2024-2025 / CHIM0717-1

Microbial processes and interactions

Durée

57h Th, 18h Pr, 9h AUTR

Nombre de crédits

 Master : bioingénieur en chimie et bioindustries, à finalité spécialisée8 crédits 

Enseignant

Frank Delvigne, Patrick Fickers, Philippe Jacques, Marc Ongena, Jean-Claude Twizere

Coordinateur(s)

Patrick Fickers

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue anglaise

Organisation et évaluation

Enseignement au deuxième quadrimestre

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Aborder de manière théorique et pratique les différentes technologies de production et de purification de composés d'intérêt biotechnologique (biomasse, protéines, métabolites) développées dans l'industrie agro-alimentaire, chimique et bio-pharmaceutique). Le cours détaillera les différentes technologies de culture en bioréacteur, les techniques moléculaires conduisant au développement d' «usine cellulaire» ainsi que les interactions cellules-environnement au sens large.

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

A l'issue de ce module multidisciplinaire, les étudiants seront capables d'intégrer les différents aspects du développement, de la mise en place, de l'optimisation et du contrôle d'un procédé de production d'un composé d'intérêt en bioréacteur. Le cours comprend également une partie dimensionnement assez importante (calcul de capacité de transfert d'oxygène, dynamique de croissance microbienne et de production de métabolites,...). Cette partie est complémentée par des exercices de construction de modèles dynamiques de bioprocédés mettant en oeuvre la résolution d'équations différentielles du premier ordre sous MatLab.

Savoirs et compétences prérequis

BIOL2010-1 : Biologie cellulaire

BIOL2013-2 : Microbiologie générale - Patrim 1

BIOL2013-3 : Microbiologie générale - Partim 2

BIOL2015-3 : Biologie moléculaire

BIAA0003-1 : Génie industriel alimentaire et ingénierie agro-alimentaire - 1ère partie

MATH2016-1 : mathématique générale et modélisation des systèmes dynamiques

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

- Ingéniérie des bioreacteur (F. Delvigne, Th)

- Ingeniérie métabolique (P. Fickers, P. Jacques, Th)

- Interactions microbiennes (M. Ongena, Th)

- Culture de cellules animales (JC Twizere , Th)

- Purification (filtration, centrifugation, chromatographie basse pression...) (P. Fickers,  Th)

- exercices (F. Delvigne, P. Fickers, P. Jacques )

- Laboratoire (P. Fickers, P. Jacques, M. Ongena, F. Delvigne)

- Simulations numériques (F. Delvigne, exercices)


Outre les cours ex-cathedra, le module comprend des travaux pratiques en laboratoire, des séances d'exercice (simulation numérique sur MatLab), des séminaires (intervenants du monde industriel, d'universités ou centres de recherches) et de visites d'entreprises actives dans le domaine du module. Dans ce cours, une approche pédagogique « learning by doing » sera également privilégiée au travers de travaux.

Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)

Cours donné exclusivement en présentiel


Informations complémentaires:

Cours ex-cathedra

Travaux pratiques en laboratoire

Séances d'exercice (simulation numérique sur MatLab), 

Seminaires (intervenants du monde industriel, d'universités ou centres de recherches)

Dans ce cours, une approche pédagogique « learning by doing » sera également privilégiée au travers de travaux.

Supports de cours, lectures obligatoires ou recommandées

Modalités d'évaluation et critères

Examen(s) en session

Toutes sessions confondues

- En présentiel

évaluation écrite

Travail à rendre - rapport


Informations complémentaires:

Réalisation d'un rapport individuel

Examen écrit

Stage(s)

Remarques organisationnelles et modifications principales apportées au cours

Pour des raisons de sécurité, l'accès au laboratoire n'est autorisé qu'aux étudiants officiellement inscrits. Chaque étudiant doit veiller à ne pas oublier sa blouse de laboratoire, ses lunettes de sécurité et le fascicule de TPs qui sera fourni à la première séance (un par groupes). Aucune blouse de 'secours' ne sera fourni aux distraits. Le laboratoire est un endroit potentiellement dangereux, il est strictement interdit d'y boire, manger et fumer. Il est indispensable d'y porter des chaussures fermées, des pantalons et d'attacher les cheveux longs. Les groupes de laboratoire seront définis avant la première séance et ne peuvent être modifiés ensuite. D'une façon générale, les consignes relatives à la sécurité au laboratoire de chimie doivent être respectée (vade mecum consultable à TERRA)

Contacts

Prof. Patrick Fickers

Microbial Processes and Interactions (MiPI)

Ph: 081 622 311 (direct), 081 622 305 (secretariat)

pfickers@uliege.be

Association d'un ou plusieurs MOOCs

Notes en ligne

Fickers_2022_Centrifugation_Filtration (Lecture 2)
Lecture on centrifugation and filtration

Fickers_2022_Metabolic engineering (Lecture 1)
Lecture on Metabolic Engineering

Reseaux d'interactions pour expliquer la relation genotype - phenotype
Cette presentation contient le cours tel qu'il sera exposee pour expliquer comment on passe du genotype au phenotype. Nous insistons sur les concepts d'interactions proteine - proteine  et nous donnons des examples pratiques.