Durée
25h Th, 15h Pr
Nombre de crédits
| Master en biologie des organismes et écologie, à finalité | 3 crédits |
Enseignant
N...
Suppléant(s)
Langue(s) de l'unité d'enseignement
Langue française
Organisation et évaluation
Enseignement au deuxième quadrimestre
Horaire
Unités d'enseignement prérequises et corequises
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement
Ce cours veut faire connaître, au sein des eucaryotes, l'évolution parcourue par tous les clades qui contiennent ou qui ont contenu de la chlorophylle, et donc un mécanisme métabolique permettant d'utiliser l'énergie solaire. Il est complété par une même analyse pour le clade des champignons, jusqu'il y a peu considérés comme des plantes sans chlorophylle, mais qui, vu leur position au sein de l'arbre de la vie, sont davantage des « animaux qui ne bougent pas ».
La topologie générale de tous les eucaryotes sera donc examinée, avec présentation des scénarios évolutifs principaux et les caractéristiques propres de quasi tous les clades, avec bien entendu intégration des dernières découvertes - lesquelles sont nombreuses et passionnantes.
Un accent particulier sera mis sur la lignée des Viridiplantae, et donc sur les « algues vertes », les bryophytes, et les spermatophytes.
Selon les années, un focus sera porté sur l'un ou l'autre aspect des étapes évolutives franchies, telle que p. ex. l'association des plantes terrestres avec les champignons, ou l'évolution d'un groupe particulier d'angiospermes.
Des doctorants travaillant sur la systématique au sens large des groupes étudiés viendront exposer leur recherche et leur expérience lors de certains cours.
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement
Maîtriser l'arbre de la vie pour les eucaryotes contenant ou ayant contenu de la chlorophylle; connaître la topologie évolutive, les traits caractéristiques et les termes généraux de l'évolution des principaux clades
Etre à même de restituer les connaissances évoquées au cours; être à même de maîtriser les méthodologies de production et de traitement des données correspondantes; être à même de croiser et de manipuler les concepts et les données
Etre à même, avec les outils appropriés, de déterminer n'importe quelle plante à fleurs de notre planète
Savoirs et compétences prérequis
Connaissance normale pour un étudiant ayant envie de devenir biologiste et capacité de reconnaître les principaux groupes d'algues et de plantes vertes. Ce qu'est un bryophyte ou une algue brune ne doit avoir aucun secret pour vous, et les principales familles de plantes à fleurs, y compris la morphologie de leurs fleurs, vous sont familières.
Bonne maîtrise des techniques modernes de phylogénie faisant appel à de vastes bases de données, depuis la parcimonie jusqu'aux inférences bayesiennes.
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement
(1) Cours classique avec support de diaporamas richement illustrés, et comprenant des présentations effectuées par les étudiants sur des thématiques/sujets proposés pendant le cours. Ces présentations sont intégrées à la matière du cours
(2) Préparation par les étudiants de présentations sur des clades ou des groupes écologiques désignés d'angiospermes; les sujets sont proposés en début de semestre, et les présentations, accompagnées d'un rapport écrit, sont défendues pendant la session ou immédiatement avant celles-ci
(3) séances de travaux pratiques consistant en l'identification de spécimens d'angiospermes récoltés sur le terrain lors du stage dans les Cévennes, avec support illustré en-ligne et maîtrise des caractères évolutifs supportant cette identification
Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance)
La présence aux cours et aux séances de travaux pratiques pendant le stage est obligatoire.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours
Les lectures à faire et à intégrer au cours sont communiquées au cours
Modalités d'évaluation et critères
L'évaluation est articulée sur trois cotes : (1) un rendu du cours et des scénarios évolutifs présentés, impliquant notamment des croisements entre les différentes chapitres ; (2) le rapport écrit et oral sur le clade désigné d'angiospermes si cette partie a eu lieu; (3) le rapport du stage dans les Cévennes
La cote pour le (1) doit être supérieure à 7/20 pour que la moyenne soit calculée à raison de 60/20/20. Si la cote pour le (1) est inférieure à 7/20, elle constitue la cote globale.
Si, pour des raisons d'organisation de l'année académique, le (2) est supprimé, la cotation s'effectuera sur le ratio 75/25, et le mécanisme de calcul de la cote finale restera la même, à savoir qu'une cote inférieure à 7/20 pour la partie (1) est la cote finale.
Stage(s)
Lors du stage dans les Cévennes, une partie du stage sera consacré au cours. Les étudiants récolteront des plantes en fleur sur le terrain. Ils les identifieront ensuite à l'aide de flores et de logiciels. Ensuite, les déterminations seront utilisées pour la réalisation d'analyses statistiques de la biodiversité. Un rapport écrit sera demandé à l'issue du stage.
Remarques organisationnelles
Pas de remarque particulière à l'organisation
Contacts
Nicolas Magain nicolas.magain@uliege.be
Adaptation des engagements pédagogiques suite à la pandémie de COVID-19 pour la session de mai-juin
Méthodes d'apprentissage mises en œuvre : enseignement à distance
Les derniers cours ont été donné à distance en direct. Une version enregistrée est disponible sur eCampus.
Matière de l'évaluation
La matière vue au cours et développée dans les powerpoint disponibles sur eCampus
Méthodes d'évaluation
L'étudiant doit rédiger un travail de 5 à 10 pages. Il choisit un sujet dans la liste ci-dessous, ou propose un sujet différent à nicolas.magain@uliege.be pour le 15 mai 2020 au plus tard.
L'étudiant présente le groupe choisi du point de vue de la diversité des organismes, de leur evolution etc, en utilisant la matière vue au cours et en colmplétant par des articles scientifiques non-vus au cours. L'étudiant complète son travail par une liste bibliographique.
Images et figures autorisées (et conseillées dans des proportions raisonnables).
Critères pris en compte pour l'évaluation:
- Forme : structure, langage, clarté
- Exactitude scientifique
- Profondeur et richesse du développement du sujet (tout ne vient pas du cours, les références choisies sont intéressantes etc.)
Sujets proposés
- L'arbre de la vie des eucaryotes (placement des grands groupes etc.)
- La diversité phylogénétique des organismes photosynthétiques
- Les endosymbioses comme moteur de la diversité des organismes photosynthétiques.
- Les algues vertes*
- Les bryophytes*
- Les ptéridophytes*
- Les lycophytes*
- Les gymnospermes*
- Les angiospermes*
- L'évolution de la lignée verte
- Les plantes parasites
- Les plantes mycohétérotrophes
- Les plantes carnivores
- Les symbioses plantes-cyanobactéries
- Les symbioses plantes-champignons
- Les transferts de gènes horizontaux
- Les « myxomycètes »
*Pour les sujets 4 à 9, vous pouvez aussi choisir un sous-groupe, par exemple les Chlorophytes, les Gnétales, les Magnolidés etc.
Le rapport doit être envoyé à nicolas.magain@uliege.be pour le 26 juin à midi. Si vous êtes prêts en avance, envoyez le rapport quand il est prêt.
Contact
nicolas.magain@uliege.be
Adaptation des engagements pédagogiques suite à la pandémie de COVID-19 pour la session août-sept
Matière de l'évaluation
Le contenu des powerpoints vus lors des cours consistue la matière de l'évaluation. Ceux-ci, ainsi que les enregistrements réalisés lors des cours à distance pendant la période de confinement sont disponibles sur la plateforme eCampus.
Méthodes d'évaluation (et plateforme utilisée)
Examen oral à distance via Lifesize
Contact(s)
nicolas.magain@uliege.be
Notes en ligne
Diaporamas du cours
L'adresse permettant de télécharger les diaporamas du cours sera communiquée en temps utile