2019-2020 / GBIO0017-1

Identification paramétrique de modèles biologiques

Durée

10h Th, 10h Pr

Nombre de crédits

 Master : ingénieur civil biomédical, à finalité2 crédits 
 Master : ingénieur civil en chimie et science des matériaux, à finalité2 crédits 

Enseignant

Dominique Toye

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue française

Organisation et évaluation

Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Le cours introduit les concepts fondamentaux nécessaires à la l'évaluation et à l'analyse statistique des paramètres d'un modèle biologique
De manière générale, le cours couvre les aspects suivants :

  • Définition d'un modèle
  • Modèles linéaires
  • Modèles non linéaires
  • Interprétation d'un ajustement
  • Stratégie d'expérimentation

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

A l'issue du cours les étudiants seront capables de

  • Modéliser des processus biologiques en utilisant des lois/corrélations disponibles dans la littérature et en ajuster les paramètres.
  • Réaliser une analyse critique du choix des modèles et de la signification des paramètres.
Les séances de calcul et le travail personnel aideront les étudiants à développer des compétences plus transversales comme l'aptitude à travailler de manière autonome, à résoudre des problèmes numériques, à analyser les résultats numériques de manière critique, à évaluer la validité d'une approche théorique et à rédiger un rapport .

Savoirs et compétences prérequis

Etre capable d'utiliser les fonctions de base du logiciel Matlab

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

Le cours comprend des séances "ex-cathedra" et des travaux pratiques (10h + 10h). Les séances "ex-cathedra" sont consacrées à la description détaillée des concepts fondamentaux nécessaires à l'évaluation et à l'analyse statistique des paramètres d'un modèle biologique
Les travaux pratiques comprennent des séances d'exercices dirigés et un travail personnel. Pendant les séances d'exercices, les étudiants apprennent comment résoudre les problèmes relatifs à l'identification des paramètres d'un modèle et à l'analyse statistique de ceux-ci.
Le travail personnel porte sur l'ajustement des paramètres de différents types de modèles sur base de données expérimentales et/ou simulées. Un aspect important porte sur l'interprétation et sur l'analyse critique des paramètres.
Une séance de questions-réponses facultative est proposée aux étudiants à la fin du quadrimestre.

Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance)

Présentiel

Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours

Les notes de cours sont disponibles. Un exemplaire imprimé sera fourni aux étudiants au premier cours (pour photocopies) .
La version électronique de ces notes sera disponible via MyUlg dès le début de l'année
Les énoncés des exercices seront également distribués (version imprimée) et disponible via MyUlg (version électronique)
Une liste d'ouvrages de référence (non obligatoires) sera fournie aux étudiants via My Ulg

Modalités d'évaluation et critères

Un examen comportant une épreuve orale est organisé en janvier. Elle consiste en la présentation des résultats du travail personnel avec une argumentation sur base des concepts théoriques.
L'examen de seconde session est organisé de la même manière que l'examen de janvier, sur base d'un nouveau travail personnel.
A noter Pendant l'exposé de son travail personnel, l'étudiant peut disposer du rapport écrit qu'il a préalablement rendu.

Stage(s)

Remarques organisationnelles

Le cours est organisé pendant le premier quadirmestre (jeudi matin - semaines 1 à 6)

Contacts

Prof. Dominique TOYE Tel : 04 366 35 09 Dominique.Toye@uliege.be

Adaptation des engagements pédagogiques suite à la pandémie de COVID-19 pour la session de mai-juin

Méthodes d'apprentissage mises en œuvre : enseignement à distance

Matière de l'évaluation

Méthodes d'évaluation

Contact

Adaptation des engagements pédagogiques suite à la pandémie de COVID-19 pour la session août-sept

Matière de l'évaluation

Examen non organisé - aucun étudiant en seconde session

Méthodes d'évaluation (et plateforme utilisée)

Pas d'examen

Contact(s)

Prof. Dominique TOYE Tel : 04 366 35 09 Dominique.Toye@uliege.be