Programme des cours 2015-2016
| GBIO0031-1 | ||
| Learning from genomic data | ||
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Durée :
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| 150h Proj. | ||
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Nombre de crédits :
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Nom du professeur :
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| Kristel Van Steen | ||
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Langue(s) du cours :
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| Langue anglaise | ||
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Organisation et évaluation :
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| Enseignement au deuxième quadrimestre | ||
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Unités d'enseignement prérequises et corequises :
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| Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme | ||
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Contenus du cours :
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| Les étudiants reçoivent un un problème de recherche en cours qui demande d'effectuer une étude d'interaction d'association pangénomique détaillée (soit basée sur une population, soit sur des familles). Ce problème de recherché est soumis par le superviseur ou via une collaboration en cours.
En fonction de la nature des données, les étudiants peuvent choisir des méthodes d'analyse paramétriques ou non-paramétriques, des outils analytiques statistiques ou d'apprentissage automatique. Vu la nature interdisciplinaire du projet, les étudiants peuvent travailler en groupes de 2 ou 3. Lors de la finalisation du projet, chacun préparera un rapport individuel. Il n'y a pas de séance en classe si ce n'est celle durant laquelle le problème du projet sera introduit. Une aide théorique et pratique est offerte à la demande. |
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Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
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| En utilisant les données fournies, Les étudiants sont capable d'appliquer et de renforcer les connaissance acquises sur un problème pratique de statistique génétique. En particulier,les étudiants sont capable d'effectuer une analyse d'interaction d'association génétique solide et détaillée, utilisant les outils informatiques disponibles appropriés, couvrant les aspects suivant d'un pipeline d'analyse: nettoyage de données, analyse statistique, interprétation, rapport. | ||
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Savoirs et compétences prérequis :
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| Un bagage en biomédecine et/ou informatique est utile. | ||
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Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
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| Lors d'une reunion de démarrage, le problème et les données sont présentés. Les étudiants peuvent utiliser leurs propres données avec l'accord du responsable du cours. Les étudiants peuvent travailler seuls (décourageant) ou en groupes de maximum 3 étudiants. Plusieurs groupes peuvent travailler sur un set de données réelles identique ou different (selon la disponibilité). La supervision est assure par des membres du groupe BIO3 au département EEI de la Faculté des Sciences Appliquées. Des reunions de groupe avec les superviseurs peuvent être organisées sur demande. Au terme du projet, chacun prepare un rapport et le defend oralement. | ||
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Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
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| Principalement à distance | ||
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Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
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| Il n'y a pas de livre obligatoire. L'information essentielle est postée sur les sites :
http://www.montefiore.ulg.ac.be/~kvansteen/ (théorie) http://www.montefiore.ulg.ac.be/~chaichoompu/CK/?Courses (pratique) |
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Modalités d'évaluation et critères :
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Le score est basé sur un rapport et sa défense orale utilisant les 5 critères suivants :
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Stage(s) :
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Remarques organisationnelles :
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| Le projet se déroule au cours du second semestre.
Examen en juin. |
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Contacts :
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| Kristel Van Steen - e-mail kristel.vansteen@ulg.ac.be
Assistant: Kridsadakorn Chaichoompu - e-mail kridsadakorn.cha@gmail.com Mode de contact préféré: e-mail ou contact personnel, après le cours ou sur rendez-vous |
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