2017-2018 / OCEA0093-1

Molecular approaches to the diversity of marine microorganisms

Durée

15h Th, 15h Pr

Nombre de crédits

 Master en océanographie, à finalité3 crédits 

Enseignant

Annick Wilmotte

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue anglaise

Organisation et évaluation

Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Depuis une vingtaine d'années, il est apparu que l'étude de la diversité des microorganismes marins ne peut se faire sans une approche moléculaire, étant donné que seule une fraction d'entre eux peut être isolée en culture. De plus, pour les microorganismes observables en microscopie, la diversité génétique est plus grande que celle déterminée sur base des caractères phénotypiques (morphologie...). La détermination de la diversité au niveau génétique permet aussi de comprendre des caractéristiques écologiques (distribution géographique, endémisme, etc.).

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

Donner aux étudiants les connaissances leur permettant, d'une part de comprendre et lire de manière critique la littérature concernant la diversité des microorganismes marins, et d'autre part, d'utiliser les techniques moléculaires pour résoudre les problèmes de diversité et d'écologie moléculaire sur lesquels ils travaillent (mémoire, doctorat, etc).

Savoirs et compétences prérequis

Avoir une base de connaissances concernant le matériel génétique, ADN, ARN, protéines. Si ce prérequis est absent, un cours peut être consacré à une mise à niveau.

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

Travail pratique au laboratoire sur un petit problème de diversité de microorganismes marins (souvent cyanobactéries) ou présentation d'un article

Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance)

Enseignement présentiel, au 2nd semestre 1) Définitions 2) Pourquoi ? 3) Marqueurs moléculaires de diversité 4) Techniques moléculaires 5) Analyses phylogénétiques 6) Comment est générée la diversité génétique? 7) Examples d'applications en écologie microbienne moléculaire 8) présentation d'un article par les étudiants

Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours

Il s'agit d'une copie des transparents montrés

Modalités d'évaluation et critères

1) Présentation d'un article ou rapport du travail de laboratoire effectué (si l'étudiant(e) réalise une recherche en diversité moléculaire) 2) Examen théorique

Stage(s)

Remarques organisationnelles

Contacts

A. Wilmotte, CIP, Chimie B6,
Tél. : 04/366.38.56,
e-mail : awilmotte@ulg.ac.be