Programme des cours 2015-2016
GBIO0002-1  
Genetics and bioinformatics
Durée :
30h Th, 30h Pr
Nombre de crédits :
Bachelier en sciences de l'ingénieur, orientation ingénieur civil5
Bachelier en sciences de l'ingénieur, orientation ingénieur civil5
Master en ingénieur civil biomédical, à finalité5
Master en ingénieur civil en informatique, à finalité 5
Master en ingénieur civil en informatique, à finalité 5
Master en sciences informatiques, à finalité5
Master en sciences informatiques, à finalité5
Nom du professeur :
Franck Dequiedt, Kristel Van Steen
Coordinateur(s) :
Franck Dequiedt, Kristel Van Steen
Langue(s) du cours :
Langue anglaise
Organisation et évaluation :
Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier
Unités d'enseignement prérequises et corequises :
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus du cours :
Dans ce cours, on trouve une introduction aux concepts de génétique qui sont nécessaires pour comprendre une sélection de problèmes d'analyse de données liées à la bioinformatique. Pour résoudre ces problèmes, une variété d'outils analytiques sera expliquée et illustrée. Différents sujets comprennent typiquement :  
 


  • Le génome et les marqueurs génétiques [Génétique]
  • Les études d'association pangénomiques [Analytique]
  • Les technologies de séquençage [Génétique]
  • Les comparaisons de séquences [Analytique]
  • Le transcriptome et le génome [Génétique]
  • Les forêts d'arbres décisionnels pour découvrir les interactions biologiques [Analytique]
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
A la fin du cours, les étudiants ont acquis une certaine connaissance de la génétique (en particulier  les aspects relatifs à la génomique, la transcriptomique et les technologies utilisées) et d'une sélection d'outils analytiques de pointe tout en restant basiques. Les étudiants seront évalués sur des concepts clés liés à la génétique et les approches analytiques  présentées pendant le cours. (en ce compris leurs avantages et désavantages, ainsi ques les contextes généraux).
Savoirs et compétences prérequis :
Un bagage en biomédecine ou informatique est utile mais pas essentiel
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
Le cours est basé en partie sur des lectures interactives ex-cathedra et en partie sur des sessions pratiques interactives.  Les sessions d'exercices permettent aux étudiants de se familiariser avec les concepts théoriques introduits pendant les cours théoriques.  Ils préparent les étudiants à réaliser avec succès leurs 3 travaux à domicile.  A propos des travaux à domicile, 2 types de travaux sont présentés : 1) basé sur la littérature  (i.e. discuter un article lié au sujet du cours; 2) un travail à domicile classique qui peut contenir un mélange de questions théoriques et des questions d'analyse de données. Les étudiants peuvent travailler en groupes.  A la fin du cours, chaque groupe devrait avoir sélectionné chaque type de travail à domicile au moins une fois.  Les travaux à domicile basés sur la littérature seront discutés en classe
Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
Présentiel
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
Il n'y a pas de livre obligatoire. Des références utiles seront données au fur et à mesure de la progression du cours. Toute la matière du cours se trouve sur le site : http://www.montefiore.ulg.ac.be/~kbessonov/courses.html
Modalités d'évaluation et critères :
Les étudiants sont évalués via leurs travaux à domicile et sur base d'un examen écrit lors de la 1ère session.  Au cours de la seconde session, les étudiants seront évalués uniquement via un examen écrit.  L'examen couvre la matière des sessions théoriques et pratiques.
Stage(s) :
Remarques organisationnelles :
Langue du cours: Anglais/ Français
Le cours a lieu lors du premier quadrimestre.  L'agenda détaillé et les communications sont disponibles sur le site web du cours.
Examens: Cours du premier semestre. Examen écrit en janvier
         
Contacts :
Kristel Van Steen - e-mail kristel.vansteen@ulg.ac.be
Franck Dequiedt - e-mail fdequiedt@ulg.ac.be Assistant: Kyrylo Bessonov -  e-mail kbessonov@ulg.ac.be
Mode de contact préféré: e-mail (indiquer GBIO0002 dans le titre) ou contact personnel, après un cours ou sur rendez-vous