Programme des cours 2016-2017
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| Biologie des systèmes | |||||
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Durée :
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| 10h Th, 10h TD | |||||
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Nombre de crédits :
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Nom du professeur :
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| Patrick Meyer | |||||
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Langue(s) de l'unité d'enseignement :
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| Langue française | |||||
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Organisation et évaluation :
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| Enseignement au deuxième quadrimestre | |||||
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Unités d'enseignement prérequises et corequises :
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| Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme | |||||
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Contenus de l'unité d'enseignement :
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| Ce cours d'Introduction à la Biologie des Systèmes présente différentes approches de modélisations et de représentations de plusieurs niveaux des systèmes biologiques.
En particulier, les réseaux transcriptomiques, de protéines et métaboliques seront introduits. Quelques méthodes d'inférence et de validation de ces réseaux à partir des données issues des Nouvelles Générations de méthodes de Séquençage (NGS) seront détaillées. Les exercices relatifs au cours sont donnés en salle informatique, principalement en R. A ce stade des études, les bases du language R sont considérées comme acquises. |
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Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement :
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| L'objectif de ce cours est de 1)connaître et 2) pouvoir utiliser des méthodes simples d'analyse de systèmes biologiques. | |||||
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Savoirs et compétences prérequis :
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Prérequis
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Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
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| Le cours est divisé en deux parties, une partie ex-cathedra et une partie pratique sur ordinateur dans laquelle les méthodes discutées dans la première partie seront mises en pratique. | |||||
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Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
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| Bien que non-obligatoire, il est fortement recommandé de venir aux sessions pratiques sur ordinateur qui préparent à l'examen et à la maitrise de la matière.
Afin de pouvoir être efficace et directement opérationel aux sessions pratiques, il est aussi fortement recommandé de venir au cours théoriques car une grande quantité d'information est transmise oralement pendant le cours. Le mode d'enseignement est donc principalement présentiel. |
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Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
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| Il s'agit d'un cours donné oralement. Quelques notes jugèes non-indispensables à la réussite pourront être transmises avant chaque séance. | |||||
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Modalités d'évaluation et critères :
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| Les étudiants sont évalués à travers un examen essentiellement pratique, avec des questions similaires aux exercices vus pendant l'année. Quelques questions théoriques ou de réflexions peuvent aussi être ajoutées à l'examen pratique.
L'examen est partiellement à livre ouvert. Certaines sources d'information seront mises à disposition le jour de l'examen (comme les dias et les exercices du cours) et les autres seront interdites (notes manuscrites, livres, internet,...). L'examen est prévu en salle informatique avec une durée initiale de deux heures (1h30 additionnelle pourra être obtenue avec un impact sur la cotation). L'examen est écrit en première session et pourra être un oral en seconde session. |
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Stage(s) :
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Remarques organisationnelles :
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| Le cours est composé de 5 séances theoriques de 2h suivies chacune de 5 séances pratiques de 2h. Toutes les séances ont lieu dans la salle de Labo B (étage -1) du B22, sur les ordinateurs de la salle. | |||||
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Contacts :
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| Prof. Patrick Meyer
Département des Sciences de la Vie
Bât. B22, local 3/03 Campus du Sart-Tilman Chemin de la Vallée, 4 4000 Liège - Belgique Tél: 04/366 3030 email: patrick.meyer@ulg.ac.be(Patrick.Meyer@ulg.ac.be ) Assistant: Damien Sirjacobs ( d.sirjacobs@ulg.ac.be ) |
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