Programme des cours 2015-2016
BIOL2038-1  
Ecologie et microbiologie des sols
Durée :
25h Th, 10h Pr, 1j T. t.
Nombre de crédits :
Bachelier en sciences biologiques3
Bachelier en sciences biologiques3
Master en biologie des organismes et écologie, à finalité 3
Master en sciences biologiques3
Nom du professeur :
Monique Carnol
Langue(s) du cours :
Langue française
Organisation et évaluation :
Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier
Unités d'enseignement prérequises et corequises :
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus du cours :
Table des matières Ce cours d'écologie et de microbiologie du sol aborde trois thématiques principales:
  • Module 1: Comment fait-on de l'écologie? - approche scientifique
  • Module 2: Ecologie des sols
  • Module 3: Ecologie microbienne et cycles biogéochimiques
Description du cours S'appuyant sur les notions fondamentales d'écologie enseignées en 2ème bachelier, l'étudiant est amené tout d'abord à s'interroger sur la signification de l'écologie scientifique. Il s'ensuit une réflexion sur les méthodes d'études en écologie et sur les démarches indispensables (démarche scientifique, stratégies d'échantillonnage) pour acquérir des connaissances objectives. Cet enseignement pose les bases de l'approche scientifique, appliquée dans d'autres cours du cursus et utile à la réalisation du mémoire de fin d'études. L'écologie des sols porte sur les composantes abiotiques et biotiques des sols, ainsi que sur l'interaction de ces deux composantes. La dernière partie du cours porte sur le rôle des micro-organismes dans les cycles biogéochimiques, les conséquences de leurs actions sur l'environnement et leur utilisation dans quelques exemples pratiques.
 
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
Savoir: Acquisition des connaissances de base sur :
  • La nature de l'écologie
  • Les méthodes d'étude en écologie
  • La démarche scientifique et la planification des études scientifiques
  • L'environnement physico-chimique du sol
  • Les composantes biotiques du sol
  • La genèse et la classification des sols
  • La diversité et le métabolisme microbien
  • L'intervention des micro-organismes dans les cycles de carbone, azote et soufre, les conséquences environnementales de leurs activités et l'influence des activités anthropiques
Savoir faire: Transfert (application) de ces connaissances de base à des situations réelles:
  • Compréhension et utilisation de la terminologie spécifique à l'étude des écosystèmes
  • Mobilisation des connaissances théoriques pour analyser, critiquer et améliorer un protocole d'étude
  • Compréhension de l'influence des propriétés physico-chimiques de sol sur la disponibilité en eau, en nutriments, la présence et l'activité des microorganismes
  • Compréhension du fonctionnement des processus microbiens dans divers habitats et des relations réciproques entre les facteurs de l'environnement et les micro-organismes.
Savoir être:
  • Prise de conscience de la diversité des approches d'études, de leur complémentarité et de la nécessité d'une démarche d'étude rigoureuse
  • Prise de conscience de la variabilité spatiale et temporelle des phénomènes en écologie
  • Développement d'un esprit critique face à la littérature scientifique
  • Pratique de techniques de travail en groupe, d'analyse et de communication
  • Prise de conscience de la complexité du sol, de l'importance des composantes abiotiques et biotiques pour la nutrition des plantes et le 'fonctionnement' du sol
  • Prise de conscience de la diversité, de la variabilité, de la complexité et de l'importance des processus microbiens dans l'environnement
Chaque module comprend également des objectifs spécifiques, identifiant clairement ce que l'étudiant sera capable de faire au terme du cours.


 
Savoirs et compétences prérequis :
Des notions de base et approfondies en microbiologie, chimie, biochimie et écologie sont utiles, mais pas indispensables à la compréhension du cours. Une compréhension à la lecture de l'anglais scientifique est requise pour une activité d'apprentissage qui comprend la consultation d'un article scientifique rédigé en anglais.
Prérequis: BIOL518-1  MATH0009-1
Co-requis:  
BIOL0017-1  STAT0203-1
Notions de base d'écologie générale vues en 2ème Bachelier en biologie dans le cadre du cours de "biodiversité et écologie".
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
Les exposés magistraux (support power point) sont construits selon les principes des 'exposés actifs'. Les présentations sont ponctuées de questions de réflexion dans le cours, papier minute, des études de cas, ainsi que de discussion en classe. La relation théorie-pratique pour les méthodes d'études est effectuée via l'analyse coopérative d'articles scientifiques en rapport avec théorie sur la méthode scientifique appliquée à l'écologie. L'étude des sols est approfondie lors des travaux pratiques donnés par séries d'étudiants en petits groupes. Pour chaque cycle biogéochimique, des exemples de conséquences pour l'environnement et/ou des études de cas sont intégrés dans le cours, parfois illustrés par de petites séquences vidéo. Des tests d'autoévaluations sont accessibles via eCampus. Lors de l'excursion de terrain, des études en cours et des caractéristiques de sols sont illustrées en forêt.
L'intégration du cours magistral et des activités accomplies par les étudiants a notamment pour but l'assimilation de la matière pendant le quadrimestre. L'investissement personnel pendant le cours magistral et lors des activités diminuera la charge de travail lors de la session et favorisera également la rétention à moyen-long terme.
Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
L'ensemble des ressources nécessaires pour ce cours est centralisé dans l'espace du cours sur eCampus (diapositives du cours, documents pour consultation, autoévaluations, informations, forum de discussion...). Remarque : le téléchargement de documents est plus rapide via une connexion à haut débit. Plusieurs salles informatiques sont accessibles au sein de l'université (http://www.ulg.ac.be/upload/docs/application/pdf/2012-07/salles_informatiques_publiques_pour_les_etudiants.pdf) et l'université est dotée d'un réseau WiFi important.
La présence des étudiants est requise et obligatoire aux travaux pratiques .L'absence aux travaux pratiques et excursion de terrain rend l'étudiant non délibérable en 1ère et en 2ème session. Si un gros problème devait empêcher un étudiant de participer à ces travaux pratiques, il doit impérativement en informer le l'enseignant.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
Une liste de lectures optionnelles est fournie aux étudiants dans les documents du cours. Les ouvrages de référence sont disponibles dans le Laboratoire d'Ecologie Végétale et Microbienne (consultation en salle, sur rendez-vous).
Des notes destinées à aider à la compréhension du cours théorique apportent des informations sur les notions à acquérir. Les illustrations sous la forme de présentations "power-point" ainsi que ces notes sont disponibles sur e-campus. Les étudiants doivent mettre en relation les notes et les illustrations ainsi que les informations complémentaires données au cours théoriques pour se constituer leurs propres notes de cours.
Modalités d'évaluation et critères :
L'évaluation des étudiants consiste en :


  • une appréciation de leur activité lors des travaux pratiques.
  • un examen écrit, en session (janvier), sur les matières du cours théorique et sur les matières abordées lors des travaux pratiques et de l'excursion de terrain.
RAPPEL (voir règlement général des examens): Toute fraude ou plagiat sont sévèrement sanctionnés et entrainent notamment une note de 0/20 à l'examen final. La participation aux travaux pratiques et à l'excursion, ainsi que la remise de rapports sont obligatoires (l'étudiant qui n'aurait pas participé aux activités indissociables de l'enseignement concerné peut être déclaré irrecevable à l'examen).


 
Stage(s) :
Remarques organisationnelles :
Le cours se donne au premier quadrimestre les mardis 9-12h30 et mercredis de 10h30 à 12h00. Un calendrier détaillé est distribué aux étudiants lors du premier cours. Les travaux pratiques se donnent par demi-journée (voir calendrier). Les étudiants doivent se munir de leur tablier et d'une calculatrice.
VOIR: horaire sur le site de la Faculté des Sciences
Contacts :
Bureau: uniquement sur rendez-vous (contact par email, forum de discussion eCampus, téléphone, ou avant/après cours pour prendre un rendez-vous)
Laboratoire d'Ecologie Végétale et Microbienne, Institut de Botanique, Bât. B22, Chemin de la vallée, 4, 4000 Liège, Belgique (Parking 70, 3ème étage) Prof. Monique Carnol : Tel. 04/3663845 (bureau) ; Tel./fax. 04/3663817 (laboratoire), E-mail : m.carnol@ulg.ac.be Dr. S. Malchair : Tel. 04/3663866 (bureau) ; E-mail : s.malchair@ulg.ac.be
Notes en ligne :
Lien eCampus
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