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| INFO0430-1 | Eléments de bioinformatique
[ english version ]
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| Durée : | 10h Th | |||||
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| Crédits/ECTS : |
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| Titulaire(s) : | N... | |||||
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| Suppléant(s) : | Olivier Peulen | |||||
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| Aperçu général : | Ce cours décrit les avancées de la bioinformatique au XXIème siècle. Les bases de données génomiques et protéomiques seront décrites. La recherche de séquences dans les bases de données sera expliquée. Certains algorithmes de détection d'exons seront exposés. Les notions de distances, de similitudes et d'homologie seront introduites. Les méthodes de dot-plots, d?alignement de séquences, de détection de séquences consensus et de design d'oligonucléotides destinés à la PCR seront introduites. Contenu : - Introduction et scénario - Outils informatiques - Constituants cellulaires et bioinformatique - Bases de données - Acides nucléiques - Protéines - Autres - Recherche de séquences - Difficultés d'analyse des séquences - Détection d'exons - Méthodes basées sur les signaux internes - Méthodes basées sur la composition en bases - Distance, similitude et homologie : signification. - Comparaison et analyse des séquences - Dot-plots - Alignement de séquences - Détection de séquences consensus - Autres outils | |||||
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| Objectif du cours : | L'étudiant devrait être capable d'utiliser les logiciels de base de la bioinformatique disponible sur le WWW et de comprendre les mécanismes sur lesquels ils sont basés. Cet apprentissage lui permettra de cerner les limites de chaque procédure. | |||||
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| Pré-requis : | Connaissance basique du Web. | |||||
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| Travaux pratiques : | Néant | |||||
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| Organisation : | Le cours sera donné au semestre 1 de la licence à raison de 2 heures par semaine pendant 5 semaines. Le cours débute le mardi 19/10 à 10H30 dans le local D50 du CHU. | |||||
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| Notes de cours : | Syllabus (~100 pages) et un CD avec la présentation powerpoint sont disponibles. Les notes de cours seront déposées chez Intercopy et sur My ULg. Les fichiers powerpoint seront déposés sur My ULg. | |||||
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| Evaluation : | Examen oral | |||||
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| Contacts : | Olivier Peulen Biochimie et Physiologie Générale Institut de Chimie B6C Tél: 04/366.35.75 E-mail: Olivier.Peulen@ulg.ac.be | |||||
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| Remarques : | Livre de référence : Introduction to Bioinformatics, Arthur M. Lesk, Oxford University Press (2002) | |||||
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ULg : Administration de l'Enseignement et des Etudiants - Affaires Académiques
Responsable de l'information : Monique Marcourt, direction A.E.E.
Date de validité des données : 27/02/2006
Réalisation SEGI