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| BIOL0018-1 | Ecologie
- partim Ecologie des sols
- partim Ecologie des eaux douces
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| Durée : | partim Ecologie des sols : 25h Th, 10h Pr, 1j T. t.
partim Ecologie des eaux douces : 15h Th, 2j T. t.
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| Nombre de crédits : |
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| Nom du professeur : | partim Ecologie des sols : Monique Carnol
partim Ecologie des eaux douces : Jean-Pierre Thomé
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| Coordinateur(s) : | Jean-Pierre Thomé |
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Langue(s) du cours :
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| Langue française |
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Organisation et évaluation :
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| Enseignement durant l'année complète |
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Contenus du cours :
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 | | partim Ecologie des sols |
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| Table des matières
Ce partim. du cours d'écologie aborde trois thématiques principales:
- Module 1: Comment fait-on de l'écologie? - approche scientifique
- Module 2: Ecologie des sols
- Module 3: Ecologie microbienne et cycles biogéochimiques
Description du cours
S'appuyant sur les notions fondamentales d'écologie enseignées en 2ème bachelier, l'étudiant est amené tout d'abord à s'interroger sur la signification de l'écologie scientifique. Il s'ensuit une réflexion sur les méthodes d'études en écologie et sur les démarches indispensables (démarche scientifique, stratégies d'échantillonnage) pour acquérir des connaissances objectives. Cet enseignement pose les bases de l'approche scientifique, appliquée dans d'autres cours du cursus et utile à la réalisation du mémoire de fin d'études. L'écologie des sols porte sur les composantes abiotiques et biotiques des sols, ainsi que sur l'interaction de ces deux composantes. La dernière partie du cours porte sur le rôle des micro-organismes dans les cycles biogéochimiques, les conséquences de leurs actions sur l'environnement et leur utilisation dans quelques exemples pratiques. |
| | partim Ecologie des eaux douces |
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- Ecologie des eaux douces et écologie des populations
S'appuyant sur les notions fondamentales d'écologie enseignées en 2ème bachelier, l'écologie des populations et les relations peuplements-environnement sont abordées en insistant sur les concepts de compétition intra- et interspécifiques et sur les stratégies démographiques qui permettent de caractériser la structure des biocénoses. Ces concepts relevant de l'autécologie et de la démécologie étant acquis, la suite de cet enseignement est consacrée à la synécologie fonctionnelle. Les thèmes abordés pour illustrer cette approche concernent l'écologie des eaux douces, systèmes lentique et lotique (hydrobiologie, limnologie, caractérisation des biocénoses, pollution des milieux aquatiques). L'intégration des notions acquises en démécologie et en écologie des eaux douces permettront aux étudiants d'appréhender le partage des ressources spatiales et alimentaires des espèces au sein de leur niche écologique dans le cadre d'une étude in situ dans le domaine de la station de Biologie de Paimpont (Bretagne). Ces données seront exploitées dans le cadre de l'évaluation de la qualité écologique et physico-chimiques des eaux continentales (systèmes lotique et lentique). |
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Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
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| | partim Ecologie des sols |
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| Savoir: Acquisition des connaissances de base sur :
- La nature de l'écologie
- Les méthodes d'étude en écologie
- La démarche scientifique et la planification des études scientifiques
- L'environnement physico-chimique du sol
- Les composantes biotiques du sol
- La genèse et la classification des sols
- La diversité et le métabolisme microbien
- L'intervention des micro-organismes dans les cycles de carbone, azote et soufre, les conséquences environnementales de leurs activités et l'influence des activités anthropiques
Savoir faire: Transfert (application) de ces connaissances de base à des situations réelles:
- Compréhension et utilisation de la terminologie spécifique à l'étude des écosystèmes
- Mobilisation des connaissances théoriques pour analyser, critiquer et améliorer un protocole d'étude
- Compréhension de l'influence des propriétés physico-chimiques de sol sur la disponibilité en eau, en nutriments, la présence et l'activité des microorganismes
- Compréhension du fonctionnement des processus microbiens dans divers habitats et des relations réciproques entre les facteurs de l'environnement et les micro-organismes.
Savoir être:
- Prise de conscience de la diversité des approches d'études, de leur complémentarité et de la nécessité d'une démarche d'étude rigoureuse
- Prise de conscience de la variabilité spatiale et temporelle des phénomènes en écologie
- Développement d'un esprit critique face à la littérature scientifique
- Pratique de techniques de travail en groupe, d'analyse et de communication
- Prise de conscience de la complexité du sol, de l'importance des composantes abiotiques et biotiques pour la nutrition des plantes et le 'fonctionnement' du sol
- Prise de conscience de la diversité, de la variabilité, de la complexité et de l'importance des processus microbiens dans l'environnement
Chaque module comprend également des objectifs spécifiques, identifiant clairement ce que l'étudiant sera capable de faire au terme du cours. |
| | partim Ecologie des eaux douces |
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- Maîtriser les concepts de ressources et de niche écologique
- Comprendre le partage des ressources spatiales et alimentaires ainsi que l'importance des compétitions intra- et interspécifiques dans la régulation des populations et la structure des peuplements.
- Comprendre la phénologie des organismes aquatiques d'eau douce en fonction de l'évolution saisonnière des paramètres physiques et chimiques.
- Acquisition de compétences concernant la reconnaissance à vue des différents types d'organismes planctoniques dulçaquicole, et des grands groupes d'invertébrés benthiques. Exercices pratiques concernant la mise en évidence des chaînes trophiques en milieux lentiques et lotiques.
- Acquisition de pratiques concernant la systématique (techniques de collecte et manipulation ; utilisation de clefs de détermination) des rotifères, des cladocères et des invertébrés benthiques (mollusques, crustacés, larves d'insectes).
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Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :
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| Des notions de base et approfondies en microbiologie, chimie, biochimie et écologie sont utiles, mais pas indispensables à la compréhension du cours. Une compréhension à la lecture de l'anglais scientifique est requise pour une activité d'apprentissage qui comprend la consultation d'un article scientifique rédigé en anglais.
Prérequis:
BIOL518-1
MATH0009-1
Co-requis:
BIOL0017-1
STAT0203-1 |
| | partim Ecologie des eaux douces |
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| Notions de base d'écologie générale vues en 2ème Bachelier en biologie dans le cadre du cours de "biodiversité et écologie".
Maîtrise de l'utilisation des intégrales et du calcul différentiel, notions acquises en 1eère année de bachelier en biologie. |
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Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
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| | partim Ecologie des sols |
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| Les exposés magistraux (support power point) sont construites selon les principes des 'exposés actifs'. Les présentations sont ponctuées de questions de réflexion dans le cours, papier minute, des études de cas, ainsi que de discussion en classe. La relation théorie-pratique pour les méthodes d'études est effectuée via l'analyse coopérative d'articles scientifiques en rapport avec théorie sur la méthode scientifique appliquée à l'écologie. L'étude des sols est approfondie lors des travaux pratiques donnés par séries d'étudiants en petits groupes. Pour chaque cycle biogéochimique, des exemples de conséquences pour l'environnement et/ou des études de cas sont intégrés dans le cours, parfois illustrés par de petites séquences vidéo. Des tests d'autoévaluations sont accessibles via eCampus. Lors de l'excursion de terrain, des études en cours et des caractéristiques de sols sont illustrées en forêt.
L'intégration du cours magistral et des activités accomplies par les étudiants a notamment pour but l'assimilation de la matière pendant le quadrimestre. L'investissement personnel pendant le cours magistral et lors des activités diminuera la charge de travail lors de la session et favorisera également la rétention à moyen-long terme. |
| | partim Ecologie des eaux douces |
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- Cours ex-cathedra avec participation active des étudiants
- aspects théoriques intégrés aux aspects pratiques lors d'un stage sur le terrain
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Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
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| | partim Ecologie des sols |
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| L'ensemble des ressources nécessaires pour ce cours est centralisé dans l'espace du cours sur eCampus (diapositives du cours, documents pour consultation, autoévaluations, informations, forum de discussion...). Remarque : le téléchargement de documents est plus rapide via une connexion à haut débit. Plusieurs salles informatiques sont accessibles au sein de l'université (http://www.ulg.ac.be/upload/docs/application/pdf/2012-07/salles_informatiques_publiques_pour_les_etudiants.pdf) et l'université est dotée d'un réseau WiFi important. |
| | partim Ecologie des eaux douces |
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| La présence des étudiants est requise et obligatoire tant au cours théorique qu'aux travaux pratiques qui se déroulent sur le terrain.L'absence aux travaux pratiques de terrain rend l'étudiant non délibérable en 1ère et en 2ème session. Si un gros problème devait empêcher un étudiant de participer à ces travaux pratqiues, il doit impérativement en informer le coordinateur de ces TPs (Prof. Jean-Pierre Thomé) avant le début du stage. |
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Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
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| | partim Ecologie des sols |
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| Une liste de lectures optionnelles est fournie aux étudiants dans les documents du cours. Les ouvrages de référence sont disponibles dans le Laboratoire d'Ecologie Végétale et Microbienne (consultation en salle, sur rendez-vous). |
| | partim Ecologie des eaux douces |
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| Des notes destinées à aider à la compréhension du cours théorique apportent des informations sur les notions à acquérir. Les illustrations sous la forme de présentations "power-point" ainsi que ces notes sont disponibles sur e-campus. Les étudiants doivent mettre en relation les notes et les illustrations ainsi que les informations complémentaires données au cours théoriques pour se constituer leurs propres notes de cours. |
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Modalités d'évaluation et critères :
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| | partim Ecologie des sols |
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| L'évaluation des étudiants consiste en :
- une appréciation de leur activité lors des travaux pratiques.
- un examen écrit, en session (janvier), sur les matières du cours théorique et sur les matières abordées lors des travaux pratiques et de l'excursion de terrain.
Pour réussir, il faut au moins obtenir 10/20 pour l'ensemble du cours et au moins 8/20 dans chaque partim. En cas d'ajournement d'une année à l'autre, l'étudiant sera dispensé du partim. pour lequel il a obtenu 12/20 au moins.
RAPPEL (voir règlement général des examens): Toute fraude ou plagiat sont sévèrement sanctionnés et entrainent notamment une note de 0/20 à l'examen final. La participation aux travaux pratiques et à l'excursion, ainsi que la remise de rapports sont obligatoires (l'étudiant qui n'aurait pas participé aux activités indissociables de l'enseignement concerné peut être déclaré irrecevable à l'examen). |
| | partim Ecologie des eaux douces |
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- L'évaluation aura lieu le 19 mai 2015 lors du stage d'écologie des eaux douces. En cas d'échec en 1ère session, l'étudiant pourra représenter l'examen lors de la 2ème session, en août-septembre. L'examen concernant les aspects théoriques est un examen oral à livre ouvert.
- l'évaluation des travaux pratiques de terrain se passe à l'issue du stage sous la forme d'une interrogation dispensatoire (réponses à choix multiples) à livre ouvert.
- Au début du stage de terrain, une interrogation sous forme de QCM portera sur la connaissance des pré-requis indispensables pour participer fructueusement à ces TPs de terrain. La cote de ce QCM interviendra pour 20 % des points attribués aux TPs de terrain.
- La réussite est obtenue à 10/20 pour l'ensemble du cours et au moins 8/20 dans chaque partim.
- En cas d'ajournement d'une année à l'autre, l'étudiant sera dispensé du partim pour lequel il a obtenu au moins 12/20.
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Stage(s) :
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| | partim Ecologie des eaux douces |
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| Ce stage constitue la partie « travaux pratiques de terrain » du cours d'écologie (partim écologie des populations et écologie des eaux douces) et du cours de biodiversité pour ce qui concerne les animaux. Ce stage fait donc partie intégrante de ces deux cours. Cette année 2014-2015, il se déroulera du 14 au 20 mai 2015. Les étudiants rejoignent la station de Paimpont par leurs propres moyens. Le train est la solution la plus économique.
Le stage se déroule à la station de biologie de Paimpont (Bretagne) dépendant de l'Université de Rennes. Cette station est située dans un site privilégié où de nombreux aspects de l'écologie des eaux douces et de l'étude de la biodiversité des animaux aquatiques et terrestres peuvent être abordés sans nécessité de longs déplacements. Un ruisseau, deux étangs et plusieurs mares se trouvent sur le site de la station elle-même située au cœur de la forêt de Brocéliande. Il s'agit donc d'un environnement boisé.
Les thématiques abordées concernent :
- L'étude de la biodiversité des invertébrés aquatiques d'eau douce (faciès lentique et lotique)
- L'étude du phyto- et du zooplancton d'eau douce
- L'évaluation de la qualité biologique des masses d'eau par l'utilisation de plusieurs indices biotiques et physico-chimique (SEQ eau)
- L'étude de la biodiversité des invertébrés terrestres dans différents types de milieux (landes, forêts, zone humides).
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Remarques organisationnelles :
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| Le cours se donne au premier quadrimestre les mardis 9-12h30 et mercredis de 8h40 à 10h00. Un calendrier détaillé est distribué aux étudiants lors du premier cours. Les travaux pratiques se donnent par demi-journée (voir calendrier). Les étudiants doivent se munir de leur tablier et d'une calculatrice.
VOIR: horaire sur le site de la Faculté des Sciences |
| | partim Ecologie des eaux douces |
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| Les étudiants devront se répartir en 3 groupes et chacun de ces groupes gérera une activité différente chaque jour. Les groupes devront présenter une synthèse des observations réalisées dans le cadre des différentes thématiques.
Les étudiants devront rejoindre la station de Paimpont par leur propre moyen, idéalement en train (voyage aller- retour environ 120 €). Le subside alloué par l'Université couvre pratiquement tous les frais de séjour. Une augmentation des prix du séjour entraînera, le cas échéant, une augmentation du coût du stage. La différence sera réglée sur place. |
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Contacts :
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| | partim Ecologie des sols |
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| Bureau: uniquement sur rendez-vous (contact par email, forum de discussion eCampus, téléphone, ou avant/après cours pour prendre un rendez-vous)
Laboratoire d'Ecologie Végétale et Microbienne, Institut de Botanique, Bât. B22, Boulevard du Rectorat, 27, 4000 Liège, Belgique (Parking 70, 3ème étage)
Prof. Monique Carnol : Tel. 04/3663845 (bureau) ; Tel./fax. 04/3663817 (laboratoire), E-mail : m.carnol@ulg.ac.be
Dr. S. Malchair : Tel. 04/3663866 (bureau) ; E-mail : s.malchair@ulg.ac.be |
| | partim Ecologie des eaux douces |
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| Laboratoire d'écologie animale et d'écotoxicologie, Institut de Chimie, Bât. B6c, Allée du 6 août, 11, 4000 Liège, Belgique.
· Prof. Jean-Pierre Thomé : Tél. 04/366.50.60./62 ; Fax. 04/366.51.47 ; E-mail : JP.Thome@ulg.ac.be
· Dr Célia Joaquim-Justo : Tél. 04/366.51.40 ; Fax 04/366.51.47 ; E-mail : celia.Joaquim-Justo@ulg.ac.be |
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| Notes en ligne : |
partim Ecologie des sols
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partim Ecologie des eaux douces
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| Ces notes sont disponibles sur e-campus |
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