Durée
25h Th, 15h Pr, 35h Proj.
Nombre de crédits
Enseignant
Langue(s) de l'unité d'enseignement
Langue anglaise
Organisation et évaluation
Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier
Horaire
Unités d'enseignement prérequises et corequises
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement
Dans ce cours, une introduction à la discipline bioinformatique est donnée. Nous le faisons en présentant aux étudiants plusieurs sous-thèmes correspondant à différentes questions de recherche. Ceux-ci incluent, mais ne sont pas limités à:
- Cartographie génétique
- Bioinformatique post-GWAS
- Sous-typage moléculaire des patients vers la médecine personnalisée
- L'interactome comme composant clé de la médecine systémique
- Réseaux pour soutenir la biologie des systèmes
Le contenu du cours peut être adapté au cours de l'année, en fonction de la nécessité de consacrer plus de temps à des sous-thèmes particuliers et aux intérêts des étudiants.
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement
A la fin du cours, les étudiants ont une idée de ce que la bioinformatique dans un contexte médical représente en tant que profession. Vu que ce cours est un cours d'introduction, les étudiants seront évalués sur des concepts clés liés à chaque sous-sujet plutôt que d'aller vers une connaissance approfondie de chaque sous domaine.
Savoirs et compétences prérequis
Le cours exige une bonne connaissance de la biomédecine ou informatique.
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement
Le cours implique principalement des sessions interactives, où les discussions dans les classes plus théoriques émergent de l'apport des étudiants. Les séances d'exercice permettent aux étudiants de voir comment les outils logiciels, liés aux questions de recherche discutées, sont utilisés et comment leurs résultats doivent être interprétés. Quelques cours seront dédiés aux conférenciers invités, qui parleront de leurs domaines de la bioinformatique.
En ce qui concerne les devoirs, trois styles de devoirs peuvent être présentés: 1) basé sur la littérature (c'est-à-dire discuter d'un article sur le sujet de la classe); 2) basée sur la programmation (c'est-à-dire ciblant les étudiants ayant de solides connaissances en informatique); 3) style classique (c'est-à-dire, type de devoirs de questions-réponses). Les élèves peuvent travailler en groupe, mais ils doivent sélectionner au moins deux styles tout au long du cours et au moins une fois un travail à la maison. Ces derniers sont présentés et discutés en classe, pour clarifier davantage les concepts abordés lors des sessions de cours théoriques ou pratiques.
Le programme de devoirs susmentionné sera adapté lorsque le nombre d'élèves est trop petit (<6).
Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance)
Face à face.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours
Etant donné la variété de sujets "hot" qui sont donnés, il n'y a pas un livre unique. Des références utiles seront données au fur et à mesure de la progression du cours.
Toute la matière du cours est affichée sur le site de cours, qui est accessible via
http://bio3.giga.ulg.ac.be/archana_bhardwaj/?Courses
Modalités d'évaluation et critères
Les étudiants sont évalués via les travaux à domicile et sur base d'un examen oral lors de la 1ère session. Présentation de tous les devoirs à temps est essentielle pour réussir ce cours, ainsi que d'avoir passé l'examen.
À la deuxième session, les étudiants devront refaire les devoirs pour lesquels ils ont joué pire, mais aussi un examen oral.
Les examens oraux sont "livre ouvert" et peuvent contenir des matières des sessions théoriques et pratiques.
Stage(s)
Remarques organisationnelles
Langue du cours: Anglais
Veuillez consulter le site web du cours pour l'information pratique et plus détaillée, y compris des tâches de matériel et de travail de note de cours.
Contacts
Kristel Van Steen - e-mail kristel.vansteen@uliege.be
Assistants:
Archana Bhardwaj - A.Bhardwaj@uliege.be
Sandra Negro
Mode de contact préféré: e-mail A.Bhardwaj@uliege.be (indiquer GBIO0009 dans le titre) ou contact personnel, après un cours ou sur rendez-vous