Durée
15h Th, 15h Pr
Nombre de crédits
| Master en océanographie, à finalité | 3 crédits |
Enseignant
Coordinateur(s)
Langue(s) de l'unité d'enseignement
Langue française
Organisation et évaluation
Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier
Horaire
Unités d'enseignement prérequises et corequises
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement
Le cours consistera en une découverte de l'utilisation d'outils informatiques et statistiques adaptés pour l'analyse de sets de données biologiques. Diverses notions seront revues par le biais d'exercices, depuis des notions générales (vecteurs et matrices, tests de normalité, test d'équivalence) jusqu'à la mise en uvre de solutions complètes d'analyse exigées par des problèmes particuliers. Concrètement, le cours sera axé sur l'usage du langage R et ses divers paquets logiciels.
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement
L'objectif du cours est de familiariser l'étudiant à l'utilisation de R et des outils d'analyse statistique de données associés appliqués à l'analyse de données océanographiques. .
Savoirs et compétences prérequis
Students are encouraged to review the basics they may have already acquired in the following areas: statistics and programming.
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement
Mini-exposés théoriques, démonstrations et exercices pas à pas, travaux pratiques sur ordinateur avec défis à résoudre et exercices autonome.
Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)
Combinaison d'activités d'apprentissage en présentiel et en distanciel
Explications complémentaires:
Des videos théoriques et pratiques sont disponibles en français et en anglais pour la partie de Patrick Meyer, à l'adresse: www.bioinfo.uliege.be/classes/OCEA0224/
Le mot de passe pour accéder au contenu du cours est disponible via le forum ecampus du cours.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours
Les exercices et dapositives du cours (en pdf) sont mises en ligne avant chaque cours, à l'adresse web indiquée dans l'onglet support du cours.
For the part with Marilaure Grégoire, the book Numerical Ecology with R by iDaniel Borcard, François Gillet, Pierre Legendre est recommandé.
Modalités d'évaluation et critères
Examen(s) en session
Toutes sessions confondues
- En présentiel
évaluation écrite ( questions ouvertes )
Travail à rendre - rapport
Explications complémentaires:
L'examen consistera en un examen écrit (partie exercices en R) et un travail à rendre (partie analyse des données océanographiques).
Pour la partie introductive (Prof. Meyer) Une interrogation dispensatoire en ligne aura lieu vers novembre sur ecampus. Les détails (date, heure, processus,...) pour cette interrogation sont communiqués sur l'adresse web du cours.
Stage(s)
Remarques organisationnelles
L'emploi d'un ordinateur portable est nécessaire à toutes les séances pour le suivi de démonstrations et la réalisation d'exercices de programmation personnels. Le logiciel gratuit RStudio est accessible sur nos serveurs via n'importe quel navigateur web.
Contacts
Prof. Patrick Meyer : Patrick.Meyer@uliege.be
Prof. Marilaure Grégoire: mgregoire@uliege.be
Dr. Arthur Capet: acapet@uliege.be