Taxonomie et phylogénie des lignées chlorophylliennes

Durée

25h Th, 15h Pr

Nombre de crédits

Enseignant

Emmanuël Sérusiaux

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue française

Organisation et évaluation

Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Ce cours veut faire connaître, au sein des eucaryotes, l'évolution parcourue par tous les clades qui contiennent ou qui ont contenu de la chlorophylle, et donc un mécanisme métabolique permettant d'utiliser l'énergie solaire. Il est complété par une même analyse pour le clade des champignons, jusqu'il y a peu considérés comme des plantes sans chlorophylle, mais qui, vu leur position au sein de l'arbre de la vie, sont davantage des « animaux qui ne bougent pas ».
La topologie générale de tous les eucaryotes sera donc examinée, avec présentation des scénarios évolutifs principaux et les caractéristiques propres de quasi tous les clades, avec bien entendu intégration des dernières découvertes - lesquelles sont nombreuses et passionnantes.
Un accent particulier sera mis sur la lignée des Viridiplantae, et donc sur les « algues vertes », les bryophytes, et les spermatophytes.
Selon les années, un focus sera porté sur l'un ou l'autre aspect des étapes évolutives franchies, telle que p. ex. l'association des plantes terrestres avec les champignons, ou l'évolution d'un groupe particulier d'angiospermes.

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

Maîtriser l'arbre de la vie pour les eucaryotes contenant ou ayant contenu de la chlorophylle; connaître la topologie évolutive, les traits caractéristiques et les termes généraux de l'évolution des principaux clades
Etre à même de restituer les connaissances évoquées au cours; être à même de maîtriser les méthodologies de production et de traitement des données correspondantes; être à même de croiser et de manipuler les concepts et les données
Etre à même, avec les outils appropriés, de déterminer n'importe quelle plante à fleurs de notre planète

Savoirs et compétences prérequis

Connaissance normale pour un étudiant ayant envie de devenir biologiste et capacité de reconnaître les principaux groupes d'algues et de plantes vertes. Ce qu'est un bryophyte ou une algue brune ne doit avoir aucun secret pour vous, et les principales familles de plantes à fleurs, y compris la morphologie de leurs fleurs, vous sont familières.
Bonne maîtrise des techniques modernes de phylogénie faisant appel à de vastes bases de données, depuis la parcimonie jusqu'aux inférences bayesiennes.

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

 (1) Cours classique avec support de diaporamas richement illustrés, et comprenant des présentations effectuées par les étudiants sur des thématiques/sujets proposés pendant le cours. Ces présentations sont intégrées à la matière du cours
(2) Préparation par les étudiants de présentations sur des clades ou des groupes écologiques désignés d'angiospermes; les sujets sont proposés en début de semestre, et les présentations, accompagnées d'un rapport écrit, sont défendues pendant la session ou immédiatement avant celles-ci
(3) séances de travaux pratiques consistant en l'identification de spécimens frais d'angiospermes avec support illustré en-ligne et maîtrise des caractères évolutifs supportant cette identification

Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance)

La présence aux cours et aux séances de travaux pratiques est obligatoire.

Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours

Les lectures à faire et à intégrer au cours sont communiquées au cours

Modalités d'évaluation et critères

L'évaluation est articulée sur trois cotes : (1) un rendu du cours et des scénarios évolutifs présentés, impliquant notamment des croisements entre les différentes chapitres ; (2) le rapport écrit et oral sur le clade désigné d'angiospermes ; (3) le résultat d'un examen de travaux pratiques, identiques à ceux qui auront été menés.
La cote pour le (1) doit être supérieure à 7/20 pour que la moyenne soit calculée à raison de 50/25/25. Si la cote pour le (1) est inférieure à 7/20, elle constitue la cote globale.
Il n'y aura pas de discussion par courriel de la cote globale, ni des cotes des différents segments de l'examen. Si l'étudiant échoue en 1è session, la 2è session comporte obligatoirement les parties (1) et (3).
Si, pour des raisons d'organisation de l'année académique, le (2) est supprimé, la cotation s'effectuera sur le ratio 75/25, et le mécanisme de calcul de la cote finale restera la même, à savoir qu'une cote inférieure à 7/20 pour la partie (1) est la cote finale.

Stage(s)

Pas de stage demandé

Remarques organisationnelles

 Pas de remarque particulière à l'organisation

Contacts

 S'adresser au Prof. Emmanuël Sérusiaux

Notes en ligne