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| Version 2013-2014 |
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| MICR1714-1 | Microbiologie générale
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| Durée : | 16h Th, 10h Pr |
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| Nombre de crédits : |
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| Nom du professeur : | Marie-Pierre Hayette, Pierrette Melin |
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| Coordinateur(s) : | Pierrette Melin |
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Langue(s) du cours :
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| Langue française |
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Contenus du cours :
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| - Ce cours introduit l'étudiant à l'univers invisible des microbes et à leurs rôles essentiels dans notre vie quotidienne: la plupart des microbes sont bénéfiques et protègent notre biosphère, une minorité est responsable de maladies. Les microorganismes sont ubiquitaires et vivent dans des écosystèmes très variés et complexes. Leurs rôles dans les différents écosystèmes et celui de l'homme qui en agissant sur l'environnement influence l'évolution des microorganismes responsables de maladies émergeantes, sont mis en évidence.
- La microbiologie est un domaine très complexe et évolutif. La connaissance des caractéristiques spécifiques des microorganismes aide à la compréhension du développement de maladies infectieuses et des moyens disponibles pour les contrôler.
- Les microbes sont divisés en 4 grands groupes: les virus, les bactéries, les champignons et les parasites. Les bactéries représentent la forme de vie la plus ancienne, à l'origine de l'évolution des formes de vie que nous connaissons.
- La découverte des microorganismes et la caractérisation de leurs structures ont été conditionnées par le développement de la microscopie. Les principes fondamentaux de la vie microbienne, les caractéristiques des microorganismes, ainsi que leurs interactions avec l'environnement et les autres organismes vivants, en particulier avec l'homme, sont développés. L'impact des microorganismes sur les différents cycles bio-géochimiques de notre planète est essentiel à toute survie. Dans leur environnement les microorganismes interagissent entre eux modulant positivement ou négativement leur développement. La plasticité de leur génome leur permet des échanges horizontaux entre espèces, caractéristique à l'origine de l'évolution mais aussi de l'émergence de variants plus virulents ou plus résistants. Les bactéries possèdent des structures cellulaires uniques qui peuvent devenir la cible d'agents antimicrobiens ou des facteurs d'identification et de stimulation d'une réponse immunitaire.
- Les interactions entre les microbes et l'homme sont complexes: d'une simple colonisation transitoire à l'établissement d'une relation symbiotique à long terme, avec parfois la déclaration d'une maladie. L'issue de ces relations dépend de la virulence des microorganismes, du site exposé et de la capacité de l'homme à se défendre contre les microorganismes. Le rôle des microorganismes opportunistes est évoqué. Une variété d'agents antimicrobiens peut inhiber le développement des microorganismes ou les éliminer, mais avec l'utilisation d'agents antimicrobiens, l'homme induit aussi une pression sélective favorable aux bactéries qui ont développé des mécanismes de résistance.
- Les différentes approches du contrôle et prévention des maladies infectieuses sont décrites: l'amélioration de l'hygiène, l'accessibilité à l'eau potable, l'utilisation d'agents antimicrobiens, l'immunoprophylaxie, la stérilisation, l'usage d'agents antiseptiques et désinfectants.
- Dans une seconde partie du cours, les caractéristiques et propriétés des levures et champignons sont exposés, ainsi que celles des protozoaires et des helminthes. Les différents types de cycles parasitaires sont décrits et des illustrations y sont associées.
- Les travaux pratiques introduisent les notions de biosécurité, les règles incontournables de l'hygiène comme le lavage des mains et les techniques de base utilisées en microbiologie.
Table des matières
- Introduction
- Un peu d'histoire
- Le monde microbien
- Les bactéries, cellules procaryotes
- Les aspects bénéfiques des microbes
- Concepts de maladie infectieuse et cycle
- Contrôle des maladies infectieuses: prévention et approche thérapeutique
- Les fungi (cf. MP. Hayette)
- Les parasites (cf. MP. Hayette) |
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Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
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| Ce cours donne un aperçu général de la microbiologie, des structures et fonctions particulières caractérisant les microorganismes, de l'impact des microorganismes sur l'environnement et de leurs relations avec l'homme. Ces notions essentielles permettront de comprendre les relations hôte-microorganismes pouvant conduire à la maladie. Le cours permettra à l'étudiant de comprendre et d'acquérir la connaissance des moyens de défenses et de prévention disponibles contre l'agression par des microorganismes. L'étudiant devra acquérir au cours de cet enseignement et des travaux pratiques la connaissance des méthodes et moyens de détection et d'identification des microorganismes. Dans la suite de son cursus, l'étudiant sera capable d'intégrer des notions abordées plus spécifiques concernant les maladies infectieuses, leur diagnostic, leur pathogenèse, leurs contrôle et prévention. |
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Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :
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| - Biologie générale préparatoire aux sciences médicales, incluant l'introduction à la génétique générale
- Immunologie générale |
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Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
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| Cet enseignement et travaux pratiques s'adressant à de futurs professionnels de la santé, les exercices et démonstrations se rapportent à la microbiologie clinique et introduisent ainsi la notion des missions d'un laboratoire de microbiologie dans le diagnostic et le contrôle des agents infectieux.
Lors des séances de travaux pratiques, les activités réalisées familiarisent aussi l'étudiant avec les considérations de base de la biosécurité, avec les règles incontournables de l'hygiène comme le lavage des mains et, avec les techniques de base utilisées en microbiologie. |
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Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
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| Cours ex-cathedra présentiel et travaux pratiques
Participation de 2 personnes pour l'enseignement:
- Prof. P. Melin: Microbiologie: les généralités, les défis microbiens, les bactéries, les relations hôtes parasites et les moyens de contrôles des maladies infectieuses.
- Prof. MP. Hayette: Mycologie (généralités, interactions avec l'hôte), Parasitologie (généralités sur les parasites, caractéristiques des protozoaires et des helminthes, interactions avec l'hôte ).
Les méthodes d'identification des microorganismes sont brièvement envisagées par les différents enseignants et plus largement détaillées et réalisées pendant les travaux pratiques. |
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Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
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| Les diaporama des cours théoriques ainsi que les notes de travaux pratiques sont publiés en ligne (site ULg) et sont accessibles aux étudiants des sections et année concernées par le cours.
Les livres suivants sont des références qui peuvent aider les étudiants:
- MEDICAL MICROBIOLOGY, Mims C. et al, 5th Ed.,2012, Elsevier
- INTRODUCION A LA MICROBIOLOGIE, Tortora G.J. et al, 2003, ERPI, Editions du Renouveau Pédagogique Inc.
- THE MICROBIAL CHALLENGE, Krasner R., 2002, Ed. ASM PRESS
- MICROBIOLOGIE, Prescott, Harley et Klein, Ed.De Boeck Université
Site web recommandé:
http://www.microbes-edu.org/ |
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Modalités d'évaluation et critères :
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| - Examen écrit en session de juin et de septembre comportant deux questions ouvertes courtes (QROC) et des questions à choix multiples (QCM).
- Une évaluation des travaux pratiques se fait à la dernière séance de travaux pratiques de chaque groupe. Elle peut comporter une ou des questions ouvertes courtes (QROC) et des questions à choix multiples (QCM). |
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Stage(s) :
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| Possibilités de postes d'élève-moniteur pour des étudiants motivés de master. Leur charge est l'encadrement des étudiants aux travaux pratiques de microbiologie générale et de microbiologie médicale (horaire à définir). Conditions : avoir faits de bons examens en microbiologie générale et médicale (théorie et pratique); avoir de bons résultats globaux (grades); motivation. |
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Remarques organisationnelles :
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| Pour les travaux pratiques,
- la coordination est assurée par Madame Julie Descy du service de microbiologie clinique du CHU de Liège.
- La participation aux travaux pratiques est OBLIGATOIRE.
- L'accès aux travaux pratiques est interdit aux étudiants ne portant pas de blouse de laboratoire.
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Contacts :
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| Microbiologie clinique,
CHU de Liège,
B-23 Sart Tilman,
4000 LIEGE
Belgique
Tél. secrétariat: 00.32.4.366.24.39
Fax: 00.32.4.366.24.40
Enseignants:
- Pierrette.Melin@ulg.ac.be- mphayette@chu.ulg.ac.be
Travaux pratiques:
- julie.descy@chu.ulg.ac.be |
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