Bactériologie vétérinaire

Durée

24h Th, 10h Pr, 2h TD

Nombre de crédits

Enseignant

Jacques Mainil

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue française

Organisation et évaluation

Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Le cours "Bactériologie vétérinaire" de 3e BAC est divisé en deux parties. La première partie est consacrée à la présentation générale de la structure et des fonctions vitales des bactéries en relation, autant que faire se peut, avec les maladies et le diagnostic de laboratoire : architecture cellulaire, métabolisme, croissance et multiplication. La deuxième partie du cours décrit les outils thérapeutiques et prophylactiques de la lutte antibactérienne et se termine par un chapitre sur les flores commensales et les propriétés de virulence des bactéries pathogènes. Les années précédentes, la systématique des bactéries pathogènes des animaux domestiques, ainsi que des bactéries les plus importantes dans le domaine des denrées alimentaires d'origine animale, était également décrite. Elle ne l'est plus depuis l'année académique 2014-2015, mais les dias Ppt seront toujours mises à la disposition des étudiants.
Les travaux pratiques permettent à l'étudiant de prendre conscience du travail réalisé dans un laboratoire de diagnostic bactériologique en médecine vétérinaire. Ces travaux pratiques de laboratoire sont en relation étroite avec le cours ex-cathedra.

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

Présenter aux étudiants les agents infectieux (ou microbes) que sont les bactéries, de manière générale, dans l'optique des bactéries importantes en santé animale et en santé publique et dans le cadre de la lutte anti-bactérienne au moyen de procédés chimiques, physiques et biologiques. Familiariser l'étudiant avec le laboratoire de diagnostic afin de lui permettre, pendant ses trois dernières années d'études et sa vie de praticien, d'analyser les réponses des laboratoires.

Savoirs et compétences prérequis

Connaissances de base en biochimie et cytologie eucaryotes.

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

Le cours théorique consiste en 24h ex-cathedra avec présentations PwPt mises à la disposition des étudiants, sauf quelques illustrations (voir notes sur eCampus). Dans la mesure du possible, des exemples tirés de la pratique vétérinaire complètent l'information.
Les laboratoires comprennent 10h de Travaux pratiques (TP) qui illustrent la matière du cours théorique et présentent le laboratoire de diagnostic bactériologique et 2h de Travaux dirigés (TD) qui accompagnent les TP.
Pendant les heures de TP (4h le lundi, 4h le mardi, 2h le jeudi et 2h le vendredi après-midi), les étudiants se familiarisent avec les bases du diagnostic bactériologique: prélèvements, ensemencements, colorations, identification, antibiogramme, interprétation des réponses. Le contenu précis des séances est, chaque année, défini et adapté en fonction du nombre d'étudiants inscrits. Les pré-requis sont les chapitres du cours théorique et les notes de TP, également présentes sur eCampus. Une séance d'information sera organisée préalablement en cours d'année. L'horaire précis est communiqué aux étudiants en début d'année académique. 

Les étudiants sont évalués de manière continue au cours de la semaine (attitude générale et spécifique). De plus, en début de première séance (lundi après-midi), les étudiants doivent répondre à un questionnaire QROC sur les pré-requis. Tout au long de la semaine, les étudiants sont invités (i) à remplir en ligne (sur eCampus) un carnet qui rend compte de la réalisation et de la compréhension des manipulations et (ii) à poser des questions aux assistants sur le cours théorique et sur les séances de laboratoire, afin de mieux se préparer à l'interrogation pratique de TP du vendredi.
NB: En cas de nécessité (un jour de congé dans la semaine par exemple), une des séances de TP sera déplacée au mercredi après-midi de la même semaine, afin de maintenir un horaire acceptable pour tout le monde.

Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance)

Les 24h de cours ex-cathedra se déroulent en présentiel dans un auditoire. Les séances de laboratoires (TP et TD) se déroulent par plus petits groupes (maximum 30 étudiants) dans une salle réservée aux travaux pratiques de bactériologie. Cette salle est classée niveau 2 de biosécurité: il est absolument INTERDIT d'y manger ou d'y boire et le port d'une blouse personnelle PROPRE de laboratoire est OBLIGATOIRE. 
ATTENTION: la présence aux TP/TD est OBLIGATOIRE. Toute absence non justifiée par un document officiel est automatiquement synonyme d'ajournement à la 1ère session. Si l'étudiant(e) ne contacte pas les organisateurs des TP/TD pour suivre des séances durant le deuxième quadrimestre, cette absence non justifiée pourra même être synonyme d'ajournement à la 2de session et d'échec de l'année pour la matière de bactériologie.
Tous les cours, TP et TD seront terminés durant le premier quadrimestre pour permettre la présentation de l'examen en janvier. Les cours seront dispensés en septembre et octobre; les TP et TD, d'octobre à décembre.

Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours

Les notes complètes, y compris pour les laboratoires, sont disponibles dans leur entièreté sur eCampus, ainsi que les dias Power Point projetées pendant le cours magistral. Ces différents fichiers de notes de cours, TP, TD sont actualisés chaque année.
Livres de référence (disponibles à la bibliothèque et/ou au service) : - Veterinary Microbiology and Microbial Disease 2nd Edition. Quinn P.J. et al. Wiley-Blackwell, UK. ISBN 978-1-4051-5823-7, 2011.
- Introduction à la microbiologie. Tortora G.J., Funke B.R., Case C.L. (adaptation française de Martin L.). ERPI, Canada. ISBN 2 7613 1345 3, 2003.
- Veterinary Microbiology. 2nd Edition. Hirsh D.C., MacLachlan N.J., Walker R.L., Blackwell Science, USA. ISBN 0 8138 0379 9, 2004.
- Color atlas of medical microbiology. de la Maza L.M., Pezzlo M.T., Shigei J.T., Peterson E.M. ASM Press, USA. ISBN 1 55581 206 6, 2004.
- Microbe. Schaechter M., Ingraham J.L., Neidhardt F.C. ASM Press, USA. ISBN 1 55581 320 8, 2006.
- Antibiogramme. Courvalin P., Leclercq R., Bingen E (Eds). 2ème Edition. Editions ESKA, France. ISBN 2 7472 0907 5, 2006.
- Microbiologie technique. Tome 1. Dictionnaire des techniques. Joffin J-N., Leyral G. 4ème Edition. Centre régional de documentation pédagogique d'Aquitaine, France. ISBN 2 86617 515 8, 2006.

Modalités d'évaluation et critères

PREAMBULE: par jurisprudence, il est permis maintenant aux etudiants de prévenir par email le professeur (jg.mainil@uliege.be) de leur décision de ne pas présenter l'examen. Ce message email aura valeur de signature, à condition (i) qu'il soit envoyé par l'étudiant lui-même; (ii) qu'il soit envoyé au moins une heure avant le début de l'examen. Tout message reçu après le début de l'examen ne sera pas valable !
En 2018-2019, les étudiants seront évalués de la manière suivante:
- Théorie (75% de la cote finale) en session. L'examen théorique de 2de session sera du même format que celui de la première session.
(a) un questionnaire à choix multiple (QCM: 25% de la cote finale): 20 questions avec bonne réponse +1, mauvaise réponse -0,5, pas de réponse 0); sans coefficient de certitude; portant sur les matières théoriques et des travaux pratiques.
(b) un questionnaire à réponses ouvertes courtes (QROC: 25% de la cote finale): 20 questions avec bonne réponse +1; mauvaise réponse -0,25; sans coefficient de certitude; portant sur les matières théoriques et des travaux pratiques;
(c) une question à réponse ouverte longue (QROL: 25% de la cote finale) à partir d'une réponse de laboratoire, avec plusieurs sous-questions sur les propriétés de l'espèce bactérienne rapportée, balayant ainsi plusieurs chapitres du cours.

- Travaux pratiques (25% de la cote finale). Pour la partie travaux pratiques, l'évaluation est légèrement différente.
(a) en première session, l'évaluation a lieu le lundi de la semaine de TP pour l'interrogation QROC de pré-requis et le vendredi de la même semaine de TP pour l'interrogation théorique et pratique (QROC, biotypage, antibiogramme). L'appréciation continue de l'étudiant au cours de la semaine de TP intervient aussi dans la note de TP.
(b) à partir de 10, la note de TP peut être reportée en 2de session (si nécessaire), mais jamais d'une année à l'autre. Lorsque la note de TP est inférieure à 10, l'étudiant doit repasser toutes les interrogations écrite et pratique (QROC pré-requis, QROC théorique, biotypage, antibiogramme) le jour de l'examen de 2de session.

Rappel: toute absence non justifiée aux TP/TD pendant l'année signifiera le refus de présenter l'examen théorique.

Stage(s)

Remarques organisationnelles

Pour des raisons pédagogiques, ce cours exige des pré-requis avant d'être suivi.

Contacts

Jacques Mainil (Professeur ordinaire) Coordinateur des cours théoriques et des travaux pratiques E-mail : JG.Mainil@uliege.be Tél. : 04/366 95 22 
Dr Damien Thiry (Assistant) Organisation et évaluation des travaux pratiques E-mail: damien.thiry@uliege.be  Tél. : 04/366 93 88
Jean-Noël Duprez (Premier Technicien) Organisation des travaux pratiques E-mail: jean-noel.duprez@uliege.be  Tél. : 04/366 40 52