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| STAT1221-2 | Méthodes statistiques et bioinformatique
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| Durée : | 24h Th, 12h SEM |
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| Nombre de crédits : |
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| Nom du professeur : | Laurence Lins |
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Langue(s) du cours :
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| Langue française |
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Organisation et évaluation :
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| Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier |
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Contenus du cours :
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| -analyse de la composition en acides aminés des protéines
- analyse d'hydrophobicité
- banques de séquences
- recherche d'homologies
- alignement de séquences
- recherche de motifs fonctionnels
- prédiction de structures secondaires
- prédiction de structure tridimensionnelle |
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Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :
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| Montrer à l'étudiant les méthodes utilisées en bioinformatique (analyse de séquences et analyse de structure)
A l'issue du cours, l'étudiant doit être capable de sélectionner la ou les méthodes bioinformatiques adéquates en fonction de l'information demandée |
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Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :
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| Connaissances chimiques de base sur les protéines sont absolument requises: cf nom, structure et propriétés chimiques des acides aminés structures primaires et secondaires des protéines (notion d'angle phi/psi, hélice alpha, structures béta, coils ...) |
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Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
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| deux séances d'apprentissage de manipulation des méthodes en libre accès sur internet seront dispensés |
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Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
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| Cours magistral : 18h
learning sessions: 6 h |
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Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
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- La bioinformatique pour les nuls
- Bioinformatics basics: Applications in biological science and medicine, L. Buehler and H. Rashidi, 2d edition, Taylor and Francis, CRC Press, 2005
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Modalités d'évaluation et critères :
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| Travail personnel (100%) |
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Stage(s) :
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Remarques organisationnelles :
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Contacts :
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| Lins, Laurence (Maître de recherche FNRS)
Centre de Biophysique Moléculaire Numérique
081 62 25 21
l.lins@ulg.ac.be |
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