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2026-2027 / MICR1717-2

Microbiologie, Partie générale

Durée

20h Th, 4h Pr

Nombre de crédits

 Bachelier en sciences pharmaceutiques4 crédits 

Enseignant

Marie-Pierre Hayette

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue française

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Ce cours introduit les étudiants au monde des microorganismes et à leur rôle essentiel dans la biosphère et la santé humaine. Si la majorité des microbes sont bénéfiques, une minorité est responsable de maladies infectieuses.

Les principales caractéristiques des quatre grands groupes de microorganismes (virus, bactéries, champignons et parasites) sont présentées, avec une attention particulière portée aux bactéries, premières formes de vie apparues sur Terre.

Le cours aborde les caractéristiques biologiques des microorganismes, leurs interactions avec leur environnement et avec l'Homme, ainsi que la plasticité de leur génome, responsable des échanges génétiques, de l'évolution et de l'émergence de souches plus virulentes ou résistantes.

Les mécanismes des maladies infectieuses sont étudiés à travers les interactions entre l'hôte et les microorganismes, en mettant en évidence le rôle de la virulence, du site infecté et des défenses immunitaires.

Les principales stratégies de prévention et de contrôle des maladies infectieuses sont également développées : hygiène, accès à l'eau potable, stérilisation, désinfection, antisepsie, utilisation des agents antimicrobiens et immunoprophylaxie.


Table des matières

  • Introduction sur les maladies infectieuses
  • Historique
  • Les bactéries 1[SUP]ère[/SUP] partie
  • Les bactéries 2[SUP]ème[/SUP] partie
  • Les parasites
  • Les champignons
  • Les maladies infectieuses : concepts et cycles d'infection
  • Contrôle des maladies infectieuses
  • Antibiotiques : mécanismes d'action
  • Antibiotiques : mécanismes de résistance

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

Au terme du cours et des travaux pratiques, l'étudiant sera capable de :

  • expliquer l'importance des microorganismes dans l'environnement et en pathologie infectieuse ;
  • décrire l'impact mondial des maladies infectieuses ;
  • présenter les principales étapes de l'histoire de la microbiologie ;
  • distinguer les différents groupes de microorganismes et leurs caractéristiques ;
  • décrire la croissance bactérienne et le rôle des biofilms ;
  • expliquer l'organisation du matériel génétique bactérien ainsi que les mécanismes d'acquisition et de modification génétique ;
  • présenter les principaux rôles bénéfiques des microorganismes ;
  • comprendre les interactions entre l'hôte et les microorganismes conduisant à la maladie ;
  • identifier les principaux facteurs de virulence ;
  • expliquer les modes de transmission des agents infectieux ;
  • décrire les principaux moyens de défense et de prévention (hygiène, eau potable, vaccination, stérilisation, désinfection, antibiothérapie) ;
  • expliquer les modes d'action des antibiotiques ainsi que les mécanismes de résistance ;
  • présenter les principales méthodes de détection et d'identification utilisées en laboratoire de microbiologie ;
  • intégrer ces connaissances dans l'étude des maladies infectieuses, de leur diagnostic, de leur pathogenèse et de leur prévention.

Savoirs et compétences prérequis

Prérequis

  • Biologie générale préparatoire aux sciences médicales (avec introduction à la génétique)
  • Immunologie générale
Ces enseignements constituent les bases indispensables à la compréhension du cours.

Co-requis

  • Virologie générale et médicale (Pr N. Jacobs)

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

L'enseignement comprend des cours magistraux complétés par des podcasts. Les étudiants peuvent poser leurs questions à l'issue des séances ou par courrier électronique.

Des travaux pratiques (TP) obligatoires complètent le cours théorique. Ils se composent de deux séances de deux heures en présentiel.

Les TP permettent de se familiariser avec :

  • les règles de biosécurité ;
  • les mesures d'hygiène, notamment le lavage des mains ;
  • les techniques de base utilisées en microbiologie clinique ;
  • les méthodes de diagnostic microbiologique.
Organisés sous forme d'ateliers thématiques, ils comprennent notamment des observations en microscopie, l'étude de cultures bactériennes et fongiques, des tests diagnostiques ainsi que l'analyse de cas cliniques illustrant la pratique des laboratoires de microbiologie.

La présence est obligatoire. Toute absence doit être justifiée par un certificat médical. Le port de la blouse est obligatoire et des gants sont fournis pour les manipulations biologiques.

Évaluation des travaux pratiques

Une interrogation sous forme de QCM est intégrée à l'examen théorique pour 10% de la cote finale.

Un rapport de TP, complété en ligne via E-Campus, représente 10 % de la note finale.

Toute absence injustifiée aux TP entraîne une note d'absence (A) pour l'unité d'enseignement.

Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)

Combinaison d'activités d'apprentissage en présentiel et en distanciel


Informations complémentaires:

  • Cours magistraux en présentiel
  • Podcasts
  • Travaux pratiques en présentiel
Le cours est coordonné par le Pr Marie-Pierre Hayette.

Les travaux pratiques sont organisés par groupes d'étudiants et encadrés par Mr Khalid El Moussaoui (Assistant universitaire, Service de microbiologie clinique, CHU de Liège).

Les supports de cours, dont syllabus, et le manuel de TP sont disponibles sur E-Campus.

Supports de cours, lectures obligatoires ou recommandées

Plate-forme(s) utilisée(s) pour les supports de cours :
- eCampus


Informations complémentaires:

Les diaporamas des cours et les notes de TP disponibles sur E-Campus constituent les supports obligatoires.

Ouvrages de référence :

  • Mims' Medical Microbiology (6e éd., Elsevier, 2018)
  • Introduction à la microbiologie (Tortora et al., 2e éd.)
  • Brock Biology of Microorganisms (14e éd.)
  • The Microbial Challenge (Krasner)
  • Microbiologie (Prescott, traduction française)
  • Infectiologie, Tome 3
Site recommandé : www.microbes-edu.org

Modalités d'évaluation et critères

Examen(s) en session

Toutes sessions confondues

- En présentiel

évaluation écrite ( QCM )

Travail à rendre - rapport


Informations complémentaires:

L'évaluation consiste en un examen écrit organisé en session (QCM), comprenant des questions théoriques et portant également sur les travaux pratiques.

Absences

  • une absence injustifiée à une séance de travaux pratiques entraîne une note de zéro pour le rapport de TP, soit une pénalité de 10 % de la note finale ;
  • une absence justifiée par certificat médical ne donne lieu à aucune pénalité. En fonction des cas, comme l'absence à tous les TP, le rapport pourra être supprimé et la pondération adaptée.
  • un rapport non remis est assimilé à une absence injustifiée et entrainera une note de zéro.
Les notes des travaux pratiques ne sont reportables qu'au sein de la même année académique.

Stage(s)

Remarques organisationnelles et modifications principales apportées au cours

Les travaux pratiques sont coordonnés par Mr Khalid El Moussaoui (Service de microbiologie clinique du CHU de Liège).

Leur participation est obligatoire.

L'accès aux laboratoires se fait OBLIGATOIREMENT AVEC PORT D'UNE BLOUSE.

Les changements de groupe ne sont accordés qu'à titre exceptionnel, selon les possibilités d'organisation.

Contacts

Service de Microbiologie Clinique - Prof. Marie-Pierre HAYETTE

CHU Sart Tilman - Route 656
Tour 6 - Niveau +2
Quartier Hôpital
Avenue Hippocrate,15
4000 Liège
Tél: +32 4 323 22 90

Secrétariat
Stéphanie Wauquier
Tél. : +32 (0)4 323 22 90
E-mail : micromed@uliege.be

Responsable du cours
Prof. Marie-Pierre Hayette
E-mail : mphayette@uliege.be

Collaboratrice (cours antibiotiques) : Cécile Meex (Cecile.Meex@chuliege.be)

Travaux pratiques
Mr Khalid El Moussaoui, Assistant universitaire

kelmoussaoui@chuliege.be

Association d'un ou plusieurs MOOCs