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Programme des cours 2011-2012Dernière mise à jour : 14/06/2012
BIOL0212-1  Introduction à la microbiologie environnementale

Durée :  30h Th
Nombre de crédits :  
Bachelier en sciences de l'ingénieur, orientation ingénieur civil, 3e annéeToute l'année2
Bachelier en sciences de l'ingénieur, orientation ingénieur civil, 3e annéePremier quadrimestre2
Master en ingénieur civil des mines et géologue, à finalité approfondie, 1re annéePremier quadrimestre2
Master en ingénieur civil des mines et géologue, à finalité spécialisée en gestion, 1re annéePremier quadrimestre2
Nom du professeur :  Monique Carnol
Langue(s) du cours :  
Langue française
Contenus du cours :  
Les micro-organismes sont invisibles à l'oeil nu, et pourtant ce sont des composantes essentielles de tout écosystème. En effet, ils sont présents aussi bien dans l'atmosphère que dans les profondeurs terrestres et ils y exercent des fonctions importantes. Par exemple, ils interviennent dans la consommation et la production d'O2 et de CO2, dans la transformation de nombreuses substances et leur activité peut être utilisée dans des procédés appliqués, comme la bioremédiation. Développé pour des étudiants ayant peu d'acquis dans le domaine de la (micro-)biologie, vous découvrirez dans ce cours le rôle joué par des micro-organismes, les conséquences de leurs actions sur l'environnement et leur utilisation dans quelques exemples pratiques. Une attention particulière est portée à l'importance des principes microbiologiques dans les domaines de l'ingénierie. L'assimilation et l'application des concepts théoriques est favorisée par l'alternance de séances de cours théoriques et d'études de cas dans lesquels vous analyserez des situations concrètes en fonction des notions théoriques vues au cours et étendues par des recherches personnelles guidées. Cette analyse aboutit à une production qui sera évaluée et discutée en classe.
La matière est organisée autour de 3 modules:
  • Module 1: Diversité, nutrition et croissance des microorganismes
  • Module 2: Microbiologie des sols et cycles biogéochimiques
  • Module 3: Microbiologie de la biodégradation et traitement biologique des sols (biorémédiation)
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) du cours :  
I. Acquisition des connaissances de base sur:

  • La diversité, le métabolisme et la croissance microbienne
  • L'environnement physico-chimique du sol
  • L'intervention des microorganismes dans les cycles de carbone, azote et soufre, les conséquences environnementales de leurs activités et l'influence des activités anthropiques
  • L'exploitation des activités microbiennes dans le traitement biologique des sols
II. Transfert des connaissance de base à des situations réelles:

  • Compréhension et utilisation de la terminologie spécifique à la microbiologie de l'environnement
  • Compréhension de l'influence des propriétés physico-chimiques de sol sur la disponibilité en eau, en nutriments, la présence et l'activité des microorganismes
  • Compréhension de l'utilisation des activités microbiennes dans des processus de bioremédiation et appréciation des différents critères conditionnant tour processus de décontamination par voie biologique
  • Mobilisation des connaissances théoriques et celles relatives à l'approche de résolution de cas pour analyser, de façon structurée, une problématique de microbiologie environnementale
  • Evaluation de la pertinence d'une action impliquant les microorganismes pour la gestion de l'environnement
III. Acquisition d'un savoir-être:

  • Découverte de différentes ressources d'information utilies en microbiologie de l'environnement
  • Prise de conscience de la diversité, de la variabilité, de la complexité et de l'importance des processus microbiens dans l'environnement
  • Développement de compétences en travail de groupe, des capacités d'analyse et de synthèse
  • Excercisation de techniques de communication par poster, présentation orale et débat
Prérequis et corequis / Modules de cours optionnels recommandés :  
Des notions de base et approfondies en microbiologie, chimie, biochimie et écologie sont utiles, mais pas indispensables à la compréhension du cours.
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :  
Cours ex-cathedra, études de cas, discussions.
Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :  
Le cours , en présentiel, se donne au deuxième quadrimestre à raison de 2 heures par semaine, le mardi de 10h30 à 12h30. Les exposés magistraux (support power point) sont ancrés par l'analyse d'un cas centré autour de problématiques réelles nécessitant l'intégration et l'application des connaissances de microbiologie de l'environnement. Suite à l'analyse du cas (en utilisant les ressources du cours) une tâche doit être accomplie par groupe ou individuellement.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :  
Des notes de cours ainsi que les illustrations du cours théorique (fichier pdf des présentations power point) sont mises à la disposition des étudiants au cours de l'année (plateforme eCampus ou Penelope). La compréhension des concepts est basée sur les explications données au cours auquel il est recommandé d'assister. Pour des informations complémentaires, des ouvrages de référence sont disponibles dans le Laboratoire d'Ecologie Végétale et Microbienne.
Modalités d'évaluation et critères :  
Examen oral et écrit; travaux d'étudiants pendant l'année.
Contacts :  
Prof. Monique CARNOL
Bureau: uniquement sur rendez-vous: Laboratoire d'Ecologie Végétale et Microbienne, Institut de Botanique B22, Boulevard du Rectorat 27, 4000 Liège, Belgique (Parking P70, 3ème étage)
Tel. 04 3663845 (bureau)
Tel./Fax. 04/3663817 (laboratoire)
e-mail: m.carnol@ulg.ac.be


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