2018-2019 / BIOC0720-2

Structure des macromolécules biologiques

Durée

15h Th, 5h TD

Nombre de crédits

 Master en sciences biomédicales, à finalité2 crédits 
 Master en sciences biomédicales2 crédits 
 Master en bioinformatique et modélisation, à finalité2 crédits 
 Master en biochimie et biologie moléculaire et cellulaire, à finalité2 crédits 

Enseignant

Paulette Charlier

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue française

Organisation et évaluation

Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Les différentes étapes requises pour aboutir à l'image d'une biomolécule par la technique de diffraction des RX par des monocristaux seront décrites. Trois exemples, illustrant les relations structure-fonction, seront abordés, en se basant sur l'analyse d'articles de structure concernant les 3 familles de protéines abordées: - les protéines régulant la transcription du DNA, - les protéases à sérine, - les protéines membranaires

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

Ce cours donne aux futurs biochimistes les bases nécessaires pour comprendre les principes de détermination de structures 3D par radiocristallographie afin de leur permettre de faire une utilisation objective des modèles cristallographiques.

Savoirs et compétences prérequis

Cours de physique de 1er cycle. Connaissances de base en radiocristallographie et connaissance des principes de base des structures de protéines.

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

Ce cours sera donné sous la forme d'un exposé interactif à l'aide d'une présentation PowerPoint, d'une craie et d'un tableau.

Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance)

Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours

Un CD contenant l'ensemble des leçons Powerpoint, les articles scientifiques, les fichiers PDB et les tutorials y afférant, sera disponible. Livres recommandés : - "Crystallography made crystal clear: A guide for users for macromolecular models." Gale Rhodes, Academic Press 2000 - "Introduction to Protein Structure" Carl Branden and John Tooze, Garland Publishing 1999 CD roms : - PS² and Kinemage Supplement to "Introduction to Protein Structure" Carl Branden and John Tooze, Garland Publishing 1999

Modalités d'évaluation et critères

L'évaluation se fera sur la base d'un examen écrit ou oral, en fonction de l'arrangement pris entre les étudiants et les enseignants.

Stage(s)

Remarques organisationnelles

Contacts

Paulette CHARLIER, PhD, Chargé de Cours, Cristallographie des macromolécules biologiques, Centre d'Ingénierie des Protéines, Département des Sciences de la Vie, Université de Liège, Institut de Physique, B5a, B-4000 Liège, Belgium Tel: 00 32 (0)4/366.36.19 Fax: +32 (00 32 (0)4/366.49.54 http://www.cip.ulg.ac.be/ E-mail : Paulette.Charlier@ulg.ac.be