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| INFO0098-2 | Introduction à la modélisation des systèmes biologiques
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| Durée : | 25h Th, 25h TD |
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| Nombre de crédits : |
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| Nom du professeur : | Eric Bullinger |
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Langue(s) du cours :
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| Langue française |
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Organisation et évaluation :
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| Enseignement au deuxième quadrimestre |
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Contenus du cours :
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| Le cours traitera les thèmes suivants :
- Motivation d'approaches quantitatives et dynamiques en biologie;
- Présentation de la modélisation mathematique : advantages, limitates and variantes;
- Introduction aux propriétés systémiques comme stabilité, sensibilité et robustesse;
- Exemples biologiques de la régulation génétique, le métabolisme, la signalisation intra- et inter-cellulaire jusqu'à la pharmacokinetique;
- Familiarisation avec les approaches de la biologie systémique, ses défis et des outils computationnels.
Le travail pratique sur ordinateur utilisera le logiciels:
- Cell Designer
- Copasi
- Matlab and the SBtoolbox2
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Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
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| A l'issue du cours, les étudiants seront capables de :
- comprendre et exploiter les considérations théoretiques et practiques de la biologie systémique et de la modélisation mathematique de systèmes biologiques;
- concevoir et analyser des modèles mathematiques de systèmes de réactions chmimiques;
- faire preuve de pouvoir évaluer les avantages et inconvénient d'une composante de biologie systémique dans un projet de recherche.
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Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :
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| aucun |
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Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
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| Le cours repose sur des exposés ex-cathedra ainsi que des exercices sur ordinateur, ainsi qu'un projet de modélisation et d ;analyse de ce modèle.
Le cours et en partie enseigné en anglais. Les étudiants peuvent toujours poser des questions en anglais ou français. |
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Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
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| présentiel |
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Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
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| Des documents de lectures recommandées dans les pages myulg du cours. |
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Modalités d'évaluation et critères :
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- Projet : rapport détaillé individuel (style publication, 5-7 pages) 15%, présentation 15%.
- Examen oral : 35%.
- Examen écrit : 35%.
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Stage(s) :
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Remarques organisationnelles :
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| Le cours est organisé au deuxième quadrimestre à des dates à convenir. |
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Contacts :
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| E. Bullinger(E.Bullinger@ulg.ac.be
)
Institut Montefiore, B28, I.128
Tél: +32 (0)4 366 - 26 77
E.Bullinger (at) ulg.ac.be(E.Bullinger@ulg.ac.be) |
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