Durée
Séminaire de chimie clinique : 25h Th, 120h SEM
Séminaires de microbiologie et infectiologie : 25h Th, 120h SEM
Séminaires d'hématologie : 25h Th, 120h SEM
Séminaires de toxicologie médicamenteuse : 15h Th, 120h SEM
Sérologie des groupes sanguins : 15h Th, 90h Pr
Biostatistique II : 15h Th, 15h Pr
Analyse statistique multivariée : 10h Th, 10h Pr
Etude du génome humain normal et pathologique par les méthodes de biologie moléculaire : 10h Th, 10h Pr
Assurance qualité : 10h Th, 10h Pr
Nombre de crédits
| Master de spécialisation en biologie clinique ((sciences de la santé)) | 10 crédits | |||
| Master de spécialisation en biologie clinique ((sciences pharmaceutiques)) | 10 crédits |
Enseignant
Séminaire de chimie clinique : Collégialité
Séminaires de microbiologie et infectiologie : Marie-Pierre Hayette, Pierrette Melin
Séminaires d'hématologie : André Gothot
Séminaires de toxicologie médicamenteuse : Corinne Charlier
Sérologie des groupes sanguins : Mélanie Monfort
Biostatistique II : Anne-Françoise Donneau
Analyse statistique multivariée : Anne-Françoise Donneau
Etude du génome humain normal et pathologique par les méthodes de biologie moléculaire : Vinciane Dideberg, Frédéric Lambert
Assurance qualité : Collégialité
Coordinateur(s)
Langue(s) de l'unité d'enseignement
Langue française
Organisation et évaluation
Enseignement durant l'année complète, avec partiel en janvier
Horaire
Unités d'enseignement prérequises et corequises
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement
Séminaires de microbiologie et infectiologie
Les cours et ateliers sont suivis soit en première année soit en seconde année selon la disponibilité des assistants et selon la localisation de leurs stages de biologie clinique. Ces cours leur permettent d'avoir des notions théoriques et de discuter les cas cliniques de façon à développer leur notions de base mais aussi leur capacité d'interprétation des résultats microbiologiques.
Cours de Parasitologie-Mycologie (M.P. Hayette)
Le cours se donne sous forme d'exposés et de revue de cas cliniques (en s'aidant d'un programme de training en ligne "e-MEDICINimage" pour les parasitoses et mycoses). Les étudiants devront également présenter un exposé sur un thème qu'ils auront choisi.
Description du cours
Le cours associe des généralités sur les champignons et les parasites eucaryotes. Il aborde ensuite les principaux modes de diagnostic en fonction des pathologies et des sites d'infection. Enfin, il aborde quelques pathologies parmi lesquelles: candidose-cryptococcose-aspergillose-dermatophytoses-paludisme-infections parasitaires à tropisme intestinal. Cette liste est adaptée en fonction des sujets qui sont choisis par les assistants pour leur présentation orale.
En fonction des cas cliniques observés dans le laboratoire, les aspects particuliers sont illustrés à partir du matériel reçu au laboratoire.
Table des matières
Part I. Généralités.
Mycologie: généralités sur les champignons filamenteux et les levures: structure, relation hôte-parasite, défenses de l'hôte, prévention et traitement.
Parasitologie: généralités sur les parasites sanguicoles et les parasites à tropisme intestinal, relation hôte-parasite, défenses de l'hôte, prévention et traitement.
Partie II. Diagnostic biologique.
Mycoses invasives et superficielles: candidoses, cryptococcose, aspergillose, pneumocystose, infections à dermatophytes
Parasitoses à parasites sanguicoles: paludisme, toxoplasmose, filarioses, trypanosomiase, leishmaniose, anguilulose, schistosomose. Parasitoses intestinales: helminthiases, amibiase, giardiase.
Cours et ateliers de microbiologie clinique (P.Melin)
Parmi les thématiques abordées en cours magistral ou en ateliers interactifs
Missions des laboratoires de microbiologie clinique
- Considérations pré-analytiques générales et spécifiques pour le diagnostic microbiologique
- Détection de la résistance bactérienne aux antibiotiques, référentiels, interprétation et expertise de l'antibiogramme
- Assurance de qualité spécifique à la microbiologie
- Lecture et interprétation des examens microscopiques directs
- Revue des infections par système anatomique et méthodes de diagnostic microbiologique
- Méthodes et interprétation des examens sérologiques
- Cas cliniques
Séminaires d'hématologie
L'hématologie est l'étude des composés cellulaires et moléculaires du sang. Le cours est destiné à exposer la physiopathologie des maladies hématologiques et les tests de laboratoire utilisés pour en faire le diagnostic.
Séminaires de toxicologie médicamenteuse
Cours spécifique sur les techniques chromatographiques adaptées à l'activité d'un service de Toxicologie.
Stage au laboratoire: observation et intégration, signature de protocoles, participation à des validations de méthode, participation à l'activité du laboratoire
Biostatistique II
Ce cours est la deuxième partie de l'enseignement de la biostatistique à la Faculté de Médecine. Il aborde des méthodes statistiques plus complexes, comme l'analyse de la variance à un ou deux critères, les tables de contingence, les techniques statistiques non-paramétriques et l'analyse de survie.
Chaque leçon est composée d'un exposé théorique suivi d'une séance de travaux pratiques avec le logiciel SAS, au cours de laquelle l'étudiant aura l'occasion de se familiariser avec la résolution de problèmes statistiques rencontrés en pratique.
Biostatistique II
Ce cours est la deuxième partie de l'enseignement de la biostatistique à la Faculté de Médecine. Il aborde des méthodes statistiques plus complexes, comme l'analyse de la variance à un ou deux critères, les tables de contingence, les techniques statistiques non-paramétriques et l'analyse de survie.
Chaque leçon est composée d'un exposé théorique suivi d'une séance de travaux pratiques avec le logiciel SAS, au cours de laquelle l'étudiant aura l'occasion de se familiariser avec la résolution de problèmes statistiques rencontrés en pratique.
Analyse statistique multivariée
Le cours consiste en une introduction générale aux méthodes d'analyses statistiques multivariées, c'est-à-dire l'étude de la variabilité d'une variable (variable dépendante) en fonction d'un ensemble de plusieurs variables (variables indépendantes). Le cours comporte les parties suivantes:
- Introduction à R
- Régression multiple
- Régression logistique binaie et ordinale
- Courbes de survie et régression de Cox
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement
Séminaires de microbiologie et infectiologie
Parasitologie-Mycologie.
- Connaître les principales caractéristiques des champignons et des parasites
- Connaître toutes les méthodes diagnostiques mises en oeuvre pour le diagnostic des mycoses et parasitoses invasives et superficielles.
- Connaître les algorithmes de diagnostic.
- Développer ses qualités d'orateur et savoir faire une synthèse de la littérature sur un sujet donné.
- De discerner ce qu'est un résultat utile et d'expliquer l'impact attendu pour le patient et pour la communauté.
- D'argumenter l'importance de l'obtention rapide d'un résultat
- D'expliquer et de justifier les considérations pré-analytiques spécifiques aux analyses microbiologiques (quels prélèvements, quand prélever, comment prélever, quelles conditions de conservation et de transport)
- D'encourager toute relation dynamique avec les médecins prescripteurs
- D'expliquer les critères de prescriptions et de justifier les renseignements à communiquer
- De résumer les principes, avantages, inconvénients et positionnement des techniques analytiques utilisées en microbiologie (microscopiques, immunologiques, de culture, de biologie moléculaire)
- De résumer les principes, avantages, inconvénients et positionnement des techniques analytiques utilisées pour la détermination de la sensibilité des agents infectieux aux antimicrobiens, pour la détection et caractéristaion des mécanismes de résistance.
- D'expliquer et de justifier l'expertise de l'antibiogramme
- D'interpréter les résultats de sérologie infectieuse pour les tests les plus fréquemment réalisés.
- De réaliser un menu de base d'analyses microbiologiques
Séminaires d'hématologie
1. physiologie de l'hématopoièse et des cellules sanguines normales
2. pathologie des globules rouges
3. pathologie des globules blancs
4. pathologie des plaquettes
5. hémostase et coagulation
Biostatistique II
L'objectif du cours est de consolider les connaissances en biostatistique de l'étudiant, en insistant davantage sur le mode de raisonnement statistique que sur les aspects mathématiques et les formules à utiliser. Il doit donner aux étudiants une formation suffisante en statistique pour la suite de leurs études, en particulier pour la réalisation de leur mémoire de fin d'études.
Analyse statistique multivariée
Le cours a pour objectif d'introduire de façon pragmatique les méthodes de l'analyse statistique multivariée. A la fin du cours, l'étudiant doit être à même de poser un problème multivarié, d'en réaliser l'analyse à l'aide du logiciel R et d'en exposer clairement les résultats. Il doit être aussi à même de comprendre l'utilisation de méthodes multivariées dans la littérature scientifique.
Savoirs et compétences prérequis
Séminaires de microbiologie et infectiologie
Master en Pharmacie ou en médecine
Séminaires d'hématologie
Biochimie humaine et pathologique. Histologie.
Biostatistique II
Prérequis: STAT1001-1 ou équivalent.
Analyse statistique multivariée
Prérequis: STAT1001-1 et STAT0420-1 ou STAT730-2
Avoir suivi un cours d'analyse statistique univariée.
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement
Séminaires de microbiologie et infectiologie
- Cours ex-cathedra
- Utilisation de la plateforme e-MEDICIN image (cas cliniques)
- Présentations orales faites par les étudiants
- Quiz thématiques
- Ateliers à partir de cas cliniques
Séminaires d'hématologie
Enseignement en ligne.
Biostatistique II
Au total 15 heures.
En statistique, la pratique est essentielle. Les étudiants sont donc priés d'assister et de participer aux séances d'exercices.
Les travaux pratiques débuteront dès la première leçon théorique à la salle informatique Lapière (CHU, B36) de 13h30 à 17h30. La statistique étant aussi et surtout l'expérience pratique, la présence à ces séances est obligatoire, même si certains exercices peuvent être terminés à domicile. Les travaux pratiques se termineront le jour du dernier cours par la réalisation d'un examen blanc.
Analyse statistique multivariée
Les travaux pratiques consistent en l'analyse statistique de fichiers de données multivariées à l'aide du logiciel R.
Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance)
Séminaires de microbiologie et infectiologie
Présentiel et à distance
Les diaporama sont accessibles (en ligne ou imprimés)
Les adresses des sites web consultés sont communiquées.
Séminaires d'hématologie
Cours en ligne.
Biostatistique II
Tous les cours se donneront à la salle informatique Lapière (CHU, B36) au premier quadrimestre.
Analyse statistique multivariée
Chaque cours est composé d'une partie théorie suivie de la partie pratique correspondante avec le logiciel R. Les exercices peuvent être terminés à domicile.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours
Séminaires de microbiologie et infectiologie
Notes de cours sous forme de diaporama
Commentaires d'articles scientifiques
Les ouvrages de référence suivant permettent une meilleure compréhension et un élargissement des notions enseignées:
- Moisissures-Dermatophytes-Levures. Chabasse D. et al. Biomérieux Ed.
- Médecine tropicale. Marc Gentilini. Flammarion Ed. 2005
- Fungal infection. Diagnosis and management. Richardson and Warnock. Wiley-Blackwell Ed. 2012
- Bactériologie médicale - Techniques usuelles 2ème édition François DENIS, Marie-Cécile Ploy, Christian Martin, Edouard Bingen, Roland QUENTIN Editeur: Elsevier Masson. 11/2011 ISBN: 9782294096686
- De nombreux documents couvrant les domaines variés de la microbiologie sont disponibles et régulièrement mis à jour sur le site de la Société Américaine de microbiologie (ASM). A consulter et télécharger du site de l'ASM : http://clinmicro.asm.org/index.php/bench-work-resources
- La série des Cumitech offre des recommandations sur les techniques de microbiologie clinique et d'immunologie traitant d'un sujet par volume. Ces documents sont édités également par l'ASM.
Séminaires d'hématologie
Distribution des diapositives présentées au cours.
Biostatistique II
Les slides et les bases de données exemples utilisées au cours seront mis à la disposition des étudiants.
Livres de référence (non obligatoire) :
P. Dagnelie. Statistique Théorique et Appliquée. De Boeck Université, Bruxelles, 1999.
D. Schwartz. Le jeu de la science et du hasard. La statistique et le vivant. Flammarion, Paris, 1994.
D.G. Altman. Practical statistics for medical research. Chapman & Hall, London, 2000.
Analyse statistique multivariée
Les slides ainsi que les bases de données utilisées aux cours seront mis à la disposition des étudiants
Les livres de référence (non obligatoire) sont: -"Analyse statistique multivariée", A. Albert, édition 2011 - Multivariate statistical methods. D. Morrison, Mc Graw-Hill, Auckland, 1986 - Introduction to multivariate analysis. C. Chatfield et A.J. Collins, Chapman and Hall. ed, London, 1980
Modalités d'évaluation et critères
Séminaires de microbiologie et infectiologie
Présentation orale sur un sujet choisi (50%) Questions de cours à l'oral (50%)
Séminaires d'hématologie
Examen oral après préparation de questions ouvertes, choisies parmi une sélection distribuée aux étudiants à la fin du cours. Questions vrais-faux portant sur l'ensemble du cours.
Biostatistique II
L'examen aura lieu sur ordinateur durant la session de janvier et durera 3h. Il sera composé de deux parties :
- Questions de réflexion (QCM)
- Résolution d'exercice à l'aide du logiciel SAS
Afin d'organiser au mieux l'examen, les étudiants devront confirmer leur présence/participation à l'examen. Le jour de l'examen, les étudiants devront se présenter avec leur identifiant et mot de passe ULiège. Sans cela, ils ne sera possible de passer l'examen.
Analyse statistique multivariée
Examen pratique sur ordinateur d'une durée de 2 heures durant la session de janvier. L'examen consistera en la résolution d'exercices à l'aide R.
Afin d'organiser au mieux l'examen, les étudiants devront confirmer leur présence/participation à l'examen . Le jour de l'examen, les étudiants devront se présenter avec leur identifiant et mot de passe ULiège, sans cela il sera impossible de passer cet examen.
Stage(s)
Séminaires de microbiologie et infectiologie
Un stage de 6 mois dans le laboratoire de microbiologie est réalisé au cours des 2 premières années.
Remarques organisationnelles
Séminaires de microbiologie et infectiologie
Cours dont le calendrier est défini en fonction de l'agenda des participants et de l'enseignant
Analyse statistique multivariée
En principe, le cours se donne le mercredi matin du premier quadrimestre.
Contacts
Séminaires de microbiologie et infectiologie
Service de Microbiologie clinique
CHU de Liège,
B-23 Sart Tilman,
4000 LIEGE
Belgique
Secrétariat
Pour tout contact ou rendez-vous, s'adresser à la secrétaire Madame MC Lhôte
- Tél.: 00.32.4.366.24.39
- Fax: 00.32.4.366.24.40
- email: micromed@uliege.be
Prof. Pierrette Melin Pierrette.Melin@uliege.be
Prof. Marie-Pierre Hayette mphayette@uliege.be
Autres encadrants pour les stages et enseignement
Julie Descy, pharmacien spécialiste en biologie clinique julie.descy@chuliege.be
Pascale Huynen, docteur en médecine spécialiste en biologie clinique p.huynen@chuliege.be
Cécile Meex, pharmacien spécialiste en biologie clinique c.meex@chuliege.be
Séminaires d'hématologie
Service d'Hématologie biologique et Immuno-Hématologie.
CHU, Tour 2, 6ème étage, porte 19.
Tel: 04/366 75 36 (Mme Henet)
e-mail: hematobio@ulg.ac.be
Séminaires de toxicologie médicamenteuse
Prof. Corinne CHARLIER
Service de toxicologie clinique, médicolégale, de l'environnement et en entreprise
Bloc central +3 porte 166 CHU
Tél secrétariat 04/3667683 Toxclimedileg@chu.ulg.ac.be
Assistants : Raphaël DENOOZ, Virginie MISTRETTA
Biostatistique II
* Anne-Françoise DONNEAU (Chargée de cours), Quartier Hôpital, Avenue Hippocrate, 13 - Bât 23, 4000 Liège - Belgique. Tél: 04-366.47.90 Email: afdonneau@uliege.be
* Assistante : Nadia DARDENNE, Quartier Hôpital, Avenue Hippocrate, 13 - Bât 23, 4000 Liège - Belgique - Tél: 04-366.33.40 - Email:ndardenne@uliege.be
Analyse statistique multivariée
* Anne-Françoise DONNEAU (Chargée de cours), Quartier Hôpital, Avenue Hippocrate, 13 - Bât 23, 4000 Liège - Belgique. Tél: 04-366.47.90 Email: afdonneau@uliege.be
* Assistante : Nadia DARDENNE, Quartier Hôpital, Avenue Hippocrate, 13 - Bât 23, 4000 Liège - Belgique - Tél: 04-366.33.40 - Email:ndardenne@uliege.be