2021-2022 / BIOC9245-1

Chimie des macromolécules

Durée

20h Th, 10h Pr

Nombre de crédits

 Master en biologie des organismes et écologie, à finalité3 crédits 

Enseignant

Moreno Galleni, Loïc Quinton

Coordinateur(s)

Moreno Galleni

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue française

Organisation et évaluation

Enseignement au deuxième quadrimestre

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Partim I - Chimie des Macromolécules
Chapitre 1. Propriétés et modifications chimiques des acides aminés 1.1  Modifications chimiques des chaînes latérales des acides aminés - Application biotechnologique
1.2  Modifications post-traductionnelles des acides aminés (pont disulfure, lipidation, acétylation, phosphorylation, glycosylation, hydroxylation, ubiquination, )
Chapitre 2. Introduction aux propriétés optiques des acides aminés (Absorbance, Fluorescence intrinsèque)
2.1 Absorbance et Fluorescence intrinsèque
2.2 Méthode de FRET
Chapitre 3. Technique d'électrophorèse des protéines
3.1 Principe de la méthode de séparation de biomolécules par électrophorèse
3.2 Electrophorèse sur gel d'agarose
3.3 Electrophorèse sur gel de polyacrylamide en condition native ou dénaturante (gel continu et discontinu)
3.4 Electrophoère capillaire. Principes
3.5 Isoélectrofocalisation
3.6 Electrophorèse bidimensionnelle
Chapitre 4. Introduction aux techniques de purification des protéines
4.1. Technique dosage des protéines (dosage enzymatique, ELISA et dosage de la concentration totale en protéine)
4.2 Tamis moléculaire
4.3 Echangeurs d'ions
4.4 Chromatographie par Interaction Hydrophobe et chromatographie sur phase réverse
4.5 Chromatographie d'affinité 
Partim II - Spectrométrie de Masse
 Chapitre 1. Base physique de la MS  Chapitre 2. Mesure d'une masse exacte d'une molécule biologique + méthodes de fragmentation  Chapitre 3. Application de la MS pour l'identification de modification post-traductionnelle (pont disulfure, phosphorylation, glycosylation).

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

L'objectif de ce cours est d'acquérir les principes fondamentaux qui sont à la base des propriétés des protéines, tant du point de vue de leurs fonctions que de celui de la biologie structurale. Il donnera une vision des caractéristiques générales des protéines qui sous-tendent la grande diversité des  fonctions et de leurs interactions observées dans la nature.

Savoirs et compétences prérequis

Notion de Biochimie générale
Notion de Chimie oragnique et générale
Notion de physique

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

Les travaux partiques sont organisés comme suit :
Les étudiants sont répartis par groupe de deux. Chaque groupe est alors supervisé par des doctorants ayant débuté leurs travaux depuis au moins deux ans ou par des chercheurs seniors. Les étudiants sont donc intégrés dans différents laboratoires d'acceuil. Les domaines abordés sont: une technique chromatographique de purifiction d'une protéine et l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide.

Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)

Il s'agit de cours 10 séances de deux heures de cours ex cathedra . Les travaus pratiques sont organisés durant quatre journées complètes au second quadrimestre.

Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours

Les présentations ppt du cours sont accessibles aux étudiants sur le site ecampus.

Modalités d'évaluation et critères

Examen(s) en session

Toutes sessions confondues

- En présentiel

évaluation écrite ( QCM, questions ouvertes )


Explications complémentaires:

Examen écrit. Il est important de noter que pour  obtenir une note globale supérieure à 7/20, l'étudiant ne peut pas obtenir une note inférieure ou égale à 7/20 pour d'une part le partim Chimie des Macromolécules et d'autre part pour le partim dédié à la spectrométrie de masse. Néanmoins, des dispenses partielles peuvent être obtenues.

Stage(s)

Remarques organisationnelles

Contacts

Prof Galleni Moreno - courriel: mgalleni@uliege.be - tel 04/3663549
Prof Quinton Loïc - courriel: Loic.quinton@uliege.be - tel 04/3663679