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2026-2027 / NUTR1004-2

Advances II in GIT biology

Durée

20h Th, 10h AUTR

Nombre de crédits

 Master en sciences biomédicales, à finalité approfondie3 crédits 

Enseignant

Olivier Detry, Nathalie Esser, Pierre Foidart, Nicholas Gilbo, Guy Jerusalem, Edouard Louis, Marie-Alice Meuwis, Nicolas Paquot, Catherine Reenaers

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue anglaise

Organisation et évaluation

Enseignement au deuxième quadrimestre

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Ce cours compte 3 enseignants donnant chacun une partie du cours.

1. N. Gilbo :

Translational research in the field of liver preservation and transplantation.

This part will explain the principal models and techniques used in translational research in liver preservation and transplantation. It will first discuss the unmet clinical needs and gaps in knowledge regarding the pathophysiology of hepatic ischemia-reperfusion injury, with a particular focus on biliary tract preservation injury. Next, it will link these gaps to innovative animal models and models using human liver grafts declined for transplantation. It will then examine the biology of liver preservation and its evolution from static to dynamic preservation, including the mechanisms-still not fully understood-behind the protection offered by these newer preservation strategies and how to unravel them. Finally, it will cover frontier research in xenotransplantation and the emerging possibilities in translational research.

2. P. Foidart : Recherche translationnelle et biologie des cancers digestifs

Cette partie du cours introduit les principaux principes biologiques qui sous-tendent le développement, la classification et le traitement des cancers digestifs. Elle couvre :

  • les principales classes de traitements anticancéreux systémiques, notamment la chimiothérapie, les thérapies ciblées, les inhibiteurs des points de contrôle immunitaire (immune checkpoint inhibitors) et les conjugués anticorps-médicament (antibody-drug conjugates) ;
  • les caractéristiques fondamentales du cancer (« hallmarks of cancer ») et leur pertinence dans les tumeurs digestives ;
  • les principales caractéristiques épidémiologiques, anatomopathologiques et moléculaires des cancers de l'œsophage, de l'estomac, du système hépatobiliaire, du pancréas et du côlon-rectum ;
  • les principales voies de signalisation impliquées dans la carcinogenèse digestive ;
  • l'instabilité génomique et les bases biologiques des principaux syndromes héréditaires de prédisposition aux cancers gastro-intestinaux ;
  • la contribution des caractéristiques intrinsèques des cellules tumorales et du microenvironnement tumoral aux mécanismes de résistance thérapeutique, en prenant comme exemple représentatif l'adénocarcinome canalaire pancréatique ;
  • les principes fondamentaux de la radiobiologie et le rôle de la radiothérapie dans la prise en charge des cancers digestifs.
Le cours établit un lien entre les concepts fondamentaux de la biologie du cancer et leurs applications cliniques, notamment le profilage moléculaire des tumeurs, la stratification des patients, le choix des traitements et le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques.

3. M-A. Meuwis : Recherche translationnelle dans le contexte des maladies inflammatoires chroniques des intestins (MICI) 

Cette partie du cours concerne des notions de recherches translationnelles en générale et en particulier dans le contexte des maladies inflammatoires chroniques des intestins (MICI). L'état de l'art concernant les besoins cliniques non rencontrés pour les MICI sera présenté, avec certaines stratégies de recherches mises en lumière :

  • la recherche de biomarqueurs compagnons par de technique de type « omics » et comparaison aux biomarqueurs sanguins et fécaux de référence : CRP, F Calprotectine.
  • les biomarqueurs tissulaires potentiels et les nouvelles techniques de détection de ces marqueurs seront abordés et ce qu'ils pourraient apporter dans le suivi cliniques, la compréhension de la physiopathologie des MICI et ses complications.
  • le gold standard actuel pour le suivi et le diagnostic différentiel des MICI : endoscopie, histologie, microscopie confocale.
  • la surveillance du cancer colorectal dans les MICI (de la dysplasie à la tumeur)
  • la fibrose intestinale et l'absence de traitement efficace
Ces thèmes seront abordés avec des illustrations dans des modèles fonctionnels pertinents, et des échantillons provenant de cohorte de patients.

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

L'objectif de cet enseignement est de donner aux étudiants une vison de la recherche translationnelle dans les 3 domaines concernant les pathologies digestives au sens larges et la façon dans la recherche translationnelle peut-être menée dans le contexte actuel de l'état de l'art.

Cet objectif passera par plusieurs étapes :

Partie « Chirugicale » :

Des cours magistraux présenteront le parcours du don et de la transplantation hépatique. Ils replaceront les conséquences des lésions liées à la préservation du foie dans leur contexte clinique, mettront en évidence leur impact sur les résultats de la transplantation et introduiront les besoins cliniques non satisfaits ainsi que les lacunes actuelles de la recherche.

Les étudiants acquerront une compréhension de la physiopathologie des lésions d'ischémie-reperfusion, des zones d'incertitude concernant les lésions d'ischémie-reperfusion des voies biliaires et de leurs liens avec les complications biliaires post-transplantation. Le rôle central des mitochondries sera détaillé, de même que l'évolution des techniques de préservation développées pour prévenir ou limiter les altérations mitochondriales.

Le rôle émergent de biomarqueurs potentiels pour la sélection des foies au cours de la préservation sera également abordé, en mettant en lumière leurs avantages, mais aussi leurs limites et leurs écueils d'interprétation.

Les différentes approches et méthodologies de recherche translationnelle seront présentées, notamment :

  • les cultures cellulaires bidimensionnelles (2D) et tridimensionnelles (3D) ;
  • les modèles animaux de petite et de grande taille ;
  • la perfusion ex situ de foies humains non retenus pour la transplantation ;
  • le modèle du donneur décédé.
Des études majeures du domaine seront utilisées pour illustrer l'intérêt de ces approches et leur adéquation avec des questions de recherche spécifiques.

Pour chaque cours, des exemples de questions de recherche pertinentes seront proposés. Les étudiants seront invités à se placer dans la peau d'un chercheur en recherche translationnelle et à concevoir un protocole expérimental permettant de tester l'hypothèse étudiée.

Partie « ONCO » : 

Les cours introduiront les principaux principes biologiques qui sous-tendent les cancers digestifs ainsi que leur traduction en pratique clinique. Les étudiants développeront une compréhension générale des caractéristiques fondamentales du cancer (« hallmarks of cancer »), de la classification moléculaire des tumeurs, de l'instabilité génomique, des prédispositions héréditaires au cancer, des interactions entre la tumeur et son microenvironnement, ainsi que des mécanismes d'action des traitements anticancéreux.

Le volet consacré à la radiobiologie portera sur les principes fondamentaux de la radiothérapie et de la radiosensibilité, sans exiger une connaissance détaillée des modèles mathématiques, des doses d'irradiation ou des essais cliniques individuels.

Dans le cadre d'un travail collaboratif, les étudiants réaliseront une analyse critique d'un article scientifique publié plusieurs années auparavant. En adoptant une perspective contemporaine, ils devront identifier les principales forces et limites de l'étude et proposer des modèles expérimentaux et des techniques modernes susceptibles de renforcer les conclusions des auteurs ou de tester davantage leurs hypothèses.

Partie "MICI" :

Un cours ex-cathedra où seront évoqués le contexte et les difficultés inhérents aux MICI, la compréhension du rôle physiologique/ physiopathologique des biomarqueurs dans les processus immunitaires & inflammatoires, la meilleure compréhension des techniques de dosage/ recherche de biomarqueurs, l'évocation du rôle de ces biomarqueurs dans la prise en charge et les traitements de maladies inflammatoires intestinales en pratique clinique. Le lien de cause à effet et différence avec la simple association de faits en recherche et l'utilisation de modèles fonctionnels dynamiques intestinaux et leurs limitations (organoïdes, cellules primaires, explants et cohortes d'échantillons biologiques de différentes natures).

Un exercice pratique de lecture, analyse et présentation, d'un article scientifique de recherche translationnelle dans le contexte des MICI et ou oncologie des MICI (les articles qui seront fournis et peuvent changer chaque année) sera demandé et à réaliser soit individuellement, soit par petits groupes (suivant le nombre d'inscrits au cours). Leur analyse sera également discutée en classe avec l'enseignant.

 

Savoirs et compétences prérequis

Notions physiologiques et physiopathologiques des pathologies digestives.

Immunologie et histologie du tube digestif.

Notion de biochimie sur les techniques de diagnostic : ELISA, immunohistochimie...

Notion de biochimie et de physiologie humaines (métabolisme énergétique, régulation des substrats énergétiques).

Notion de statistique descriptive.

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

Slides projetés lors du cours mis à disposition des étudiants sur la plateforme internet
Portefeuille de cas cliniques illustratifs
Mise à disposition d'articles de références

Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)

présentiel ou à distance en fonction des conditions sanitaires

Supports de cours, lectures obligatoires ou recommandées

Plate-forme(s) utilisée(s) pour les supports de cours :
- Microsoft Teams


Informations complémentaires:

slides and articles de référence donné au cours

 

Modalités d'évaluation et critères

Examen(s) en session

Toutes sessions confondues

- En présentiel

évaluation écrite ( QCM, questions ouvertes )


Informations complémentaires:

Toutes sessions confondues :

- En présentiel :  évaluation écrite

- En distanciel si necessaire : évaluation écrite ( QCM and QO reponse courte) 
maximum de 2h d'examen pour l'ensemble des 3 parties du cours.

Stage(s)

sans objet

Remarques organisationnelles et modifications principales apportées au cours

aucune mais nouveau cours depuis (2025-26)

Contacts

Coordinatrice:
M-A MEUWIS (gastroenterology laboratory GIGA)

marie-alice.meuwis@uliege.be

B34, avn de l'hôpital 11
Quartier de l'Hôpital
4000 Liège, Sart-Tilman

Laboratory Phone: 0032.4.3662538

Office phone : 0032.4.3232892

 

Association d'un ou plusieurs MOOCs