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Année académique 2014-2015Données en date du : 12/05/2015
Version 2013-2014
MICR0717-1  Microbiologie médicale et pharmaceutique
- Microbiologie médicale
- Microbiologie pharmaceutique

Durée :  Microbiologie médicale : 12h Th, 6h Pr
Microbiologie pharmaceutique : 14h Th, 6h Pr
Nombre de crédits :  
Bachelier en sciences pharmaceutiques, 3e année5
Nom du professeur :  Microbiologie médicale : Marie-Pierre Hayette
Microbiologie pharmaceutique : Pierrette Melin
Coordinateur(s) :  Pierrette Melin
Langue(s) du cours :  
Langue française
Contenus du cours :  
Microbiologie médicale

Ce cours est destiné à vous apporter des connaissances de base en microbiologie médicale. Il fait suite au cours de microbiologie générale où vous avez reçu les bases sur les microorganismes et les relations hôtes-parasites. Vous aborderez cette année les principales maladies infectieuses rencontrées en communauté. Celles-ci seront abordées par site anatomique comme par exemple les infections du tractus urogénital ou du tractus respiratoire parce que celles-ci sont parmi les plus fréquentes.
Ce cours permettra à ceux qui se destinent à l'officine d'assurer au mieux leur rôle de conseiller dans la prévention et la thérapeutique instaurée par le médecin. Pour celui qui se destine à la biologie clinique le cours apportera les bases qui seront renforcées au cours de sa formation de biologiste. Enfin, pour celui qui se destine à l'industrie ou la recherche, les connaissances en microbiologie médicale apporteront une base facilitant l'intégration dans la filière des anti-infectieux. Pour les autres, il constituera une culture générale microbiologique.
Description du cours
Le cours sera axé sur l'épidémiologie, les signes cliniques, le diagnostic et l'aspect thérapeutique. Les molécules anti-infectieuses seront détaillées en lien avec les résistances développées par les microorganismes et les effets secondaires majeurs.
En effet, le cours permet de faire le lien entre les anti-infectieux et le microorganisme cible pour mieux en comprendre les interactions et le développement des résistances potentielles.
N.B. Les pathologies abordées le seront à l'exception des infections virales qui seront traitées dans le cours de virologie médicale (Prof. N. Jacobs).
Table des matières
Les pathologies seront abordées par site anatomique. Seront abordées: les infections du tractus respiratoire en particulier les pneumonies d'origine bactérienne en incluant la tuberculose: les infections urinaires, de même que les maladies sexuellement transmissibles telles que les infections dues à Chlamydia trachomatis, au gonocoque (Neisseria gonorrhoeae) et la syphilis; les infections cutanées en insistant sur les infections provoquées par les staphylocoques dorés (S. aureus), les infections superficielles d'origine fongique (candidoses et dermatophytoses) et les infections par les ectoparasites (poux, puces); deux exemples d'infections transmises par piqûre d'arthropodes seront présentées avec la borréliose (pathologie autochtone) et la malaria (maladie tropicale d'importation). Enfin, les principaux mécanismes de résistance aux antibiotiques, antifongiques et antiparasitaires seront abordés: types de mécanismes, mode d'acquisition, prévalence.
Révision-Entraînement en continu.
En continu, à chaque début de cours vous serez intérrogés sous forme de quiz sur la matière vue précédemment. Ceci vous permettra d'entetenir vos connaissances.
Une séance de révision est également prévue à la fin du cours.

Microbiologie pharmaceutique

L'enseignement comporte trois parties, l'une se rapportant à la qualité microbiologique des médicaments, une autre aux agents et méthodes de stérilisation - désinfection et la troisième à la vaccination et ingénierie des vaccins.
Ce cours introduit l'étudiant à la production de médicaments dans le respect des GMP et de l'assurance de qualité microbiologique.  L'impact des contaminations rapportées dans la littérature est décrit.  Les techniques de contrôle de production dans le respect de l'assurance de qualité microbiologique sont présentées.  Les principes des techniques de contrôle microbiologique des matières premières, des produits finis et de l'environnement de productions sont exposés.  Les référentiels sont donnés par catégorie de produits.  Les formulations possibles pour améliorer la conservation sont discutées.
La nécessité, les méthodes et agents de stérilisation, de désinfection et d'antisepsie utilisés à l'hôpital, en officine, en industrie ou dans la communauté sont exposés.
L'impact majeur de l'immunoprophylaxie et de l'immunothérapie sur le contrôle des maladies infectieuses est rappelé.  Les différentes stratégies de formulation de vaccins sont décrites et commentées.  La stratégie vaccinale recommandée en Belgique est présentée ainsi que les principaux vaccins administrés dans notre pays.
Table des matières: Qualité microbiologique des médicaments
- Introduction - Risques, causes et conséquences des contaminations - Contrôle du niveau de contamination     (Microorganismes contaminants et transmission; GMP et AQ; Référentiels; Méthodes de test; Contrôle par utilisation de conservateurs; Méthodes microbiologiques; Tests d'efficacité de la conservation antimicrobienne;Tests d'activité bactéricide des désinfectants)
Stérilisation - désinfection
- Introduction - Cibles - agents infectieux - Définitions et objectifs - Agents et méthodes de stérilisation:          Procédés physiques (Chaleur  sèche et humide, filtration air et liquides, irradiation UV et ionisante)         Gaz (Oxyde d'éthylène, formaldéhyde, gaz plasma)         Agents chimiques (Acide peracétique)         Contrôles de stérilisation et contrôle de stérilité - Antiseptiques et désinfectants
Les vaccins
- Introduction - Stratégies vaccinales - Conception des vaccins à l'ère de la génomique - Glycoconjugaison - Utilisation des toxines protéiques bactériennes - Adjuvants - Vaccins en Belgique  

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :  
Microbiologie médicale

A l'issue du cours vous aurez enrichi vos connaissances sur l'épidémiologie des principales maladies infectieuses rencontrées en communauté, sur les moyens  de prévention et sur l'abord thérapeutique.
Vous connaitrez les principales techniques utilisées dans un laboratoire de microbiologie pour le diagnostic des maladies infectieuses. 

Microbiologie pharmaceutique

Ce cours donne un aperçu de différentes considérations  microbiologiques se rapportant aux sciences pharmaceutiques.
L'étudiant deviendra conscient du risque de contamination des produits pharmaceutiques et des conséquences : dégradation des produits et risque infectieux pour le patient.  Le cours lui permettra d'acquérir des notions de base de la production sous bonne pratique de fabrication (GMP) tant au niveau industriel qu'officinal et des méthodes d'évaluation de la qualité microbiologiques. 
La stérilisation et la désinfection relèvent dans les hôpitaux du pharmacien d'hôpital, en officine le pharmacien devra produire des préparations officinales stériles et il conseillera les clients pour une utilisation appropriée des désinfectants et antiseptiques : le cours permettra à l'étudiant d'acquérir les notions nécessaires à ces tâches.
Au terme du cours, l'étudiant sera capable de décrire les différents types de vaccins et indications, d'y associer avantages et inconvénients. Il aura acquis les éléments nécessaires à la compréhension du recours à la glycoconjugaison et d'utilisation d'adjuvant.  Il sera capable de lister les vaccins obligatoires en Belgique et d'expliquer les notions de rappel vaccinal.

Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :  
Microbiologie médicale

Les pré-requis sont le cours de microbiologie générale et immunologie générale vus en Bac 2. Ces pré-requis facilitent l'apprentissage et constituent une connaissance de base indispensable. 
Le co-requis est le cours de virologie médicale donné par le Pr. N. Jacobs et le cours de microbiologie pharmaceutique (Pr. P. Melin).

Microbiologie pharmaceutique

Cours de biologie cellulaire, de biochimie, d'immunologie, de génétique, de microbiologie générale et médicale, et de virologie.

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :  
Microbiologie médicale

Le cours sera présenté sous forme de cours magistraux. Des quiz seront proposés au début de chaque cours de façon à renforcer les acquis.
De plus, des séances de travaux pratiques (TP) sont également organisées. Les TP sont présentés sous forme d'ateliers thématiques qui illustrent les cours magistraux à travers la réalisation de tests diagnostiques, d'observations en microscopie et en macroscopie (cultures bactériennes et fongiques, parasites adultes), de projection de vidéos.
Une video sera également mise à disposition sous forme d'une visite virtuelle du laboratoire de microbiologie médicale.
D'autre part des références de videos seront déposées sur e-campus de façon ponctuelle pour illustrer certains cours (Ex. Malaria, maladie de Lyme).

Microbiologie pharmaceutique

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Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :  
Microbiologie médicale

Présentiel

Microbiologie pharmaceutique

Cours ex-cathedra présentiel 
Et travaux pratiques

Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :  
Microbiologie médicale

Medical microbiology-MIMS Collaborateurs-Mosby Europe ed., 4th edition, 2013.
Infectiologie, Tome 3. 3ème édition. Collection Le moniteur internat. 2007.

Microbiologie pharmaceutique

Les diaporama des cours théoriques sont publiés en ligne (site ULg) et sont accessibles aux étudiants concernés par le cours.
Les ouvrages de référence permettent une meilleure compréhension et un élargissement des notions enseignées:
- Hugo&Russell's Pharmaceuticals microbiology, S.Denyer, N. Hodges, S. Gorman, B. Gilmore, 8th Ed. 2011, Wiley-Blackwell - Microbial Quality Assurance in Pharmaceuticals, Cosmetics, and Toiletries, R. BairdSally F. Bloomfield, Taylor andFrancis, 1996 - Vaccine design: Innovative Approaches and Novel Strategies, R Rappuoli et F Bagnoli, Caister Academic Press, 2011 - Vaccinologie, J. Gaudelus, Doin editeurs, 2008 - Medical microbiology, Mims C. et al, 5th Ed.,2012, Elsevier - Bactériologie médicale, F.Denis, MC. Ploy, C. Martin, E. Bingen, R. Quentin et al. 2ème Ed., 2011, Masson Paris

Modalités d'évaluation et critères :  
Microbiologie médicale

L'évaluation se fera communément avec le cours de microbiologie pharmaceutique donné par Pr P. Melin. Elle se fera sous forme de questions à choix multiple avec degré de certitude portant sur chaque matière pour 70% de la cote et d'une question ouverte à réponse courte portant sur chaque cours (soit 2 questions pour 20% de la cote). D'autre part les cotes des travaux pratiques seront intégrés dans la cote finale (10%) pour ce qui concerne la première cession seulement. Pour la seconde cession le QCM portera sur 80% de la cote et les deux questions ouvertes pour 20%. 

Microbiologie pharmaceutique

L'examen est intégré avec l'examen écrit du partim "microbiologie médicale" et se tient en sessions de juin et de septembre.  L'examen du partim "microbiologie pharmaceutique"  comporte une question ouverte courte (QROC) et des questions à choix multiples (QCM).

Stage(s) :  
Microbiologie pharmaceutique

Possibilités de postes d'élève-moniteur pour des étudiants motivés de master. Leur charge est l'encadrement des étudiants aux travaux pratiques de microbiologie générale et de microbiologie médicale (horaire à définir). Conditions : avoir faits de bons examens en microbiologie générale et médicale (théorie et pratique); avoir de bons résultats globaux (grades); motivation.
Remarques organisationnelles :  
Microbiologie pharmaceutique

Pour les travaux pratiques, - la coordination est assure¿e par Madame Julie Descy du service de microbiologie clinique du CHU de Lie¿ge. - La participation aux travaux pratiques est OBLIGATOIRE. - L'acce¿s aux travaux pratiques est interdit aux e¿tudiants ne portant pas de blouse de laboratoire.
 
Contacts :  
Microbiologie médicale

Prof. Marie-Pierre Hayette Service de Microbiologie médicale Tour de Pathologie (B23) CHU Sart Tilman - 4000 LIEGE Tél: 04-366.24.39 Fax: 04-366.24.40 Email: mphayette@ulg.ac.be

Responsable des travaux pratiques
Julie Descy Service de Microbiologie médicale Tour de Pathologie (B23) CHU Sart Tilman - 4000 LIEGE Tél: 04-366.24.39 Fax: 04-366.24.40 Email: J.Descy@chu.ulg.ac.be

 
 

Microbiologie pharmaceutique

Microbiologie clinique, CHU de Liège, B-23 Sart Tilman, 4000 LIEGE Belgique Tél. secrétariat: 00.32.4.366.24.39 Fax: 00.32.4.366.24.40 email : micromed@ulg.ac.be
Enseignants: - Pierrette.Melin@ulg.ac.be
Travaux pratiques: - julie.descy@chu.ulg.ac.be




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