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Programme des cours 2011-2012Dernière mise à jour : 14/06/2012
GBIO0007-1  Analyse des séquences des gènes et des protéines : partim a

Durée :  10h Th, 10h Pr
Nombre de crédits :  
Master en ingénieur civil biomédical, à finalité approfondie, 2e annéeToute l'année2
Master en bioinformatique et modélisation, à finalité approfondie, 2e annéeToute l'année2
Nom du professeur :  Bernard Joris
Langue(s) du cours :  
Langue française
Contenus du cours :  
Le cours comprendra: - Une introduction aux différents logiciels permettant de la comparaison entre deux séquences peptidiques ou nucléotidiques sera donnée et comprendra une description des différentes banques accessibles par le réseau internet, l'utilisation des différents outils informatiques disponibles (BLAST, et CLUSTAL, ...) et une analyse statistique des résultats obtenus. - Les différentes méthodes pour identifier une phase codante dans une séquence nucléotidique seront présentées. De plus, les différents outils permettant la recherche des " signaux " (RBS, terminateurs, recherche d'un pattern, ... ) présents le long d'une chaîne nucléotidique seront également présentés.
- Les différents logiciels qui permettent de caractériser une séquence peptidique (hydrophobicité, prédiction des structures secondaires, calcul du point isoélectrique théorique, recherche de motifs, ...).
Les travaux pratiques associés à ce module permettront aux étudiants d'utiliser les logiciels présentés au cours théorique.
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :  
Le cours permettra aux étudiants d'acquérir les différents connaissances pour utiliser logiciels disponibles sur Internet et permettant d'analyser une séquence peptidique ou nucléotidique.
Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :  
Les cours de biologie moléculaire et de biochimie générales
Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :  
Présentiel
Modalités d'évaluation et critères :  
Un examen oral devant l'ordinateur
Contacts :  
B. Joris - Tél. : 04/366.29.54 - e-mail : bjoris@ulg.ac.be


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