Durée
5h Th, 20h TD
Nombre de crédits
| Master en bioinformatique et modélisation, à finalité | 2 crédits |
Enseignant
Langue(s) de l'unité d'enseignement
Langue anglaise
Organisation et évaluation
Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier
Horaire
Unités d'enseignement prérequises et corequises
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement
Le cours consistera en une découverte de l'utilisation d'outils informatiques et statistiques adaptés pour l'analyse de sets de données biologiques.
Diverses notions seront revues par le biais d'exercices, depuis des notions générales (vecteurs et matrices, tests de normalité, test d'équivalence) jusqu'à la mise en œuvre de solutions complètes d'analyse exigées par des problèmes particuliers.
Concrètement, le cours sera axé sur l'usage du langage R et ses divers paquets logiciels.
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement
Réflexes et autonomie pratique nécessaires pour pouvoir aborder le traitement et l'analyse de sets de données biologiques complexes avec le logiciel R, depuis la compilation de données à partir de différentes sources jusqu'à la synthèse de résultats statistiques et leur visualisation. Capacité à planifier les différentes étapes d'un processus d'analyse de données.
Savoirs et compétences prérequis
Les étudiants sont invités à revoir les bases qu'ils auraient déjà acquises dans les domaines suivants : statistique et programmation.
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement
Mini-exposés théoriques, démonstrations et exercices pas à pas, travaux pratiques sur ordinateur avec défis à résoudre et exercices autonome.
Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)
Ce cours est entièrement donné sous forme de vidéo theorique et pratique
Ce cours peut-être suivi dans sa version française ou anglaise.
Adaptations organisationnelles liées au contexte sanitaire
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours
Les exercices et leur correction ainsi que les dapositives du cours (en pdf) sont mises en ligne à l'adresse web www.bioinfo.uliege.be/classes/INFO0956/
Le mot de passe est disponible dans le forum ecampus du cours.
Modalités d'évaluation et critères
Vous trouverez ci-dessous les modalités d'évaluation envisagées pour les examens en présentiel et à distance ainsi que celle souhaitée en cas de session hybride. En fonction de l'évolution sanitaire, la modalité choisie vous sera communiquée au plus tard un mois avant le début de la session d'examen.
L'évaluation de ce cours se fait sur un examen écrit. Des petits devoirs ou interrogations pourront contribuer à la côte.
Une interro dispensatoire est prévue sur ecampus fin octobre. Les détails sont expliqués sur la page web de ce cours.
Modalité d'évaluation arrêtée le 11/12/2020 : l'examen écrit se déroulera en ligne.
Stage(s)
Remarques organisationnelles
L'emploi d'un ordinateur portable est nécessaire à toutes les séances pour le suivi de démonstrations et la réalisation d'exercices de programmation personnels.
Le logiciel gratuit RStudio est accessible via n'importe quel navigateur web.
Contacts
Prof. Patrick Meyer Institut de Botanique B22 (P70) homepage.meyerp.com/contact