Programme des cours 2015-2016
GBIO0019-1  
Introduction to synthetic biology
Durée :
10h Th, 20h Pr
Nombre de crédits :
Master en bioinformatique et modélisation, à finalité 3
Master en bioinformatique et modélisation, à finalité 3
Nom du professeur :
Frank Delvigne, Bernard Joris
Coordinateur(s) :
Bernard Joris
Langue(s) du cours :
Langue anglaise
Organisation et évaluation :
Enseignement au deuxième quadrimestre
Unités d'enseignement prérequises et corequises :
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus du cours :
Ce cours, donné pour la première fois en 2012-2013, couvrira une introduction à la biologie synthétique.
Les thématiques de la partie théorique sont:
  • historique de la biologie synthétique
  • outils et approches de la biologie synthétique
  • séquençages ADN, fabrication d'ADN (« briques élémentaires »)
  • modélisation mathématique
  • mesures (microscopie, cryométrie de flux)
  • design de voies métabolique « sur-mesure »
  • design de systèmes de régulation
  • sécurité, aspects sociales et éthiques
Cette partie théorique sera suivie d'un projet de biologie synthétique (modélisation et implémentation dans E. coli).
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
Au terme du cours, l'étudiant maîtrisera les concepts de base de la biologie synthétique. Il sera capable de synthétiser virtuellement ainsi que dans E. coli de simples systèmes synthétiques.
L'utilisation de l'anglais comme langue de cours et de support de cours permet aux étudiants de développer leur compréhension à l'écoute et à la lecture de l'anglais scientifique et technique.
Savoirs et compétences prérequis :
aucun
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
Le cours repose sur des exposés ex-cathedra ainsi que d'un projet de laboratoire, qui nécessitera l'utilisation d'un ordinateur pour simuler des systèmes de réactions biochimique (Matlab ou un programme de simulation de biologie systémique), ainsi que des manipulations biologique / biochimique.
Le cours est enseigné en anglais. Cependant, les étudiants peuvent poser des questions en anglais ou en français.
Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
présentiel
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
Des documents de lectures recommandées dans les pages myulg du cours.
Modalités d'évaluation et critères :
Rapport détaillé individuel (style publication) sur le projet (50%) ; examen oral (50%).
La participation aux projet est un prérequis pour l'accès à l'examen final.
Stage(s) :
Remarques organisationnelles :
Le cours est organisé au 2ème quadrimestre à des dates à convenir.
Contacts :
Franck DELVIGNE
Chimie et bio-industries  /  Bio-industries  BG1 Bio-industries Passage des Déportés 2 5030 Gembloux  Tél 081 622 311 F.Delvigne@ulg.ac.be
Bernard JORIS
Unité de Physiologie et Génétique bactériennes Centre d'Ingénierie des Protéines Institut de Chimie B6a Local 1.50b  Tél 04 366 2954  bjoris@ulg.ac.be  Secrétariat: Fabienne Julémont Tel 04 366 3341