Durée
Biotechnologies végétales moléculaires : 3h Th, 18h Pr
Biotechnologie végétale en protection des plantes : 4h Th, 20h Pr
Nombre de crédits
| Master : bioingénieur en sciences agronomiques, à finalité spécialisée | 5 crédits |
Enseignant
Biotechnologies végétales moléculaires : Hervé Vanderschuren
Biotechnologie végétale en protection des plantes : Frédéric Francis, Sébastien Massart
Coordinateur(s)
Langue(s) de l'unité d'enseignement
Langue française
Organisation et évaluation
Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier
Horaire
Unités d'enseignement prérequises et corequises
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement
Biotechnologies végétales moléculaires
Modification génétique des plantes : méthodes, techniques, applications
Outils d'analyse d'expression de gène
Modification génétique des plantes : méthodes, techniques, applications
Outils d'analyse d'expression de gènes
Exercice de biotechnologies végétales
Ce cours vise à illustrer l'utilisation des biotechnologies végétales dans un contexte expérimental réaliste. Pour ce faire, différentes étapes seront réalisées par les étudiants afin de répondre à une question scientifique délivrée en début d'apprentissage :
- choix des outils biotechnologiques ; - établissement d'un plan expérimental sur base de l'état de l'art ; - réalisation de l'expérimentation ; - collecte et analyse des données ; - présentation didactique de ces dernières.
Il s'agit donc d'un cours essentiellement pratique, reposant sur un travail coordonné à l'échelle du groupe d'étudiants suivant cet enseignement. Il permettra aux étudiants d'appréhender concrètement une expérimentation tout en les menant à poser des choix raisonnés lors de chacune de ces étapes.
Biotechnologie appliquée à la lutte contre les ravageurs
Application des approches « omiques » dans les relations plantes - ravageursApplications biotechnologiques dans contrôle des ravageurs par agents microbiologiques (bactéries, virus, champignons entimopathogènes): bases théoriques des modes d'actions ainsi que les méthodes de production de ces bio-insecticides
Application de la transgénèse et diversité des OGM dans le cadre de la lutte contre les ravageurs
Biotechnologie appliquée à la phytopathologie
Cet enseignement, basé sur une évaluation permanente et l'absence d'examen en session, repose sur des applications pratiques des biotechnologies au travers de la planification, la réalisation et l'analyse technique et financière d'analyse au laboratoire (TP labo).
Aperçu général des biotechnologies et de leur impact en phytopathologie,
Mise en situation réelle en tant que responsable d'un laboratoire de diagnostic: sélection d'une biotechnologie et validation pour un laboratoire de diagnostic ou de contrôle qualité, application de cette technologie au laboratoire dans un cadre d'assurance qualité, reporting des résultats, étude comparative du coût et notion de rentabilité de l'application des biotechnologies
Introduction à un des « hypes » biotechnologiques actuels (séquençage haut-débit)
Réalisation d'une analyse bioinformatique comparative sur des données de HTS pour le diagnostic de virus
Biotechnologie végétale en protection des plantes
Partim Ravageurs
Application des approches « omiques » dans les relations plantes - ravageurs
Applications biotechnologiques dans contrôle des ravageurs par agents microbiologiques (bactéries, virus, champignons entimopathogènes): bases théoriques des modes d'actions ainsi que les méthodes de production de ces bio-insecticides
Application de la transgénèse et diversité des OGM dans le cadre de la lutte contre les ravageurs
Partim Phytopathologie
Cet enseignement, basé sur une évaluation permanente et l'absence d'examen en session, repose sur des applications pratiques des biotechnologies au travers de la planification, la réalisation et l'analyse technique et financière d'analyse au laboratoire (TP labo).
- Aperçu général des biotechnologies et de leur impact en phytopathologie,
- Mise en situation réelle en tant que responsable d'un laboratoire de diagnostic: sélection d'une biotechnologie et validation pour un laboratoire de diagnostic ou de contrôle qualité, application de cette technologie au laboratoire dans un cadre d'assurance qualité, reporting des résultats, étude comparative du coût et notion de rentabilité de l'application des biotechnologies
- Introduction à un des « hypes » biotechnologiques actuels (séquençage haut-débit)
- Réalisation d'une analyse bioinformatique comparative sur des données de HTS pour le diagnostic de virus
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement
Biotechnologies végétales moléculaires
- Comprendre ce que peut réaliser la technologie de modification génétique des plantes
- Apprendre à utiliser les outils importants des biotechnologies végétales
- Apprendre l'élaboration d'un projet de recherche à finalité "biotechnologie végétale"
Biotechnologie végétale en protection des plantes
Partim Ravageur
Face à la nécessité de contrôler les ravageurs et de développer des alternatives de lutte plus durables, il s'agit pour l'étudiant d'appréhender la diversité des organismes et approches à disposition sur base de l'application des biotechnologies et des modèles de ravageurs ciblés.
Partim Phytopathologie
- Sélectionner adéquatement une biotechnologie en fonction de la solution à apporter à un problème phytopathologique (et biologique en général)
- Développer une démarche multi-disciplinaire et transversale autour des biotechnologique en intégrant les composantes scientifiques, techniques, d'assurance qualité, réglementaire et financière.
- Travailler dans une démarche d'assurance qualité
- Apprivoiser les technologies de séquençage haut-débit et leur analyse bioinformatique
Savoirs et compétences prérequis
Biotechnologies végétales moléculaires
Cours de base en Génétique et en Biologie moléculaire
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement
Biotechnologies végétales moléculaires
- Cours participatif
- Elaboration d'un projet de recherche à effectuer dans le cadre des exercices de biotechnologies végétales
Biotechnologie végétale en protection des plantes
A côté de cours théoriques présentant les bases et les modes d'action des approches biotechnologiques proposées, des travaux pratiques sont organisés afin de mettre en oeuvre des approches "omiques" au laboratoire sur base d'une question scientifique liée aux ravageurs.
Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)
Biotechnologies végétales moléculaires
Présentiel
Biotechnologie végétale en protection des plantes
Cours théoriques en auditoire Travaux pratiques de groupe au laboratoire
Supports de cours, lectures obligatoires ou recommandées
Biotechnologies végétales moléculaires
- Portfolio de lectures communiqué via la plateforme en ligne du cours
- Diaporamas de toutes les leçons communiqués via la plateforme en ligne
Modalités d'évaluation et critères
Biotechnologies végétales moléculaires
Travail à rendre - rapport
Explications complémentaires:
L'évaluation de ce cours est basée uniquement sur la réalisation d'un travail de groupe
Biotechnologie végétale en protection des plantes
Examen(s) en session
Toutes sessions confondues
- En présentiel
évaluation orale
Travail à rendre - rapport
Informations complémentaires:
Partim Entomologie
Toutes sessions confondues :
- En présentiel
évaluation orale
- En distanciel
évaluation orale
- Si évaluation en "hybride"
préférence en présentiel
Explications complémentaires:
Un rapport de travaux pratiques est évalué et complété par un examen oral qui pourra être organisé par visoconbference en fonction des conditions sanitaires.
Partim Phytopathologie
Une évaluation continue est réalisée tout au long de la mise en situation. Il n'y a pas d'examen en session.
L'évaluation est réalisée comme suit :
1. Tenue du cahier de laboratoire et rapport d'analyse (80% des points)
Les analyses sélectionnées seront appliquées au laboratoire en suivant des protocoles fournis et en assurant une traçabilité des opérations selon les outils d'assurance qualité.
Les résultats seront interprétés en regard de la mise en situation et une conclusion rédigée
2. Analyse financière (20% des points)
Etude des coûts de réalisation de tests de diagnotic sur base de plusieurs hypothèses de départ et identification des postes majeurs de coût
Stage(s)
Biotechnologies végétales moléculaires
Toutes activités sur le campus de Gembloux
Remarques organisationnelles et modifications principales apportées au cours
Biotechnologies végétales moléculaires
Transversalité recherchée avec les autres cours du module.
Les diapositives et articles scientifiques sont mis en ligne via eCAMPUS et/ou myULG. La langue d'enseignement (anglais ou français) sera choisie en concertation avec les étudiants et en prenant en compte la présence d'étudiant(e)s non francophones.
Biotechnologie végétale en protection des plantes
Organisation du cours dans le cadre d'un module collégial - y compris pour l'évaluation
Contacts
Biotechnologies végétales moléculaires
- Herve Vanderschuren (herve.vanderschuren@ulg.ac.be)
- Adrien Blum (Adrien.Blum@uliege.be)
Biotechnologie végétale en protection des plantes
Pr Frederic FRANCIS
Tel 081 622287
Courriel Frederic.Francis@uliege.be
Pr Sebastien Massart
Association d'un ou plusieurs MOOCs
Notes en ligne
Biotechnologies végétales moléculaires
Cours 1 - Boitechnologies végétales - H Vanderschuren
diapos cours 1
Supports de cours
L'ensemble des ressources pédagogiques mises à disposition des étudiants se trouve dans la rubrique correspondante sur la plate-forme de cours en ligne eCampus.