2019-2020 / BIOL0860-1

Soil ecotoxicology and bioremediation

Durée

24h Th, 12h Pr

Nombre de crédits

 Master en biologie des organismes et écologie, à finalité4 crédits 

Enseignant

Monique Carnol, Marc Hanikenne, Célia Joaquim-Justo

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue anglaise

Organisation et évaluation

Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Description du cours
L'écotoxicologie étudie les effets des produits chimiques sur les organismes présents dans l'environnement, dans le but final de protéger la structure et le fonctionnement des écosystèmes. Nous aborderons des questions spécifiques liées à l'écotoxicologie des sols, à la bioremédiation et à la phytoremédiation.
Les micro-organismes sont responsables de la transformation de nombreuses substances et leur activité peut être exploitée pour des problèmes appliqués, tels que la bioremédiation. Dans ce cours, les étudiants découvriront les interactions entre les micro-organismes, la formation de biofilms et les processus microbiens responsables de la dégradation des polluants (bioremédiation). Un aperçu des procédures utilisées pour dépolluer les sols sera fourni et certaines études de cas seront analysées.
Les plantes colonisent des environnements très divers et leur système racinaire explore et interagit avec les sols. Les plantes sont donc exploitées pour la dépollution de l'environnement (phytoremédiation). Dans ce cours, nous nous concentrerons sur la pollution métallique. Les mécanismes d'homéostasie des métaux présents dans les plantes seront discutés et la biologie d'espèces végétales particulières adaptées à la pollution par les métaux sera examinée. Différentes stratégies, exploitant la biotechnologie ou la diversité naturelle des plantes, pour la phytoremédiation des sols pollués et leurs applications dans les essais en cours sur le terrain seront présentées.
L'évaluation des risques liés à l'utilisation de polluants toxiques pour les écosystèmes terrestres repose principalement sur l'évaluation de leur impact sur les organismes du sol et les plantes. Les raisons écologiques de cette stratégie utilisée au niveau de l'UE ainsi que les tests communs utilisés seront examinées et expliquées aux étudiants.
Les travaux pratiques porteront sur les techniques utiles pour les évaluations écotoxicologiques des sols et le suivi des techniques de bioremédiation.
Une importance particulière est accordée à la compréhension des concepts théoriques et à leur application à des situations réelles.

Table des matières (résumé; en construction)
  Introduction générale
Sources et devenir des polluants dans les environnements terrestres
Effets des polluants sur la qualité du sol
Vue d'ensemble des méthodes standard pour les tests d'écotoxicologie des sols


  • Introduction générale
  • Essais biologiques à des fins réglementaires
  • Microcosmes, mésocosmes, tests sur le terrain
Bioremédiation des sols


  • Le sol comme habitat pour les microorganismes
  • Principes de la dégradation microbienne des polluants
  • Bioremédiation des sols
  • Études de cas sur la biorestauration des sols
Phytoremédiation


  • Importance des métaux dans la croissance des plantes
  • Diversité végétale et immobilisation des métaux
  • Phytoremédiation
     

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

A la fin de ce cours, les étudiants devraient être capables de:


  • discuter le concept de qualité des sols en relation avec les services écosystémiques
  • définir l'écotoxicologie des sols et défendre son utilisation pour la protection des sols
  • décrire les sources et le devenir des produits chimiques dans les environnements terrestres
  • caractériser les propriétés principales du sol et leur importance dans le devenir des contaminants du sol
  • expliquer la biodisponibilité et la mobilité des polluants
  • citer et expliquer les principales méthodes d'écotoxicologie des sols: essais biologiques individuels et méthodes d'évaluation in situ des organismes du sol
  • expliquer le rôle des micro-organismes dans la dégradation des polluants organiques
  • effectuer une évaluation quantitative des risques que présentent les polluants toxiques pour les écosystèmes terrestres
  • décrire les principaux processus utilisés dans la bioremédiation des sols
  • comprendre l'utilisation et les critères d'application d'activités microbiennes dans les processus de bioremédiation
  • appliquer des cours théoriques et techniques d'analyses d'études de cas pour aborder des problèmes de microbiologie environnementale
  • évaluer la pertinence d'une technique utilisant des micro-organismes dans la gestion de l'environnement
  • comprendre l'utilisation des plantes à des fins de phytoremédiation
  • développer une vision critique de l'utilisation des plantes transgéniques par rapport aux populations naturelles pour la phytoremédiation
 
Objectifs d'apprentissage liés aux travaux pratiques:
 


  • acquérir des compétences techniques analytiques et d'expertise pour caractériser et évaluer l'effet des polluants sur les sols
  • interpréter et discuter des résultats d'essais biologiques et d'études sur les sols en ce qui concerne l'évaluation des risques écologiques
  • analyser et interpréter les données sur le contenu en éléments provenant de tissus végétaux
  • développer des compétences de synthèse, d'interprétation et d'écriture

Savoirs et compétences prérequis

Les étudiants doivent être familiarisés avec les concepts de base d'écologie, d'écologie des sols, de chimie et d'écotoxicologie.

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

Les cours (support PowerPoint) sont basés sur les principes de «cours actifs». Les présentations comprennent des questions, des papiers minute, des études de cas et des discussions en classe. Le lien entre la théorie et la pratique pour les méthodes en écotoxicologie des sols est établi à travers les travaux pratiques.
L'intégration de cours et d'activités diverses vise à une compréhension approfondie du sujet au cours du quadrimestre. L'investissement personnel de l'étudiant pendant les cours et les activités entraînera une réduction du travail pendant la session d'examen et conduira également à une meilleure rétention des connaissances à long terme.

Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance)

La plupart des cours théoriques sont des exposés illustrées par des présentations PowerPoint, des vidéos et des diaporamas. Les sujets abordés dans le cours théorique seront illustrés et développés dans les travaux pratiques de laboratoire, les études de cas préparées par les étudiants, les analyses de données.
La présence aux cours et aux travaux pratiques (y compris la production de rapports) est obligatoire. Si un étudiant ne remplit pas ces critères, il sera considéré comme "inadmissible" à l'examen.
Toutes les ressources utiles pour le cours sont disponibles en ligne via eCampus (illustrations PowerPoint, documents, autoévaluations, informations, discussions, ...). Remarque: le téléchargement des documents est plus efficace avec une connexion haut débit. Des salles informatiques sont disponibles sur le campus.

Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours

Un document de travail pour les travaux pratiques sera fourni aux étudiants et il est vivement conseillé de le lire avant les travaux pratiques, afin de mieux comprendre le travail requis et de préparer des questions.
Des notes de cours et du matériel de lecture seront disponibles au cours de l'année. Les présentations PowerPoint seront disponibles en ligne (pdf). Pour des informations complémentaires, des ouvrages de référence sont disponibles auprès de la bibliothèque ULiège et auprès des enseignants:
Duarte A.C., Cachada A., Rocha-Santos T. (2017) Soil Pollution From Monitoring to Remediation (1st Edition), Academic Press, 312 p.

Modalités d'évaluation et critères

L'évaluation consiste en:


  • une appréciation des activités des étudiants pendant les travaux pratiques. À la fin des travaux pratiques, chaque étudiant sera invité à fournir un rapport écrit (20%).
  • un examen oral (avec préparation écrite) aura lieu pendant la session et concernera à la fois les cours théoriques et pratiques (80%).
RAPPEL (voir règles générales de l'examen): La tricherie ou le plagiat sont sévèrement sanctionnés, ce qui conduit à un score de 0/20 à l'examen. La participation aux travaux pratiques et la soumission des rapports dans les délais sont obligatoires (l'étudiant qui ne respecte pas cette règle peut être déclaré irrecevable à l'examen). Tout retard pour la remise des travaux entraine une cote de 0/20.

Stage(s)

Remarques organisationnelles

Contacts

Bureau: sur rendez-vous seulement
Laboratoire d'écologie animale et d'écotoxicologie, Institut de Chimie, Bât. B6c, Allée du 6 août, 15, 4000 Liège, Belgique:

  • Dr Célia Joaquim-Justo : Tél. 04/366.51.40 ; Fax 04/366.51.47 ; E-mail : celia.Joaquim-Justo@uliege.ac.be
  • Dr Eric Gismondi; Tél. 04/366.50.61: E-mail: Eric.Gismondi@uliege.ac.be
Laboratoire d'Ecologie Végétale et Microbienne, Bât. B22, Chemin de la Vallée, 4, 4000 Liège, Belgique (3ème étage)
  • Prof. Monique Carnol : Tel. 04/3663845 (bureau) ; Tel. 04/3663817 (laboratoire), E-mail : m.carnol@uliege.ac.be                  
Génomique fonctionnelle et imagerie moléculaire végétale, Bât. B22, chemin de la Vallée 4, 4000 Liège, Belgique (2ème étage, local 2.12)
  • Dr Marc Hanikenne : Tel. 04/3663844 (bureau) , E-mail : marc.hanikenne@uliege.be
          
     

Adaptation des engagements pédagogiques suite à la pandémie de COVID-19 pour la session de mai-juin

Méthodes d'apprentissage mises en œuvre : enseignement à distance

Matière de l'évaluation

Méthodes d'évaluation

Contact

Adaptation des engagements pédagogiques suite à la pandémie de COVID-19 pour la session août-sept

Matière de l'évaluation

Méthodes d'évaluation (et plateforme utilisée)

Contact(s)