 | | |
| INFO0098-1 | Introduction à la modélisation des systèmes biologiques
|
|
| Durée : | 25h Th, 25h Pr |
|
| Nombre de crédits : |
|
|
| Nom du professeur : | Eric Bullinger |
|
Langue(s) du cours :
|
| Langue française |
|
Organisation et évaluation :
|
| Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier |
|
Contenus du cours :
|
| Le cours traitera les thèmes suivants :
- Motivation d'approaches quantitatives et dynamiques en biologie;
- Présentation de la modélisation mathematique : advantages, limitates and variantes;
- Introduction aux propriétés systémiques comme stabilité, sensibilité et robustesse;
- Exemples biologiques de la régulation génétique, le métabolisme, la signalisation intra- et inter-cellulaire jusqu'à la pharmacokinetique;
- Familiarisation avec les approaches de la biologie systémique, ses défis et des outils computationnels.
Le travail pratique sur ordinateur utilisera le logiciels:
- Cell Designer
- Copasi
- Matlab and the SBtoolbox2
|
|
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
|
| A l'issue du cours, les étudiants seront capables de :
- comprendre et exploiter les considérations théoretiques et practiques de la biologie systémique et de la modélisation mathematique de systèmes biologiques;
- concevoir et analyser des modèles mathematiques de systèmes de réactions chmimiques;
- faire preuve de pouvoir évaluer les avantages et inconvénient d'une composante de biologie systémique dans un projet de recherche.
|
|
Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :
|
| aucun |
|
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
|
| Le cours repose sur des exposés ex-cathedra ainsi que des exercices sur ordinateur, ainsi qu'un projet de modélisation et d ;analyse de ce modèle.
Le cours et en partie enseigné en anglais. Les étudiants peuvent toujours poser des questions en anglais ou français. |
|
Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
|
| présentiel |
|
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
|
| Des documents de lectures recommandées dans les pages myulg du cours. |
|
Modalités d'évaluation et critères :
|
| Rapport détaillé individuel (style publication) sur le projet avec présentation (35%).
Examen oral (65%). |
|
Stage(s) :
|
| |
|
Remarques organisationnelles :
|
| Le cours est organisé au premier quadrimestre à des dates à convenir. |
|
Contacts :
|
| E. Bullinger(E.Bullinger@ulg.ac.be
)
Institut Montefiore, B28, I.128
Tél: +32 (0)4 366 - 26 77
E.Bullinger (at) ulg.ac.be(E.Bullinger@ulg.ac.be) |
|
