégration dans le domaine des anti-infectieux ;
  • aux autres étudiants d'acquérir une culture générale en microbiologie médicale.

Savoirs et compétences prérequis

  • Biologie générale préparatoire aux sciences médicales (avec introduction à la génétique)
  • Immunologie générale
Ces enseignements constituent les bases indispensables à la compréhension du cours.

Co-requis

  • Virologie générale et médicale (Pr N. Jacobs)

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

L'enseignement comprend :

  • des cours magistraux ;
  • des podcasts;
  • des travaux pratiques (TP) obligatoires.
Les étudiants peuvent poser leurs questions à l'issue des cours ou par courrier électronique.

Les travaux pratiques comprennent trois séances de deux heures en présentiel.

Ils permettent de se familiariser avec notamment :

  • les principales techniques de diagnostic microbiologique ;
  • l'observation et l'identification des microorganismes ;
  • l'interprétation des principaux examens microbiologiques.
 
Présence

La présence aux travaux pratiques est obligatoire.

Toute absence doit être justifiée par un certificat médical.

Le port de la blouse est obligatoire. Les gants nécessaires aux manipulations biologiques sont fournis.

Évaluation des travaux pratiques

Les travaux pratiques sont évalués de deux manières :

  • une interrogation sous forme de QCM intégrée à l'examen théorique ;
  • un rapport de TP complété en ligne sur E-Campus.
Toute absence injustifiée aux travaux pratiques entraîne l'attribution d'une note d'absence (A) pour l'unité d'enseignement.

Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)

Combinaison d'activités d'apprentissage en présentiel et en distanciel


Informations complémentaires:

  • Cours magistraux en présentiel
  • Podcasts
  • Travaux pratiques en présentiel (présence obligatoire)
Le cours est coordonné par le Pr Marie-Pierre Hayette.

Les travaux pratiques sont organisés par groupes d'étudiants et encadrés par Mr Khalid El Moussaoui (Service de microbiologie clinique, CHU de Liège).

Le syllabus, les supports de cours et le manuel de travaux pratiques sont disponibles sur E-Campus.

Supports de cours, lectures obligatoires ou recommandées

Plate-forme(s) utilisée(s) pour les supports de cours :
- eCampus


Informations complémentaires:

Les diaporamas des cours ainsi que les notes de travaux pratiques disponibles sur E-Campus constituent les supports obligatoires.

Ouvrages de référence

  • Mims' Medical Microbiology (6e édition, Elsevier, 2018)
  • Introduction à la microbiologie (Tortora et al., 2e édition)
  • Brock Biology of Microorganisms (14e édition)
  • The Microbial Challenge (Krasner)
  • Microbiologie (Prescott, traduction française)
  • Infectiologie, Tome 3
Site recommandé :

Modalités d'évaluation et critères

Examen(s) en session

Toutes sessions confondues

- En présentiel

évaluation écrite ( QCM )

Travail à rendre - rapport


Informations complémentaires:

L'évaluation consiste en un examen écrit sous forme de QCM, organisé en session (mode de correction FOR GUESSING).

Les questions portent à la fois sur :

  • la matière théorique ;
  • les travaux pratiques.
Absences

  • une absence injustifiée à une séance de travaux pratiques entraîne une note de zéro pour le rapport de TP, soit une pénalité de 10 % de la note finale ;
  • une absence justifiée par certificat médical ne donne lieu à aucune pénalité. Dans certains cas (absence à toutes les séances de TP ) le rapport pourra être supprimé et la pondération adaptée.
  • un rapport non remis est assimilé à une absence injustifiée et une note de zéro.
Les notes des travaux pratiques ne sont reportables qu'au sein de la même année académique.

Stage(s)

Remarques organisationnelles et modifications principales apportées au cours

Les travaux pratiques sont coordonnés par Mr Khalid El Moussaoui (Assistant universitaire, Service de microbiologie clinique du CHU de Liège).

Leur participation est obligatoire.

L'accès aux laboratoires doit se faire OBLIGATOIREMENT AVEC PORT DE LA BLOUSE.

Les changements de groupe ne sont accordés qu'à titre exceptionnel, sous réserve des possibilités d'organisation et sur présentation d'un justificatif valable.

Contacts

Service de microbiologie clinique

Pr Marie-Pierre Hayette

CHU Sart Tilman
Route 656 - Tour 6, Niveau +2
Quartier Hôpital
Avenue Hippocrate 15
4000 Liège

Tél. : +32 (0)4 323 22 90

Secrétariat

Stéphanie Wauquier

Tél. : +32 (0)4 323 22 90

E-mail : micromed@uliege.be

Responsable du cours

Pr Marie-Pierre Hayette

E-mail : mphayette@uliege.be

Collaborateurs 

Dr Pablo Beckers, MD, Pablo.Beckers@chuliege.be

Dr Rosalie Sacheli, PhD, R.Sacheli@chuliege.be

Mme Sabrina Egrek, Sabrina.Egrek@chuliege.be

Responsable des travaux pratiques

Khalid El Moussaoui, kelmoussaoui@chuliege.be

Association d'un ou plusieurs MOOCs