Programme des cours 2015-2016
GBIO0017-1  
Identification paramétrique de modèles biologiques
Durée :
10h Th, 10h Pr
Nombre de crédits :
Master en ingénieur civil biomédical, à finalité2
Master en ingénieur civil biomédical, à finalité2
Master en bioinformatique et modélisation, à finalité 2
Master en bioinformatique et modélisation, à finalité 2
Nom du professeur :
Dominique Toye
Langue(s) du cours :
Langue française
Organisation et évaluation :
Enseignement au premier quadrimestre, examen en juin
Unités d'enseignement prérequises et corequises :
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus du cours :
Le cours introduit les concepts fondamentaux nécessaires à la l'évaluation et à l'analyse statistique des paramètres d'un modèle biologique
De manière générale, le cours couvre les aspects suivants :
  • Définition d'un modèle
  • Modèles linéaires
  • Modèles non linéaires
  • Interprétation d'un ajustement
  • Stratégie d'expérimentation
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
A l'issue du cours les étudiants seront capables de
  • Modéliser des processus biologiques et en ajuster les paramètres.
  • Réaliser une analyse critique du choix des modèles et de la signification des paramètres.
Les séances de calcul et le travail personnel aideront les étudiants à développer des compétences plus transversales comme l'aptitude à travailler seul ou en équipe, à résoudre des problèmes numériques, à analyser les résultats numériques de manière critique, à évaluer la validité d'une approche théorique et à rédiger un rapport .
Savoirs et compétences prérequis :
Pas de pré-requis
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
Le cours comprend des séances "ex-cathedra" et des travaux pratiques (10h + 10h). Les séances "ex-cathedra" sont consacrées à la description détaillée des concepts fondamentaux nécessaires à l'évaluation et à l'analyse statistique des paramètres d'un modèle biologique
Les travaux pratiques comprennent des séances d'exercices dirigés et un travail personnel. Pendant les séances d'exercices, les étudiants apprennent comment résoudre les problèmes relatifs à l'identification des paramètres d'un modèle et à l'analyse statistique de ceux-ci.
Le travail personnel porte sur l'ajustement des paramètres de différents types de modèles sur base de données expérimentales et/ou simulées. Un aspect important porte sur l'interprétation et sur l'analyse critique des paramètres.
Une séance de questions-réponses facultative est proposée aux étudiants à la fin du quadrimestre.
Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
Présentiel
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
Les notes de cours sont disponibles. Un exemplaire imprimé sera fourni aux étudiants au premier cours (pour photocopies) .
La version électronique de ces notes sera disponible via MyUlg dès le début de l'année
Les énoncés des exercices seront également distribués (version imprimée) et disponible via MyUlg (version électronique)
Une liste d'ouvrages de référence (non obligatoires) sera fournie aux étudiants via My Ulg
Modalités d'évaluation et critères :
Un examen comportant une épreuve orale est organisé en juin. Elle consiste en la présentation des résultats du travail personnel avec une argumentation sur base des concepts théoriques.
L'examen de seconde session est organisé de la même manière que l'examen de juin, sur base d'un nouveau travail personnel.
A noter Pendant l'exposé de son travail personnel, l'étudiant peut disposer du rapport écrit qu'il a préalablement rendu.
Stage(s) :
Remarques organisationnelles :
Contacts :
Prof. Dominique TOYE Tel : 04 366 35 09 Dominique.Toye@ulg.ac.be