Durée
5h Th, 20h TD
Nombre de crédits
| Master en bioinformatique et modélisation, à finalité | 3 crédits |
Enseignant
Langue(s) de l'unité d'enseignement
Langue anglaise
Organisation et évaluation
Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier
Horaire
Unités d'enseignement prérequises et corequises
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement
Le cours consistera en une découverte de l'utilisation d'outils informatiques et statistiques adaptés pour l'analyse de sets de données biologiques.
Diverses notions seront revues par le biais d'exercices, depuis des notions générales (vecteurs et matrices, tests de normalité, test d'équivalence) jusqu'à la mise en œuvre de solutions complètes d'analyse exigées par des problèmes particuliers.
Concrètement, le cours sera axé sur l'usage du langage R et ses divers paquets logiciels.
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement
Réflexes et autonomie pratique nécessaires pour pouvoir aborder le traitement et l'analyse de sets de données biologiques complexes avec le logiciel R, depuis la compilation de données à partir de différentes sources jusqu'à la synthèse de résultats statistiques et leur visualisation. Capacité à planifier les différentes étapes d'un processus d'analyse de données.
Savoirs et compétences prérequis
Les étudiants sont invités à revoir les bases qu'ils auraient déjà acquises dans les domaines suivants : statistique et programmation.
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement
Mini-exposés théoriques, démonstrations et exercices pas à pas, travaux pratiques sur ordinateur avec défis à résoudre et exercices autonome.
Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)
Combinaison d'activités d'apprentissage en présentiel et en distanciel
Explications complémentaires:
Ce cours est entièrement donné sous forme de vidéo theorique et pratique
Ce cours peut-être suivi dans sa version française ou anglaise.
Des séances questions-réponses en présentiel sont prévues à l'horaire.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours
Les exercices et leur correction ainsi que les dapositives du cours (en pdf) sont mises en ligne à l'adresse web www.bioinfo.uliege.be/classes/INFO0956/
Le mot de passe est disponible dans le forum ecampus du cours.
Modalités d'évaluation et critères
Examen(s) en session
Toutes sessions confondues
- En présentiel
évaluation écrite ( questions ouvertes )
Interrogation(s) hors session
Explications complémentaires:
L'évaluation de ce cours se fait sur un examen écrit.
Une interro dispensatoire est prévue sur ecampus autour de novembre. Les détails sont expliqués sur la page web de ce cours.
Stage(s)
Remarques organisationnelles
L'emploi d'un ordinateur portable est nécessaire à toutes les séances pour le suivi de démonstrations et la réalisation d'exercices de programmation personnels.
Le logiciel RStudio est accessible via n'importe quel navigateur web.
Contacts
Prof. Patrick Meyer Institut de Botanique B22 (P70) www.bioinfo.uliege.be/meyer/