Génomique animale

Durée

28h Th, 10h TD

Nombre de crédits

Enseignant

Keith Durkin

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue française

Organisation et évaluation

Enseignement au deuxième quadrimestre

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Cours BSc: La génomique essentielle pour les vétérinaires et les sciences animales.


« La génomique essentielle pour les vétérinaires et les sciences animales » propose une introduction générale au domaine de la génomique appliquée aux animaux domestiques.

 

Le cours comprend un total de cinq sections correspondant respectivement à :

Prérequis I : Fondamentaux de biologie moléculaire du gène

Prérequis II : Fondamentaux de génétique

Chapitre I : Génomes de référence

Chapitre II : Génomes individuels

Chapitre III : Phénomes individuels

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

Au terme de cette unité d'enseignement, l'étudiant:

• Sera familiarisé avec les caractéristiques principales du génome animal, comprendra les principes de base des méthodes de séquençage ainsi que des techniques d'annotation des génomes.
• Sera familiarisé avec les principes de base de la génomique des populations et évolutive en cela compris les types de polymorphismes génétiques, les origines du polymorphisme génétique, la notion de déséquilibre de liaison, les principales méthodes de génotypage, les principes de reconstruction génomique de notre histoire évolutive et de la domestication. 
• Compréhension de la manière dont les variations du génome contribuent à la santé et aux maladies chez les animaux, y compris les traits mendéliens et le cancer.

Savoirs et compétences prérequis

1. Notions de base de biologie moléculaire du gène (structure de l'ADN/ARN/protéines, réplication, transcription, traduction, mitose, meiose) et de génétique mendéléenne (lois de Mendel, domiance, récessivité, liaison génétique)

2. Notions de base de probabilité et de statistique (moyenne, variance, covariance, correlation).

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

Les activités d'apprentissage comprennent 28h de cours théoriques  (Prérequis I&II : 6h ; Chapitre I : 6h ; Chapitre II : 6h ; Chapitre III : 8h ; ??2h de temps "tampon"), ainsi que 10h de travaux dirigés.

Pendant les travaux dirigés, les étudiants recevront du matériel supplémentaire pour mieux comprendre la théorie, des questions à choix multiples (QCM) qui sondent leur compréhension de la théorie, ainsi que des problèmes relatifs aux sections 1 à 4  du cours. Ils travailleront sous la supervision d'un ou plusieurs assistants d'enseignement. L'organisation des travaux pratiques se déroulera de manière hybride : en ligne et en présentiel.

La présence aux travaux dirigés est obligatoire.

Une absence injustifiée aux TD ne permettra pas à l'étudiant de présenter l'examen en 1ère session (note de 0).

Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)

Cours donné exclusivement en présentiel


Explications complémentaires:

En présentiel

Supports de cours, lectures obligatoires ou recommandées

Informations complémentaires:

Le contenu du cours correspond en grande partie à la première moitié du manuel « Essential Genomics for Veterinarians and the Animal Sciences » (Génomique essentielle pour les vétérinaires et les sciences animales) de Michel Georges. Les sections du livre qui seront abordées comprennent : Préalables I & II, Chapitre 1 : Génomes de référence, Chapitre 2 : Génomes individuels et Chapitre 3 : Phénomes individuels. Le livre peut être téléchargé sur GIGAUAG - Teaching ainsi que sur le site web eCampus de l'ULiège. À titre de soutien supplémentaire, les étudiants auront accès (via les mêmes pages web) aux copies des diapositives utilisées par l'enseignant pendant le cours. Ces diapositives correspondent dans une large mesure aux figures et tableaux du manuel. Les diapositives seront réalisées au fur et à mesure du déroulement du cours. Les mises à jour des notes de cours seront disponibles au fur et à mesure du déroulement du cours.

Modalités d'évaluation et critères

Examen(s) en session

Toutes sessions confondues

- En présentiel

évaluation écrite ( QCM )

Travail à rendre - rapport


Informations complémentaires:

Examen écrit comprenant comprenant des questions à choix multiples à points négatifs (+1 ; 0 ; -1 /NSP -1).

Des exercices seront à rendre au cours de la semaine de TD et compteront pour 10% de la côte final des examens de juin et de septembre.

Les étudiants absents aux TD rendront un travail côté (10% de la note final).

 

Stage(s)

Non

Remarques organisationnelles et modifications principales apportées au cours

Contacts

kdurkin@uliege.be

Association d'un ou plusieurs MOOCs

Notes en ligne