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| Version 2013-2014 |
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| GBIO0016-1 | Introduction to systems and synthetic biology
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| Durée : | 30h Th, 30h Pr |
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| Nombre de crédits : |
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| Nom du professeur : | Eric Bullinger, Bernard Joris |
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Langue(s) du cours :
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| Langue anglaise |
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Organisation et évaluation :
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| Enseignement au deuxième quadrimestre |
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Contenus du cours :
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| Ce cours couvrira une introduction à la biologie systémique et synthétique.
La partie de l'introduction à la biologie systémique traitera en particulier l'émergence de propriétés de systèmes dynamiques biologiques telle que la robustesse, la performance, la complexité et l'optimalité.
Les thématiques de la partie théorique sur la biologie synthetique
sont :
- historique de la biologie synthétique
- outils et approches de la biologie synthétique
- séquençages ADN, fabrication d'ADN (« briques élémentaires »)
- modélisation mathématique
- mesures (microscopie, cryométrie de flux)
- Design de voies métabolique « sur-mesure »
- Design de systèmes de régulation
- Sécurité, aspects sociales et éthiques
Cette partie théorique sera suivie d'un projet de biologie synthétique (modélisation et implémentation dans E. coli). |
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Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
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| Au terme du cours, l'étudiant maîtrisera les concepts de base de la biologie synthétique. Il sera capable de synthétiser virtuellement ainsi que dans E. coli de simples systèmes synthétiques.
L'utilisation de l'anglais comme langue de cours et de support de cours permet aux étudiants de développer leur compréhension à l'écoute et à la lecture de l'anglais scientifique et technique. |
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Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :
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| aucun |
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Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
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| Le cours repose sur des exposés ex-cathedra ainsi que d'un projet de laboratoire, qui nécessitera l'utilisation d'un ordinateur pour simuler des systèmes de réactions biochimique (Matlab ou un programme de simulation de biologie systémique), ainsi que des manipulations biologique / biochimique.
Le cours est enseigné en anglais. Cependant, les étudiants peuvent poser des questions en anglais ou en français. |
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Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
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| présentiel |
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Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
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| Ouvrage de référence pour la biologie systémique : Uri Alon « An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits », Chapman & Hall/CRC Mathematical & Computational Biology, 1996. |
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Modalités d'évaluation et critères :
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| Rapport détaillé individuel (style publication) sur le projet, (25%) ; examen oral (75%).
La participation aux travaux pratiques (projet) est un prérequis pour l'accès à l'examen final. La cote du projet est valable un an. |
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Stage(s) :
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Remarques organisationnelles :
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| Le cours est organisé au 2eme quadrimestre à des dates à convenir. |
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Contacts :
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Franck DELVIGNE
Chimie et bio-industries / Bio-industries
BG1 Bio-industries
Passage des Déportés 2
5030 Gembloux
Tél 081 622 311
F.Delvigne@ulg.ac.be
Bernard JORIS
Unité de Physiologie et Génétique bactériennes
Centre d'Ingénierie des Protéines
Institut de Chimie B6a Local 1.50b
Tél 04 366 2954
bjoris@ulg.ac.be
Secrétariat Fabienne Julémont Tel 04 366 3341
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