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| BIOL0807-4 | Taxonomie et Phylogénie
- partim végétale
- partim animale
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| Durée : | partim végétale : 20h Th, 15h Pr
partim animale : 40h Th, 30h Pr
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| Nombre de crédits : |
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| Nom du professeur : | partim végétale : Emmanuël Sérusiaux
partim animale : Patrick Dauby
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| Coordinateur(s) : | Emmanuël Sérusiaux |
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Langue(s) du cours :
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| Langue française |
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Organisation et évaluation :
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| Enseignement durant l'année complète |
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Contenus du cours :
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 | | partim végétale |
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| Le partim « végétal » du cours de Taxonomie-Phylogénie veut faire connaître, au sein des eucaryotes, l'évolution parcourue par tous les clades qui contienent ou qui ont contenu de la chlorophylle, et donc un mécanisme métabolique permettant d'utiliser l'énergie solaire. Il est complété par une même analyse pour le clade des champignons, jusqu'il y a peu considérés comme des plantes sans chlorophylle, mais qui, vu leur position au sein de l'arbre de la vie, sont davantage des « animaux qui ne bougent pas ».
La topologie générale de tous les eucaryotes sera donc examinée, avec présentation des scénarios évolutifs (p. ex. les transferts de plastides) et les caractéristiques propres de quasi tous les clades, et bien entendu intégration des dernières découvertes - lesquelles sont nombreuses et passionnantes.
Un accent particulier sera mis sur la lignée des Viridiplantae, et donc sur les « algues vertes », les bryophytes, et les spermatophytes.
Selon les années, un focus sera porté sur l'un ou l'autre aspect des étapes évolutives franchies, telle que p. ex. l'association des plantes terrestres avec les champignons, ou l'évolution d'un groupe particulier d'angiospermes. |
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| La partie théorique est articulée autour de deux axes:
1. Une consacrée à la Taxonomie (3 cours) incluant:
-un rappel des règles de nomenclature;
-les concepts d'espèce et problèmes associés;
-les variations intraspécifiques;
-la nature et l'usage des caractères discriminants.
2. Une partie (7-8 cours) présentant, de façon phylogénique, la diversité des organismes hétérotrophes (unicellulaires et métazoaires, environ 50 phyla).
Diverses lectures, ainsi qu'un film, sont en plus proposés pour compléter ce cours théorique.
Les TP sont organisés en 5(6) séances de 4h, typiquement consacrées à l'analyse morphologique de différents groupes de protistes ou de métazoaires parasites (apicomplexés, ciliés, plathelminthes, nématodes...), sur base d'étude de coupes histologiques ou d'observation d'individus fixés. Chaque séance est précédée d'un exposé théorique introductif. La présence aux travaux pratiques est obligatoire. Toute absence doit être justifiée par un certificat médical.
Un travail écrit, réalisé par groupe de 2 à 4 étudiants, concernant des problèmes de parasitologie et/ou de prophylaxie (sujet à choisir par le groupe), sera demandé. Ce rapport sera remis début février. Les informations concernant ce travail seront données lors du premier cours théorique. |
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Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
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| Voir rubrique précédente |
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Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :
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| Bonne maîtrise des techniques modernes de phylogénie faisant appel de vastes bases de données, depuis la parcimonie jusqu'aux inférences bayesiennes. |
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| Maîtrise de la langue française.
Avoir suivi un cours de Zoologie générale durant les années de Bachelier est un avantage, dans la mesure où le cours de Taxonomie et Phylogénie en est un prolongement logique. Dans le cas contraire, un effort personnel serait demandé à l'étudiant pour assimiler la morphologie des groupes d'invertébrés peu abordés dans le cadre du cours (Arthropodes, Annélides, Mollusques, Echinodermes) , mais importants pour la compréhension de la phylogénie générale des animaux. |
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Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
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| (1) Cours classique avec support de diaporamas richement illustrés,
(2) préparation par les étudiants de présentations sur des clades désignés d'angiospermes,
(3) séances de travaux pratiques consistant en l'identification de spécimens frais d'angiospermes avec support illustré en-ligne et maîtrise des caractères évolutifs supportant cette identification. |
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Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
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| Présence aux cours et aux séances de travaux pratiques obligatoire. |
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| Enseignement de type présentiel.
Les notes de cours (diapositives, articles) sont disponibles sur MyULg après chaque cours théorique ou séance de TP. |
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Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
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| Les lectures à faire et à intégrer au cours sont communiquées au cours |
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| Recommandé:
Richard D. et al. Atlas de Phylogénie. La classification du vivant en fiches et images. Dunod, Paris, 2014.
Optionnel:
Lecointre G & Le Guyader H. Classification phylogénétique du vivant. 3e édition. Belin, Paris, 2001.
Ruppert EE, Fox RS, Barnes RD. Invertebrate Zoology. 7th edition. Thomson Brookscole, 2004. |
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Modalités d'évaluation et critères :
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| L'évaluation est articulée sur trois cotes : (1) un rendu du cours et des scénarios évolutifs présentés, impliquant notamment des croisements entre les différentes chapitres ; (2) un rapport écrit et oral sur le clade désigné d'angiospermes ; (3) le résultat d'un examen de travaux pratiques, identiques à ceux qui auront été menés.
La cote pour le (1) doit être supérieure à 7/20 pour que la moyenne soit calculée à raison de 50/25/25. Si la cote pour le (1) est inférieure à 7/20, elle constitue la cote globale.
Il n'y aura pas de discussion par courriel de la cote globale, ni des cotes des différents segments de l'examen. Si l'étudiant échoue en 1è session, la 2è session comporte obligatoirement les parties (1) et (3). |
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| L'examen théorique se fait sous forme orale, lors de la session de janvier. L'étudiant a 30 min pour préparer une question (de type transversal), et peut disposer de ses notes de cours et d'une série d'ouvrages mis à sa disposition par l'enseignant.
La cote de l'examen pratique est basée sur le rapport écrit (voir paragraphe "Contenu du cours") ainsi que sur l'assiduité et l'intérêt montré par l'étudiant lors des séances de TP.
Examen théorique et rapport interviennent pour respectivement 70 et 30% de la cote finale. |
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Stage(s) :
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| Pas de stage |
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| Il n'y a pas de stage prévu dans le cadre du cours. Toutefois, les notions théoriques données lors de celui-ci seront utiles lors du cours "Stage" organisé dans le cadre du 1er Master BOE. |
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Remarques organisationnelles :
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| Pas de remarque particulière à l'organisation |
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| Les cours théoriques ont lieu à l'Institut de Botanique (B22), à 9h, aux dates prévues dans le programme des cours.
Les travaux pratiques se donnent à l'Institut de Zoologie (Aquarium, I1), à 14h, aux dates communiquées lors du premier cours. |
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Contacts :
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| S'adresser au Prof. Emmanuël Sérusiaux |
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| Patrick DAUBY
Systématique et Diversité animale
Institut de Chimie, B6c, Sart Tilman
Tél 04 366 33 22
Email: pdauby@ulg.ac.be
Mathieu POULICEK
Ecologie et Ecotoxicologie animale
Institut de Chimie, B6c, Sart Tilman
Tél 04 366 50 67
Email: mpoulicek@ulg.ac.be |
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| Notes en ligne : |
partim végétale
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| Disponibilité des diaporamas |
| Les liens permettant de télécharger les diaporamas seront communiqués aux étudiants en temps utile. |
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