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| SDOC0039-1 | Christallographie appliquée aux biomolécules
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| Durée : | 20h Th, 15h Pr |
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| Nombre de crédits : |
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| Nom du professeur : | Paulette Charlier |
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Langue(s) du cours :
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| Langue française |
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Contenus du cours :
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| Ce cours a essentiellement pour objet la présentation des techniques de Cristallographie des rayons-X (neutrons) pour l'étude structurale des macromolécules biologiques.
Partie théorique: 1- Rappel général de la technique, 2- Les structures à très haute résolution, 3- La diffraction neutronique, 4- La diffraction de Laue; 5-Les structures d'assemblage macromoléculaire, 6- Les structures de capside virale et de sous-unités ribosomales
Partie pratique: TP sur l'utilisation du programme PYMOL pour l'affichage et l'analyse des macromolécules biologiques.
Résolution d'une structure de protéine in silico. |
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Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
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| Ce cours donne les bases nécessaires pour comprendre les principes de détermination de structure 3D de protéine par radiocristallographie, afin de permettre une utilisation objective des modèles. Il donne un aperçu des pouvoirs et limites des différentes techniques cristallographiques. |
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Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :
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| Cours de physique de 1er cycle. Connaissances de base en radiocristallographie souhaitable. Bonne connaissance des principes de base des structures de protéines. Cours de biophysique de 1er cycle. |
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Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
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| Tutorials dédiés à l'utilisation du programme Pymol pour l'observation et l'analyse des structures de macromolécules. Utilisation de la base de données PDB. Résolution d'une structure de protéine in silico. |
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Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
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| A décider de commun accord avec les intervenants du cours. |
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Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
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| Les présentations PowerPoint du cours théorique seront disponibles sur CD ainsi que les notes des travaux pratiques.
Livres recommandés :
- "Crystallography made crystal clear: A guide for users for macromolecular models."
Gale Rhodes, Academic Press 2000
- "Introduction to Protein Structure" Carl Branden and John Tooze, Garland Publishing 1999
CD roms :
- PS² and Kinemage Supplement to "Introduction to Protein Structure" Carl Branden and
John Tooze, Garland Publishing 1999 |
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Modalités d'évaluation et critères :
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| A décider de commun accord avec les intervenants du cours. Probablement sur base d'un article scientifique. |
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Contacts :
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| Paulette Charlier, PhD, Chargé de CoursCristallographie des macromolécules biologiques, Centre d'Ingénierie des Protéines, Département des Sciences de la Vie, Université de Liège, Institut de Physique, B5a, B-4000 Liège, Belgium
Tel: +32 (0)4 366 36 19
Fax: +32 (0)4 366 49 54
E-mail : Paulette.Charlier@ulg.ac.be
http://www.cip.ulg.ac.be/ |
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