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| GBIO0007-1 | Analyse des séquences des gènes et des protéines : partim a
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| Durée : | 10h Th, 10h Pr |
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| Nombre de crédits : |
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| Nom du professeur : | Bernard Joris |
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Langue(s) du cours :
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| Langue française |
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Organisation et évaluation :
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| Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier |
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Contenus du cours :
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| Le cours comprendra:
- Une introduction aux différents logiciels permettant de la comparaison entre deux séquences peptidiques ou nucléotidiques sera donnée et comprendra une description des différentes banques accessibles par le réseau internet, l'utilisation des différents outils informatiques disponibles (BLAST, et CLUSTAL, ...) et une analyse statistique des résultats obtenus.
- Les différentes méthodes pour identifier une phase codante dans une séquence nucléotidique seront présentées. De plus, les différents outils permettant la recherche des " signaux " (RBS, terminateurs, recherche d'un pattern, ... ) présents le long d'une chaîne nucléotidique seront également présentés.
- Les différents logiciels qui permettent de caractériser une séquence peptidique (hydrophobicité, prédiction des structures
secondaires, calcul du point isoélectrique théorique, recherche de motifs, ...).
Les travaux pratiques associés à ce module permettront aux étudiants d'utiliser les logiciels présentés au cours théorique. |
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Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
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| Le cours permettra aux étudiants d'acquérir les différents connaissances pour utiliser logiciels disponibles sur Internet et permettant d'analyser une séquence peptidique ou nucléotidique. |
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Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :
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| Les cours de biologie moléculaire et de biochimie générales |
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Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
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Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
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| Présentiel |
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Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
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Modalités d'évaluation et critères :
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| Un examen oral devant l'ordinateur |
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Stage(s) :
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Remarques organisationnelles :
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Contacts :
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| B. Joris - Tél. : 04/366.29.54 - e-mail : bjoris@ulg.ac.be |
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