2017-2018 / GBIO0019-1

Introduction to synthetic biology

Durée

10h Th, 20h Pr

Nombre de crédits

 Master en bioinformatique et modélisation, à finalité3 crédits 

Enseignant

Frank Delvigne, Bernard Joris

Coordinateur(s)

Bernard Joris

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue anglaise

Organisation et évaluation

Enseignement au deuxième quadrimestre

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Ce cours, donné pour la première fois en 2012-2013, couvrira une introduction à la biologie synthétique.
Les thématiques de la partie théorique sont:

  • historique de la biologie synthétique
  • outils et approches de la biologie synthétique
  • séquençages ADN, fabrication d'ADN (« briques élémentaires »)
  • modélisation mathématique
  • mesures (microscopie, cryométrie de flux)
  • design de voies métabolique « sur-mesure »
  • design de systèmes de régulation
  • sécurité, aspects sociales et éthiques
Cette partie théorique sera suivie d'un projet de biologie synthétique (modélisation et implémentation dans E. coli).

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

Au terme du cours, l'étudiant maîtrisera les concepts de base de la biologie synthétique. Il sera capable de synthétiser virtuellement ainsi que dans E. coli de simples systèmes synthétiques.
L'utilisation de l'anglais comme langue de cours et de support de cours permet aux étudiants de développer leur compréhension à l'écoute et à la lecture de l'anglais scientifique et technique.

Savoirs et compétences prérequis

aucun

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

Le cours repose sur des exposés ex-cathedra ainsi que d'un projet de laboratoire, qui nécessitera l'utilisation d'un ordinateur pour simuler des systèmes de réactions biochimique (Matlab ou un programme de simulation de biologie systémique), ainsi que des manipulations biologique / biochimique.
Le cours est enseigné en anglais. Cependant, les étudiants peuvent poser des questions en anglais ou en français.

Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance)

présentiel

Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours

Des documents de lectures recommandées dans les pages myulg du cours.

Modalités d'évaluation et critères

Rapport détaillé individuel (style publication) sur le projet (50%) ; examen oral (50%).
La participation aux projet est un prérequis pour l'accès à l'examen final.

Stage(s)

Remarques organisationnelles

Le cours est organisé au 2ème quadrimestre à des dates à convenir.

Contacts

Franck DELVIGNE
Chimie et bio-industries  /  Bio-industries  BG1 Bio-industries Passage des Déportés 2 5030 Gembloux  Tél 081 622 311 F.Delvigne@ulg.ac.be
Bernard JORIS
Unité de Physiologie et Génétique bactériennes Centre d'Ingénierie des Protéines Institut de Chimie B6a Local 1.50b  Tél 04 366 2954  bjoris@ulg.ac.be  Secrétariat: Fabienne Julémont Tel 04 366 3341