Microbiologie générale

Partie théorique

Cette unité d'enseignement propose une introduction à la microbiologie générale en explorant l'univers des microorganismes et leur place dans les écosystèmes ainsi que dans la santé humaine.

L'enseignement comprend une partie théorique et des travaux pratiques.

Le cours met en évidence le fait que la grande majorité des microorganismes sont bénéfiques et jouent un rôle essentiel dans le maintien des équilibres biologiques, tandis qu'une minorité est responsable de maladies infectieuses.

Les étudiants découvriront les principales caractéristiques des bactéries, champignons, parasites (protozoaires et helminthes), leurs interactions avec l'environnement et les différents hôtes, ainsi que les mécanismes impliqués dans leur évolution. Une attention particulière sera portée à la plasticité génomique des bactéries, aux transferts horizontaux de gènes et à leur impact sur l'émergence de nouvelles caractéristiques, notamment la résistance aux antimicrobiens.

Le cours abordera également les mécanismes de la relation hôte-microorganisme, les facteurs de pathogénicité, les modes de transmission des agents infectieux ainsi que les différentes stratégies de prévention et de contrôle des maladies infectieuses : hygiène, désinfection, stérilisation, vaccination, antibiothérapie et sécurité de la chaîne alimentaire et de l'eau.

Enfin, les étudiants seront initiés aux principes de biosécurité et aux techniques de base utilisées en microbiologie clinique lors des travaux pratiques.

Table des matières du cours

• Introduction et actualités en microbiologie
• Historique
• Les bactéries
• Les champignons
• Les parasites
• Les maladies infectieuses : concepts
• Contrôle des maladies infectieuses

Travaux pratiques pour les sciences médicales et dentaires

Toutes les informations concernant les travaux pratiques se trouvent dans les EP du cours théorique MICR0120.

  

Partie théorique

Au terme du cours et des travaux pratiques, les étudiants seront capables de :

• décrire les principales caractéristiques des bactéries, des champignons et des parasites (les virus étant abordés dans le cours du Pr Nathalie Jacobs) ;
• expliquer les interactions entre les microorganismes, leur environnement et leurs différents hôtes ;
• décrire le pouvoir pathogène des microorganismes ainsi que les moyens de défense de l'hôte ;
• expliquer les principales méthodes de détection et d'identification des microorganismes ;
• identifier les principaux enjeux liés aux microorganismes dans les domaines de l'environnement et de la santé ;
• décrire l'importance des maladies infectieuses en termes de morbidité et de mortalité à l'échelle mondiale ;
• présenter les grandes étapes de l'histoire de la microbiologie ;
• décrire les différents groupes de microorganismes et leurs principales caractéristiques ;
• expliquer les mécanismes de croissance bactérienne et l'importance des biofilms ;
• décrire le matériel génétique bactérien, les principaux mécanismes de modification génétique et les acquisitions de nouveaux caractères ;
• présenter les principaux effets bénéfiques des microorganismes ;
• expliquer les relations hôte-microorganisme pouvant conduire au développement d'une maladie infectieuse ;
• identifier les principaux facteurs de pathogénicité ;
• expliquer les différents modes de transmission des agents infectieux ;
• décrire les principaux moyens de prévention et de contrôle des maladies infectieuses (hygiène, sécurité alimentaire, eau potable, vaccination, stérilisation, désinfection et antibiothérapie) ;
• expliquer les principaux mécanismes d'action des antibiotiques et les mécanismes de résistance ;
• décrire les principales méthodes utilisées dans les laboratoires de microbiologie pour détecter et identifier les microorganismes ;
• intégrer ces connaissances comme base pour l'étude ultérieure des maladies infectieuses, de leur diagnostic, de leur pathogenèse ainsi que de leur prévention et de leur contrôle.

Partie théorique

• Cours de biologie en secondaire
• Cours d'immunologie

Partie théorique

L'enseignement comprend :

• des cours magistraux en présentiel,
• des podcasts,
• 2 séances obligatoires de travaux pratiques en présentiel.

• les missions d'un laboratoire de microbiologie clinique ;
• les règles fondamentales de biosécurité et d'hygiène, notamment le lavage des mains ;
• les techniques de base utilisées en microbiologie.

Partie théorique

Combinaison d'activités d'apprentissage en présentiel et en distanciel


Informations complémentaires:

• Cours magistraux en présentiel ;
• Podcasts ;
• Travaux pratiques en présentiel.

Partie théorique

Plate-forme(s) utilisée(s) pour les supports de cours :
- eCampus


Informations complémentaires:

Les diaporamas des cours théoriques, le syllabus ainsi que le manuel des travaux pratiques sont disponibles sur E-Campus et constituent les supports de référence du cours.

Cours théoriques

Supports :

• diaporamas déposés sur E-Campus ;
• syllabus.

• syllabus des travaux pratiques.

• Prescott's Microbiologie, Willey JM et al., 5? édition française (2018), traduction de la 10? édition américaine (2017), De Boeck Université.

• Microbes-edu : http://www.microbes-edu.org/
• Sciensano : https://www.sciensano.be
• Centers for Disease Control and Prevention (CDC) : https://www.cdc.gov
• Organisation mondiale de la Santé (OMS) : https://www.who.int/fr

Partie théorique

Examen(s) en session

Toutes sessions confondues

- En présentiel

évaluation écrite ( QCM )

Travail à rendre - rapport


Informations complémentaires:

L'évaluation comprend :

• un examen théorique composé de QCM en session portant aussi bien sur la matière vue au cours (80% de la cote finale) qu'aux TP (10% de la cote finale).
• un rapport de travaux pratiques réalisé en individuel et en ligne représente 10% de la cote finale

• une absence injustifiée à une séance de travaux pratiques entraîne une note de zéro pour le rapport de TP, soit une pénalité de 10 % de la note finale ;
• une absence justifiée par certificat médical ne donne lieu à aucune pénalité mais ne dispense pas de l'examen écrit. En revanche, le rapport pourra être supprimé voire adapté.
• un rapport non remis est assimilé à une absence injustifiée.

Partie théorique

Les travaux pratiques sont coordonnés par Mr Khalid El Moussaoui, assistant universitaire, (Service de microbiologie clinique du CHU de Liège).

La participation aux travaux pratiques est obligatoire.

L'accès aux laboratoires nécessite ABSOLUMENT le port d'une blouse.

Les changements de groupe ne sont accordés qu'à titre exceptionnel, dans la limite des possibilités d'organisation.

Partie théorique

Service de microbiologie clinique

Prof. Marie-Pierre Hayette

CHU Sart Tilman
Route 656 - Tour 6 - Niveau +2
Quartier Hôpital
Avenue Hippocrate 15
4000 Liège

Tél. : +32 (0)4 323 22 90

Secrétariat

Stéphanie Wauquier

Tél. : +32 (0)4 323 22 90

E-mail : micromed@uliege.be;

stephanie.wauquier@chuliege.be

Responsable du cours

Marie-Pierre Hayette

E-mail : mphayette@uliege.be

Responsable des travaux pratiques

Mr Khalid El Moussaoui, Assistant universitaire

E-mail : kelmoussaoui@chuliege.be

 

Partie théorique

Aucun MOOC n'est associé à ce cours.