Analyse des séquences des gènes et des protéines : partim a

Durée

10h Th, 10h Pr

Nombre de crédits

Enseignant

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue française

Organisation et évaluation

Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Le cours comprendra: - Une introduction aux différents logiciels permettant de la comparaison entre deux séquences peptidiques ou nucléotidiques sera donnée et comprendra une description des différentes banques accessibles par le réseau internet, l'utilisation des différents outils informatiques disponibles (BLAST, et CLUSTAL, ...) et une analyse statistique des résultats obtenus. - Les différentes méthodes pour identifier une phase codante dans une séquence nucléotidique seront présentées. De plus, les différents outils permettant la recherche des " signaux " (RBS, terminateurs, recherche d'un pattern, ... ) présents le long d'une chaîne nucléotidique seront également présentés.
- Les différents logiciels qui permettent de caractériser une séquence peptidique (hydrophobicité, prédiction des structures secondaires, calcul du point isoélectrique théorique, recherche de motifs, ...).
Les travaux pratiques associés à ce module permettront aux étudiants d'utiliser les logiciels présentés au cours théorique.

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

Le cours permettra aux étudiants d'acquérir les différents connaissances pour utiliser logiciels disponibles sur Internet et permettant d'analyser une séquence peptidique ou nucléotidique.

Savoirs et compétences prérequis

Les cours de biologie moléculaire et de biochimie générales

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)

Présentiel

Adaptations organisationnelles liées au contexte sanitaire

Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours

Modalités d'évaluation et critères

Vous trouverez ci-dessous les modalités d'évaluation envisagées pour les examens en présentiel et à distance ainsi que celle souhaitée en cas de session hybride. En fonction de l'évolution sanitaire, la modalité choisie vous sera communiquée au plus tard un mois avant le début de la session d'examen.

Un examen oral devant l'ordinateur

Stage(s)

Remarques organisationnelles

Contacts

B. Joris - Tél. : 04/366.29.54 - e-mail : bjoris@ulg.ac.be