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Programme des cours 2010-2011Dernière mise à jour : 11/04/2011
BACT0001-1  Bactériologie marine
Durée :  15h Th, 30h Pr
Crédits/ECTS :  
Master en océanographie, à finalité approfondie, 2e annéeToute l'année3
Titulaire(s) :  Mathieu Poulicek
Langue :  Langue française
Aperçu général :  Après avoir brièvement revu les bases de la bactériologie "générale" (structure morphologique et fonctionnement métabolique des bactéries) (3 heures), je décris, selon les données les plus récentes, la biodiversité des microorganismes marins (y-compris la description des techniques)(2 heures). Ensuite, on abordera les spécificités du milieu marin : approches techniques de récolte et de caractérisation des biomasses et des potentiels métaboliques en pleine eau et dans les sédiments, contrôle de la distribution et des activités des bactéries en mer, cycles du carbone, de l'azote, du phosphore et du soufre, description du fonctionnement de la boucle microbienne (8 heures). Le cours se termine par la description de quelques biocénoses bactériennes remarquables essentiellement focalisées sur le phénomène de symbiose : les macroinvertébrés des sources hydrothermales (pogonophores et bivalves) et leur microfaune associée, les bactéries symbiontes de la couche de mucus des coraux et le phénomène de blanchiment (2 heures).
Objectif du cours :  Dresser un tableau intégré de l'impact des bactéries dans le fonctionnement océanique.
Pré-requis :  Les bases de la microbiologie sont (rapidement) revues au début du cours.
Travaux pratiques :  Approches techniques de mesures de la biomasse (épifluorescence UV et dosages d'ATP au compteur de photons), mesures des constantes de croissance et évaluation des activités métaboliques sur des populations bactériennes mixtes (masse filtrante de l'aquarium Dubuisson) (20 heures)
Initiation à l'utilisation de logiciels de calculs et de simulation en microbiologie (10 heures)
Organisation :  Cinq fois 3 heures de cours à placer dans l'horaire et 5 journées de TP.
Notes de cours :  Syllabus distribué au début du cours
Ouvrage de référence : "Microbial Ecology of the oceans", D.L. Kirchman, Ed. Wiley-Liss Inc.
Evaluation :  Examen oral à livre ouvert (deux questions), après préparation.
Contacts :  Mathieu Poulicek - Tél 04 366 50 67 - Email: mpoulicek@ulg.ac.be


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