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| Version 2013-2014 |
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| MICR0130-2 | Microbiologie médicale
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| Durée : | 16h Th, 6h Pr |
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| Nombre de crédits : |
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| Nom du professeur : | Marie-Pierre Hayette, Pierrette Melin |
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| Coordinateur(s) : | Pierrette Melin |
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Langue(s) du cours :
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| Langue française |
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Contenus du cours :
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| L'enseignement comporte deux parties, l'une introductive se rapportant au bon usage du laboratoire de diagnostic microbiologique et aux flores commensales, et l'autre représentant l'approche de la pathologie infectieuse par système anatomique, par présentation syndromique. Les sujets suivants sont traités: les infections de l'arbre urinaire, les infections du système digestif, les infections sexuellement transmissibles, les infections de la sphère respiratoire et ORL y compris les infections chroniques comme la tuberculose, les infections transmises de la mère à l'enfant et les infections de la peau et des tissus mous. Pour chaque système, après une brève introduction le cours décrit les principaux microorganismes pathogènes et mode d'acquisition ; il fournit des notions élémentaires concernant la pathologie infectieuse qui leur est associée, des notions d'épidémiologie, de pathogenèse et les éventuelles complications non infectieuses. Il analyse les interactions entre hôte et pathogènes; il discute les principales stratégies de diagnostic, de traitement et de prévention. A chacune de ces présentations est associée la description des principaux pathogènes. Le cours comprend également un chapitre concernant les candidoses et un autre est dédié au paludisme. La plupart des infections virales sont traitées séparément de la microbiologie médicale.
Table des matières
- Stratégies de bonne utilisation du laboratoire de microbiologie clinique et des ressources disponibles (PM)*
- Du bon usage des antibiotiques (PM)
- Les flores commensales (PM)
- Infections de l'arbre urinaire (PM)
- Infections des voies respiratoires supérieures (PM)
- Infections des voies respiratoires inférieures y compris les infections chroniques (PM)
- Infections sexuellement transmissibles (PM)
- Infections du système digestif (PM)
- Infections de la mère à l'enfant (PM)
- Infections de la peau et des tissus mous (PM)
- Le paludisme (MPH)**
- Les candidoses (MPH)
(*: PM, Pierrette Melin et **: MPH, Marie Pierre Hayette)
Les travaux pratiques illustrent le cours théorique par des exemples techniques tels qu'ils sont rencontrés dans un laboratoire de diagnostic clinique. Ils doivent permettre aux étudiants de visualiser concrètement les agents de maladies infectieuses; ils doivent initier ceux-ci aux techniques d'isolement et aux techniques de détection rapides, à l'importance de la qualité pré-analytique des prélèvements, à la réalité des contaminations et à la notion des valeurs prédictives des tests utilisés. |
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Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
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| Ce cours donne un aperçu général de la microbiologie médicale par une démarche cliniquement pertinente axée sur une approche par système anatomique, associée à la description des principaux microorganismes pathogènes pour l'homme. L'ensemble des notions exposées permettront à l'étudiant d'intégrer de nombreux acquis du cours de microbiologie générale. Le cours permettra à l'étudiant d'acquérir la connaissance des principaux pathogènes qu'il rencontrera en clinique, des moyens de traitement et de prévention disponibles contre l'agression par des microorganismes et de comprendre les moyens de défenses mis en œuvre par l'homme. L'étudiant devra acquérir au cours de cet enseignement et des travaux pratiques la connaissance et les limites d'utilisation des méthodes et moyens de détection des microorganismes et de diagnostic des maladies infectieuses. |
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Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :
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| Cours de biologie cellulaire, de biochimie, d'immunologie, de génétique, de microbiologie générale et de virologie générale. |
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Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
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| Cet enseignement et travaux pratiques s'adressant à de futurs médecins, les exercices et démonstrations se rapportent à la microbiologie clinique : méthodes de dépistage, de diagnostic et de confirmation. Les démonstrations et exercices visent aussi à démontrer l'importance des phases pré-analytiques et post-analytiques des examens de laboratoire.
Afin d'illustrer et de compléter les notions acquises, des vidéos réalisées dans le laboratoire de microbiologie clinique du CHU de Liège, invitent les étudiants à suivre le parcours d'un échantillon. Ces visites virtuelles, comprennent alternativement interviews, explications schématiques des différentes techniques utilisées, quelques diapositives du cours et séquences filmées dans le laboratoire. |
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Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
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| Cours ex-cathedra présentiel et travaux pratiques
Participation de 2 personnes pour l'enseignement:
- Prof. P. Melin : Stratégies de bonne utilisation du laboratoire de microbiologie clinique et des ressources disponibles, du bon usage des antibiotiques, les flores commensales, les infections de l'arbre urinaire, du système respiratoire et ORL, sexuellement transmissibles, du système digestif, de la mère à l'enfant, de la peau et des tissus mous.
- Prof. MP. Hayette: Les candidoses et le paludisme
Les cours consacrés aux infections du système respiratoire intègrent les infections virales et sont donnés en collaboration avec le prof. N.Jacobs.
Les méthodes de détection des microorganismes et de diagnostic des maladies infectieuses sont envisagées dans le cours théoriques ainsi que les principes de bonne utilisation du laboratoire, et plus largement détaillées, illustrées et réalisées pendant les travaux pratiques. Les vidéos sont projetées et commentées pendant les travaux pratiques; les étudiants peuvent les revoir en ligne (site ULg) |
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Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
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| Les diaporama des cours théoriques, les notes de travaux pratiques ainsi que les vidéos sont publiés en ligne (site ULg) et sont accessibles aux étudiants concernés par le cours.
Vidéos: Une version condensée des diverses videos présentées aux travaux pratiques et intitulée "Le diagnostic microbiologique en 2013. Le parcours d'un échantillon" est accessible en ligne: https://vimeo.com/67284183. Elle s'adresse à tout utilisateur d'un laboratoire de diagnostic microbiologique.
Les ouvrages de référence permettent une meilleure compréhension et un élargissement des notions enseignées:
- Medical microbiology, Mims C. et al, 5th Ed.,2012, Elsevier
- Repères en microbiologie, P. Goubau & A. Van Gompel. Garant ed., 2000
- Bactériologie médicale, F.Denis, MC. Ploy, C. Martin, E. Bingen, R. Quentin et al. 2ème Ed., 2011, Masson Paris
- Medical Microbiology, P. Murray, K. Rosenthal, M. Pfaller. 6th Ed., 2009, Mosby Elsevier
Site web recommandé:
- http://www.microbes-edu.org/ |
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Modalités d'évaluation et critères :
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| Examen écrit en session de juin et de septembre comportant deux questions ouvertes courtes (QROC) et des questions à choix multiples (QCM).
Une évaluation des travaux pratiques se fait à la dernière séance de travaux pratiques de chaque groupe. Elle peut comporter une ou des questions ouvertes courtes (QROC) et des questions à choix multiples (QCM).
Lors des examens intégratifs, l'étudiant peut être interrogé sur les cours de microbiologie. |
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Stage(s) :
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| Possibilités de postes d'élève-moniteur pour des étudiants motivés de master. Leur charge est l'encadrement des étudiants aux travaux pratiques de microbiologie générale et de microbiologie médicale (horaire à définir). Conditions : avoir faits de bons examens en microbiologie générale et médicale (théorie et pratique); avoir de bons résultats globaux (grades); motivation. |
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Remarques organisationnelles :
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| Pour les travaux pratiques,
- la coordination est assurée par Madame Julie Descy du service de microbiologie clinique du CHU de Liège.
- La participation aux travaux pratiques est OBLIGATOIRE.
- L'accès aux travaux pratiques est interdit aux étudiants ne portant pas de blouse de laboratoire. |
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Contacts :
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| Microbiologie clinique,
CHU de Liège,
B-23 Sart Tilman,
4000 LIEGE Belgique
Tél. secrétariat: 00.32.4.366.24.39
Fax: 00.32.4.366.24.40
email : micromed@ulg.ac.be
Enseignants:
- Pierrette.Melin@ulg.ac.be
- mphayette@chu.ulg.ac.be
Travaux pratiques:
- julie.descy@chu.ulg.ac.be |
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