Administration de l'Enseignement et des Etudiants

Sciences

Faculté des Sciences
2006-2007

Diplôme d'études approfondies interuniversitaire
en Bioinformatique

RENSEIGNEMENTS

Université de Liège

M. G. DIVE
Institut de Chimie, Bât. B6
Allée de la chimie, 3 - 4000 Liège (Sart Tilman)
Tél. : 04/366.34.99
Courriel : gdive@ulg.ac.be

Université Libre de Bruxelles

M. J. VAN HELDEN
Service de Conformation des Macromolécules Biologiques et de Bioinformatique
Campus de la Plaine - CP263, boulevard du Triomphe, 1050 Bruxelles
Tél. : 02/650.20.76 - fax : 02/250.54.25
Courriel : Jacques.Van.Helden@ulb.ac.be

Facultés Universitaires Notre-Dame de la Paix

M. E. DEPIEREUX
Laboratoire de Biologie Moléculaire Structurale
Rue de Bruxelles, 61, 5000 Namur
Tél. : 081/72.44.15 - fax : 081/72.42.97
Courriel : eric.depiereux@fundp.ac.be

PRESENTATION

Le D.E.A. interuniversitaire en bioinformatique est une formation pluridisciplinaire, et touche aussi bien aux aspects biologiques, informatiques et statistiques qui constituent les fondements de la recherche en bioinformatique.

CONDITIONS D'ACCES

Sous réserve de l'application de l'article 13 du décret du 5 septembre 1994, nul n'est admis à l'examen pour l'obtention du D.E.A. interuniversitaire en bioinformatique, s'il n'a obtenu, depuis un an au moins, le diplôme de licencié ou maître en sciences mathématiques, physiques, chimiques, biochimiques, biologiques, en informatique, en sciences biomédicales, d'ingénieur civil chimiste, physicien ou informaticien, de bio-ingénieur, d'ingénieur chimiste et des bio-industries, de pharmacien, de docteur en médecine, en médecine vétérinaire et/ou s'il n'est titulaire d'un titre étranger délivré à la suite d'études comparables.

Informations : http://www.ulg.ac.be/condadm

DUREE DE LA FORMATION

Une année d'études, éventuellement fractionnable.

PROGRAMME

Le programme du D.E.A. s'adresse particulièrement aux étudiants se destinant à préparer une thèse en bioinformatique: il comprend un programme de cours et un mémoire destiné à acquérir une méthode de recherche particulière en vue de ce doctorat.

Le D.E.A. comporte 60 ECTS dont 23 correspondent à un mémoire réalisé sous la responsabilité d'un membre du collège des enseignants (promoteur) dans un laboratoire d'une université, d'un institut de recherche, en Belgique ou à l'étranger.

Les diplômés pour lesquels le comité de gestion estime que les prérequis nécessaires ne sont pas garantis devront suivre une formation complémentaire pouvant atteindre 10 ECTS, sélectionnés parmi les cours de premier ou deuxième cycle des institutions partenaires.

Chacun des cours proposés ci-dessous combinera l'apprentissage d'une base théorique robuste avec une mise en pratique sur la base d'exemples concrets et relevant directement de la recherche en bioinformatique.


Prérequis : cours de 2e cycle

  • Bases de données - Coordinateur : J. RICHELLE
  • Biologie et biochimie - Coordinateur : B. ANDRE
  • Biophysique - Coordinateur : Mme M. ROOMAN
  • Mathématique - Coordinateur : Mme M. KAUFMAN
  • Statistiques - Coordinateur : J. VAN HELDEN

Cours obligatoires (33 ECTS)

  • Bases de la programmation - 2 ECTS - Coordinateur : M. COLET
  • Statistics applied to bioinformatics - 3 ECTS - Coordinateur : J. VAN HELDEN, co-titulaire : E. DEPIEREUX
  • Algorithmics applied to bioinformatics - 4 ECTS - Coordinateur : J. CARDINAL, co-titulaire :
    S. LANGERMAN
  • Data analysis and modeling methods - 3 ECTS - Coordinateur : G. BONTEMPI
  • Biological databases - 2 ECTS - Coordinateur : J. RICHELLE, co-titulaires : Y. DEVILLE, A. RENARD
  • Nucleotidic and peptidic sequence analysis - 3 ECTS - Coordinateur : E. DEPIEREUX, co-titulaires :
    B. DAMIEN, C. LAMBERT
  • Prediction of protein structure and function - 4 ECTS - Coordinateur : Mme M. ROOMAN, co-titulaires :
    Mme M. PREVOST, R. LEPLAE
  • Phylogeny inference - 2 ECTS - Coordinateur : M. MILINKOVITCH - co-titulaires : B. JORIS,
    Mlle A. WILMOTTE
  • Genomics & proteomics - 3 ECTS - Coordinateur : J. VAN HELDEN, co titulaires : B. ANDRE, X. DE BOLLE,
    F. GAUTIER
  • Applications of data analysis to genomic and proteomic data - 3 ECTS - Coordinateurs : R. LEPLAE,
    Mme M. PREVOST
  • Modelling of cellular processes - 4 ECTS - Coordinateur : Mme M. KAUFMAN, co-titulaire :
    A. GOLDBETER

Cours à option (4 ECTS)

Les étudiants devront choisir parmi les cours suivants pour un total de 4 ECTS :

  • Rational drug design - 1 ECTS - Coordinateur : Mme M. PREVOST
  • Analyse des séquences régulatrices - 1 ECTS - Coordinateur : J. VAN HELDEN
  • Chronobiologie - 1 ECTS - Coordinateur : A. GOLDBETER
  • In silico protein folding - 1 ECTS - Coordinateurs : D. GILIS, Mme M. ROOMAN
  • Complément de programmation pour la Bioinformatique - 1 ECTS -Coordinateur : R. LEPLAE
  • Transcriptional regulation : structural aspects of protein-DNA interactions - 1 ECTS - Coordinateur :
    Mme M. ROOMAN
  • Caractérisation de la structure et dynamique de macromolécules biologiques par RMN - 1 ECTS -
    Coordinateurs : Mme K. BARTIK, M. LUHMER

Mémoire (23 ECTS)


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Juillet 2006
Responsable de l'information : Monique Marcourt
Réalisation : Frédéric Geraerds (SEGI) - AEE