2020-2021 / BIOL2040-1

Taxonomie et phylogénie des lignées chlorophylliennes

Durée

25h Th, 15h Pr, 3j T. t.

Nombre de crédits

 Master en biologie des organismes et écologie, à finalité4 crédits 

Enseignant

Nicolas Magain

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue française

Organisation et évaluation

Enseignement au deuxième quadrimestre

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Sur terre, on retrouve une très grande diversité d'organismes faisant la photosynthèse, utilisant l'énergie solaire pour produire leur énergie. Ce cours a pour but de donner à l'étudiant une idée de la diversité de ces organismes, des relations de parenté (ou non) entre elles, et des grands événements et innovations qui ont mené à la diversité actuelle.
Ce cours consiste principalement en deux parties
1. L'évolution de la lignée verte (royaume des plantes), et l'histoire évolutive et les innovations qui ont mené à la diversité actuelle des algues rouges et vertes, des bryophytes, des fougères, lycophytes, plantes à graines et à fleurs etc. Nous ferons aussi un focus sur des modes de vie particuliers tels que les plantes parasites ou carnivores.
2. La diversité des organismes photosynthétiques ne faisant pas partie de la lignée verte (algues brunes, diatomées, dinoflagellés, euglènes...) ainsi que de leurs proches parents non-photosynthétiques). Le concept clé d'endosymbiose sera abordé, pour comprendre cette grande diversité au sein de l'arbre de la vie.
Une leçon sera également consacrée aux champignons, et à leur relations aux organismes photosynthétiques.
Le but est que l'étudiant se fasse une idée concrète de la diversité des organismes photosynthétiques et de leur relations de parenté.
En plus des aspects théoriques, nous parcourrons des articles scientifiques comme études de cas, afin de voir comment la recherche en biologie évolutive se fait de nos jours, et queles sont les dernières avancées récentes.
La diversité des organismes sera illustrée via différents supports, notamment internet et vidéo.
 
 

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

-Se faire une idée de la diversité des organismes photosynthétiques sur terre, des relations de parenté entre eux, et des grands traits qui caractérisent les différents groupes. 
-Visualiser le chemin d'événements qui a mené à cette diversité actuelle
-Se rendre compte que l'évolution n'est pas linéaire et directionnelle, et de la quantité de convergence, de transferts horizontaux etc. qui ont mené à la diversité actuelle
-Pouvoir se promener dans la nature n'importe où sur terre et rattacher les différents organismes rencontrés à leur groupe taxonomioque

Savoirs et compétences prérequis

Des connaissances de base en biologie et en botanique sont un atout
Connaissances de base en biologie évolutive, notamment via le cours "Introduction à la biologie évolutive" du bloc 3 de bachelier
 
Ce cours est complémentaire à celui de Perfectionnement naturaliste qui nous permettra de voir les différents groupes sur le terrain

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

Cours classique avec support de diaporamas richement illustrés, et différents supports (vidéo, internet).
 
Lorsque cela est possible, rencontre avec des doctorants ou scientifiques en début de carrière travaillant sur les aspects vus au cours, pour se faire une idée concrète du travail de scientifique travaillant sur ces thématiques.

Séances de travaux pratiques consistant en l'identification de spécimens d'angiospermes récoltés sur le terrain lors du stage remplaçant celui des Cévennes.

Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)

En fonction des conditions sanitaires, le cours aura lieu en présentiel, à distance ou en hybride. Nous privlégions le présentiel.
 
Les séances de travaux pratiques en remplacement du stage sont obligatoires.

Adaptations organisationnelles liées au contexte sanitaire

Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours

Les lectures à faire et à intégrer au cours sont communiquées au cours

Modalités d'évaluation et critères

Vous trouverez ci-dessous les modalités d'évaluation envisagées pour les examens en présentiel et à distance ainsi que celle souhaitée en cas de session hybride. En fonction de l'évolution sanitaire, la modalité choisie vous sera communiquée au plus tard un mois avant le début de la session d'examen.

Toutes sessions confondues :

- En présentiel

évaluation écrite ( questions ouvertes )

- En distanciel

évaluation écrite

- Si évaluation en "hybride"

préférence en présentiel


Explications complémentaires:

L'évaluation est articulée en deux parties
 
(1) un examen écrit sur les thématiques vues au cours
(2) un examen pratique de détermination d'angiospermes avec flores
Le ration est de 80% pour l'examen écrit et 20% pour l'examen pratique

Stage(s)

Lors du stage rempplaceant les Cévennes, une partie du stage sera consacré au cours. Les étudiants récolteront des plantes en fleur sur le terrain. Ils les identifieront ensuite à l'aide de flores et de logiciels. 

Remarques organisationnelles

Les travaux pratiques sont organisées lors du stage remplaceant les Cévennes. Ce stage concerne trois cours "Biogéographie", "Taxonomie et phylogénie des lignées chlorophyliennes" et "Perfectionnement naturaliste". Il est fortement recommandé de prendre ces trois cours la même année.
Le déplacement de Liège vers les Cévennes s'effectue en minibus conduits par les encadrants dans la mesure des places disponibles. Un co-voiturage pourra être organisé les années où le nombre d'étudiants est particulièrement élevé.

Contacts

Nicolas Magain nicolas.magain@uliege.be

Notes en ligne

Diaporamas du cours
L'adresse permettant de télécharger les diaporamas du cours sera communiquée en temps utile