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| BIOC0717-2 | Bioinformatique appliquée
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| Durée : | 20h Th |
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| Nom du professeur : | Bernard Joris |
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Langue(s) du cours :
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| Langue française |
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Organisation et évaluation :
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| Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier |
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Contenus du cours :
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| Le cours comprendra:
- Une introduction pratique aux commandes UNIX, à l'utilisation d'un terminal X et aux transferts de fichiers en utilisant le réseau
- Une utilisation des différents logiciels permettant la comparaison entre deux séquences peptidiques ou nucléotidiques ainsi qu'une description des différentes banques accessibles par le réseau internet. Une attention toute particulière sera donnée à l'analyse statistique du résultat.
- Les programmes présents dans la suite de logiciels EMBOSS (http://emboss.open-bio.org/rel/dev/apps/ ) seront utilisés pour analyser les séquences peptidiques et nucléotidiques.
- Les travaux pratiques associés à ce module permettront aux étudiants d'utiliser les logiciels présentés au cours théorique. |
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Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
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| L'objectif du cours est l'acquisition par les étudiants de la maîtrise des outils bioinformatiques de base pour analyser une séquence peptidique ou nucléotidique. |
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Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :
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| Une bonne connaissance de la biochimie et de la biologie moléculaire |
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Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
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| Alternance entre les cours théoriques et pratiques dans une salle avec des ordinateurs à la dispositions des étudiants. |
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Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
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| Mode d'enseignement présentiel |
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Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
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Modalités d'évaluation et critères :
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| L'examen consistera à la résolution d'un problème pratique et d'une présentation orale à la classe. Les étudiants travaillerons par groupe de deux. |
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Stage(s) :
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Remarques organisationnelles :
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Contacts :
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| Bernard Joris bjoris@ulg.ac.be
Secrétariat :
Julémont Fabienne
fjulemont@ulg.ac.be
04 366 3341 |
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