Durée
25h Th, 15h Pr, 35h Proj.
Nombre de crédits
Enseignant
Langue(s) de l'unité d'enseignement
Langue anglaise
Organisation et évaluation
Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier
Unités d'enseignement prérequises et corequises
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement
Dans ce cours, une introduction à la discipline bioinformatique est donnée. Pour ce faire, nous présentons aux étudiants plusieurs modules d'analyses correspondant aux différentes questions de recherche.
Les sujets généralement couverts dans ce cours comprennent:
- La valeur des bases de données bioinformatiques
- L'exploration des sequences ADN
- La comparaisn des sequences ADN
- La phylogénétique
- La détection d'association pangénomiques par puce SNP
- L'analyse d'association de séquences ADN
- L'inférence de réseau de gènes
Le contenu du cours peut être adapté au cours de l'année, selon la nécessité de passer plus de temps sur des sous sujets particuliers.
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement
A la fin du cours, les étudiants ont une idée de ce que la bioinformatique représente en tant que profession. Vu que ce cours est un cours d'introduction, les étudiants seront évalués sur des concepts clés liés à chaque sous-sujet plutôt que d'aller vers une connaissance approfondie de chaque sous domaine.
Savoirs et compétences prérequis
Le cours exige une bonne connaissance de la biomédecine ou informatique.
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement
Le cours est basé en partie sur des lectures interactives ex-cathedra et en partie sur des sessions pratiques interactives. Les sessions d'exercices permettent aux étudiants de se familiariser avec les concepts théoriques introduits pendant les cours théoriques. Ils préparent les étudiants à réaliser avec succès leurs travaux à domicile.
A propos des travaux à domicile, 3 types de travaux peuvent être présentés: 1) basé sur la littérature (i.e. discuter un article lié au sujet du cours); 2) basé sur la programmation (i.e. vise les étudiants avec un fort bagage informatique); 3) style classique (i.e., travail de type questions-réponses). Les étudiants peuvent travaille en groups mais doivent sélectionner au moins 2 types au travers du cours et au moins un travail basé sur la littérature. Ces derniers sont présentés et discutés en classe pour clarifier de manière plus approfondie les concepts couverts pendant les sessions de cours théoriques et pratiques.
Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance)
Face à face.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours
Etant donné la variété de sujets "hot" qui sont donnés, il n'y a pas un livre unique. Des références utiles seront données au fur et à mesure de la progression du cours.
Toute la matière du cours est affichée sur le site de cours, qui est accessible via
bio3.giga.ulg.ac.be
ou
http://www.montefiore.ulg.ac.be/~kvansteen
Modalités d'évaluation et critères
Les étudiants sont évalués via les travaux à domicile et sur base d'un examen oral lors de la 1ère session. Présentation de tous les devoirs à temps est essentielle pour réussir ce cours.
À la deuxième session, les étudiants devront refaire les devoirs pour lesquels ils ont joué pire, mais aussi un examen oral.
Les examens oraux sont "livre ouvert" et peuvent contenir des matières des sessions théoriques et pratiques.
Stage(s)
Remarques organisationnelles
Langue du cours: Anglais
Veuillez consulter le site web du cours pour l'information pratique et plus détaillée, y compris des tâches de matériel et de travail de note de cours.
Contacts
Kristel Van Steen - e-mail kristel.vansteen@ulg.ac.be
Assistant: à déterminer
Mode de contact préféré: e-mail (indiquer GBIO0009 dans le titre) ou contact personnel, après un cours ou sur rendez-vous