Durée
15h Th, 15h Pr
Nombre de crédits
| Master en océanographie, à finalité (MER - Erasmus mundus) | 6 crédits |
Enseignant
Langue(s) de l'unité d'enseignement
Langue anglaise
Organisation et évaluation
Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier
Horaire
Unités d'enseignement prérequises et corequises
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement
Depuis une vingtaine d'années, il est apparu que l'étude de la diversité des microorganismes marins ne peut se faire sans une approche moléculaire, étant donné que seule une fraction d'entre eux peut être isolée en culture. De plus, pour les microorganismes observables en microscopie, la diversité génétique est plus grande que celle déterminée sur base des caractères phénotypiques (morphologie...). La détermination de la diversité au niveau génétique permet aussi de comprendre des caractéristiques écologiques (distribution géographique, endémisme, etc.).
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement
Donner aux étudiants les connaissances leur permettant, d'une part de comprendre et lire de manière critique la littérature concernant la diversité des microorganismes marins, et d'autre part, d'utiliser les techniques moléculaires pour résoudre les problèmes de diversité et d'écologie moléculaire sur lesquels ils travaillent (mémoire, doctorat, etc).
Savoirs et compétences prérequis
Avoir une base de connaissances concernant le matériel génétique, ADN, ARN, protéines. Si ce prérequis est absent, un cours peut être consacré à une mise à niveau.
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement
Travail pratique au laboratoire sur un petit problème de diversité de microorganismes marins (souvent cyanobactéries)
Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)
Cours donné exclusivement en présentiel
Explications complémentaires:
Enseignement présentiel, au 1er quadrisemestre
1) Définitions
2) Pourquoi ?
3) Marqueurs moléculaires de diversité
4) Techniques moléculaires
5) Analyses phylogénétiques
6) Comment est générée la diversité génétique?
7) Examples d'applications en écologie microbienne moléculaire
8) Travaux pratiques avec extraction d'ADN génomique de souches, PCR, électrophorèse, séquençage, analyse des séquences obtenues durant les TP (seulement présentiel pour la partie expérimentale)
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours
Il s'agit d'une copie des transparents montrés
Modalités d'évaluation et critères
Presentation online d'un article scientifique et questions pour évaluer la maitrise des connaissances théoriques utiles à la compréhension de l'article
> Examen oral en ligne (mise à jour 10/12/2020)
Stage(s)
Remarques organisationnelles
Contacts
A. Wilmotte, InBios, Chimie B6,
Tél. : 04/366.33.87/38.56,
e-mail : awilmotte@uliege.be