Durée
15h Th, 30h Pr
Nombre de crédits
| Master en océanographie, à finalité | 3 crédits |
Enseignant
Langue(s) de l'unité d'enseignement
Langue anglaise
Organisation et évaluation
Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier
Horaire
Unités d'enseignement prérequises et corequises
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement
Après avoir brièvement revu les bases de la bactériologie "générale" (structure morphologique et fonctionnement métabolique des bactéries) (3 heures), je décris, selon les données les plus récentes, la biodiversité des microorganismes marins (y-compris la description des techniques)(2 heures). Ensuite, on abordera les spécificités du milieu marin : approches techniques de récolte et de caractérisation des biomasses et des potentiels métaboliques en pleine eau et dans les sédiments, contrôle de la distribution et des activités des bactéries en mer, cycles du carbone, de l'azote, du phosphore et du soufre, description du fonctionnement de la boucle microbienne (8 heures). Le cours se termine par la description de quelques biocénoses bactériennes remarquables essentiellement focalisées sur le phénomène de symbiose : les macroinvertébrés des sources hydrothermales (pogonophores et bivalves) et leur microfaune associée, les bactéries symbiontes de la couche de mucus des coraux et le phénomène de blanchiment (2 heures).
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement
Dresser un tableau intégré de l'impact des bactéries dans le fonctionnement océanique.
Savoirs et compétences prérequis
Les bases de la microbiologie sont (rapidement) revues au début du cours.
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement
Approches techniques de mesures de la biomasse (épifluorescence UV et dosages d'ATP au compteur de photons), mesures des constantes de croissance et évaluation des activités métaboliques sur des populations bactériennes mixtes (masse filtrante de l'aquarium Dubuisson) (20 heures)
Initiation à l'utilisation de logiciels de calculs et de simulation en microbiologie (10 heures)
Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance)
Cinq fois 3 heures de cours à placer dans l'horaire et 5 journées de TP.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours
Syllabus distribué au début du cours
Ouvrage de référence : "Microbial Ecology of the oceans", D.L. Kirchman, Ed. Wiley-Liss Inc.
Modalités d'évaluation et critères
Examen oral à livre ouvert (deux questions), après préparation.
Stage(s)
Remarques organisationnelles
Contacts
Mathieu Poulicek - Tél 04 366 50 67 - Email: mpoulicek@ulg.ac.be