2019-2020 / GBIO0011-1

Modélisation des systèmes biologiques

Durée

26h Th, 26h Pr

Nombre de crédits

 Bachelier en sciences de l'ingénieur, orientation ingénieur civil5 crédits 
 Master : ingénieur civil biomédical, à finalité5 crédits 

Enseignant

Pierre Dauby, Liesbet Geris

Coordinateur(s)

Liesbet Geris

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue française

Organisation et évaluation

Enseignement au deuxième quadrimestre

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Le cours traite de la modélisation mathématique de processus physiologiques.
Le cours est centré sur la modélisation, la simulation, et l'analyse des phénomènes dynamiques qui interviennent dans les processus cellulaires ou dans les systèmes physiologiques.
Pour ce qui concerne l'analyse des systèmes physiologiques, on s'intéressera par exemple au système cardiovasculaire, à la contraction musculaire, au système respiratoire,...

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

L'objectif du cours est de maîtriser les outils de simulation et d'analyse mathématique de modèles dynamiques nécessaires à la compréhension des processus physiologiques de base tels qu'ils sont décrits dans la littérature scientifique.

Savoirs et compétences prérequis

formation mathématique du bachelier ingénieur civil et, dans la mesure du possible, un cours de physiologie.

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

30h de théorie et 30h de travaux pratiques,
en salle et sur ordinateur.

Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance)

Les informations concernant l'organisation pratique du cours seront disponibles sur MyUlg.

Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours

Le cours se basera sur le livre de référence
"Mathematical physiology", J. Keener
and J. Sneyd, Springer-Verlag, 2009.

Modalités d'évaluation et critères

Le cours est constitué de deux parties (modélisation au niveau cellulaire et modélisation des systèmes). Chacune de ces parties est divisée en un enseignement théorique et des travaux pratiques (devoirs pour la modélisation au niveau cellulaire et projet pour la modélisation des systèmes).
-  Chacune des deux parties du cours est évaluée de la manière suivante :

  • Un examen écrit sur la matière théorique
  • Une évaluation des TP
  • Si la plus petite note de ces évaluations est <=7, elle constitue la note globale pour la partie du cours concernée.  
  • Sinon, la note relative aux TP n'est prise en compte que si elle influence favorablement la note globale. Elle compte alors pour 30% de cette note (et la note de l'examen écrit compte pour 70%).
-  La note finale pour le cours est la moyenne des notes des deux parties, sauf si la plus petite de ces deux notes est <=7. Dans ce cas, c'est cette plus petite note qui constitue la note finale pour le cours.
-  Pour la seconde session, l'étudiant peut, à sa demande, être dispensé de repasser les évaluations pour lesquelles il a déjà obtenu une note >=12.

Stage(s)

Remarques organisationnelles

Contacts

Un des enseignants.